Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VS80

Protein Details
Accession A0A4Q4VS80    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-127LLPRKKVVKRAPPRGVNKRRRALDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-124KLRLRSSKKNADGELLPRKKVVKRAPPRGVNKRRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MLMPSALSCDSSHHPPVTRLQSSLFASPPSSPPASAQSTIGNIFNSCRALQSILTTTTAADDSSRGPSSLPTPPLSHAALPAPAPAAPMKLRLRSSKKNADGELLPRKKVVKRAPPRGVNKRRRALDDDMGRDDSSSDGECEEELPSTPKRARIAPEVLPLGLERSDFHGLQEGNSQESGNSEGTDVEVETDDTEWSKEDDQVLVELVLEKLKLSKSDWEEIGKSFGNIGNRKDRSSCGRRWKTLMANGDIGLKTRSRRGKIHGTWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.43
4 0.48
5 0.46
6 0.41
7 0.38
8 0.41
9 0.41
10 0.41
11 0.34
12 0.26
13 0.25
14 0.26
15 0.26
16 0.25
17 0.24
18 0.21
19 0.21
20 0.26
21 0.29
22 0.28
23 0.27
24 0.24
25 0.25
26 0.26
27 0.25
28 0.2
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.19
40 0.18
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.16
45 0.15
46 0.12
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.14
55 0.17
56 0.22
57 0.24
58 0.22
59 0.23
60 0.24
61 0.28
62 0.28
63 0.24
64 0.2
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.17
76 0.19
77 0.24
78 0.27
79 0.35
80 0.42
81 0.49
82 0.57
83 0.59
84 0.63
85 0.63
86 0.61
87 0.55
88 0.49
89 0.47
90 0.5
91 0.42
92 0.36
93 0.32
94 0.35
95 0.34
96 0.41
97 0.43
98 0.43
99 0.5
100 0.61
101 0.68
102 0.73
103 0.79
104 0.82
105 0.84
106 0.84
107 0.83
108 0.8
109 0.75
110 0.7
111 0.67
112 0.61
113 0.58
114 0.54
115 0.47
116 0.42
117 0.4
118 0.35
119 0.29
120 0.24
121 0.17
122 0.11
123 0.09
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.08
133 0.09
134 0.12
135 0.14
136 0.16
137 0.18
138 0.21
139 0.24
140 0.27
141 0.31
142 0.3
143 0.33
144 0.31
145 0.28
146 0.26
147 0.22
148 0.18
149 0.13
150 0.1
151 0.07
152 0.1
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.21
160 0.17
161 0.15
162 0.16
163 0.16
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.2
203 0.24
204 0.3
205 0.32
206 0.34
207 0.35
208 0.34
209 0.36
210 0.29
211 0.24
212 0.2
213 0.2
214 0.24
215 0.27
216 0.31
217 0.37
218 0.39
219 0.42
220 0.42
221 0.45
222 0.47
223 0.51
224 0.55
225 0.56
226 0.64
227 0.67
228 0.7
229 0.73
230 0.71
231 0.71
232 0.69
233 0.62
234 0.55
235 0.5
236 0.49
237 0.41
238 0.35
239 0.29
240 0.25
241 0.23
242 0.29
243 0.38
244 0.38
245 0.44
246 0.51
247 0.6