Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XHW8

Protein Details
Accession A0A4V1XHW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
232-258AGRARNLRAPTKKRRRRTRASTRAAGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-251RARNLRAPTKKRRRRTRA
357-360RRRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MAAKRGPSPELVPSPFIKKRNLEWSIELPAAATRASSEATSSSSSDDQHGAADSRAEEEERPSAAAVEAGEGHVDDHLGYFSRILTKATLSPFPSGIPHLSVERYQKLYTANFGSPRGAHFVVHQHDHPIAGTHYDLRLQINETSSTSWAISSLLIWDTGTYTVLPEQGKQAPAVDPDSQPSSSDPEERGPTEQEKLQRAFQARKIRIKLHGSRLPHTYVLNLRLTRDEDVAGRARNLRAPTKKRRRRTRASTRAAGQQPMTSSSDSEAASGPRRDTNGDDDDDDDAETVKAPAEVVAGNRGDGAGISAMEREIRELEDEHVRRTNAYAGAANTIGSVHQRRWYLSLDREACGFAKRRRRGGRTVWEPSSPSAVPRGASSSEAGDDHDGERGEADGGNRLRFPFYVRGVQVERSIVTGRLGADILRDEGVVGYVGRKGWRPVLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.5
4 0.5
5 0.47
6 0.52
7 0.59
8 0.61
9 0.57
10 0.56
11 0.57
12 0.54
13 0.49
14 0.42
15 0.31
16 0.27
17 0.23
18 0.18
19 0.12
20 0.08
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.13
27 0.15
28 0.15
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.18
35 0.17
36 0.18
37 0.16
38 0.15
39 0.16
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.16
46 0.18
47 0.17
48 0.18
49 0.15
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.2
75 0.23
76 0.27
77 0.24
78 0.26
79 0.25
80 0.25
81 0.24
82 0.22
83 0.2
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.18
88 0.21
89 0.25
90 0.27
91 0.29
92 0.27
93 0.28
94 0.3
95 0.29
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.27
100 0.28
101 0.28
102 0.25
103 0.25
104 0.26
105 0.22
106 0.19
107 0.18
108 0.24
109 0.26
110 0.28
111 0.27
112 0.24
113 0.24
114 0.24
115 0.22
116 0.16
117 0.13
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.14
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.06
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.13
155 0.16
156 0.16
157 0.16
158 0.17
159 0.15
160 0.16
161 0.19
162 0.18
163 0.15
164 0.16
165 0.19
166 0.17
167 0.17
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.21
181 0.23
182 0.26
183 0.27
184 0.27
185 0.29
186 0.31
187 0.33
188 0.37
189 0.43
190 0.43
191 0.48
192 0.5
193 0.49
194 0.52
195 0.55
196 0.55
197 0.53
198 0.53
199 0.48
200 0.48
201 0.47
202 0.43
203 0.36
204 0.3
205 0.23
206 0.21
207 0.22
208 0.23
209 0.21
210 0.19
211 0.2
212 0.21
213 0.2
214 0.18
215 0.15
216 0.11
217 0.14
218 0.16
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.17
224 0.19
225 0.24
226 0.31
227 0.39
228 0.5
229 0.59
230 0.68
231 0.75
232 0.83
233 0.86
234 0.87
235 0.89
236 0.9
237 0.89
238 0.88
239 0.83
240 0.75
241 0.74
242 0.65
243 0.56
244 0.45
245 0.36
246 0.29
247 0.26
248 0.24
249 0.16
250 0.14
251 0.13
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.16
258 0.17
259 0.17
260 0.16
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.23
265 0.22
266 0.22
267 0.22
268 0.21
269 0.21
270 0.2
271 0.18
272 0.12
273 0.09
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.12
305 0.21
306 0.22
307 0.24
308 0.27
309 0.27
310 0.26
311 0.26
312 0.28
313 0.2
314 0.21
315 0.2
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.13
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.13
326 0.18
327 0.2
328 0.21
329 0.24
330 0.29
331 0.31
332 0.34
333 0.42
334 0.4
335 0.39
336 0.38
337 0.36
338 0.32
339 0.31
340 0.33
341 0.31
342 0.39
343 0.45
344 0.54
345 0.63
346 0.68
347 0.72
348 0.75
349 0.78
350 0.77
351 0.79
352 0.72
353 0.66
354 0.61
355 0.54
356 0.5
357 0.39
358 0.3
359 0.27
360 0.25
361 0.22
362 0.21
363 0.23
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.14
374 0.16
375 0.15
376 0.13
377 0.13
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.12
382 0.16
383 0.19
384 0.21
385 0.22
386 0.22
387 0.23
388 0.22
389 0.27
390 0.27
391 0.29
392 0.35
393 0.35
394 0.4
395 0.41
396 0.44
397 0.41
398 0.36
399 0.32
400 0.26
401 0.27
402 0.22
403 0.2
404 0.19
405 0.17
406 0.16
407 0.16
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.13
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.08
419 0.08
420 0.1
421 0.12
422 0.15
423 0.18
424 0.21