Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VXL0

Protein Details
Accession A0A4Q4VXL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-274YSGSALPPPRRRKGRCRDYDTKGYCHydrophilic
339-363SMAPSNRRDPKKPKKPFGKSRAPIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-360RRDPKKPKKPFGKSRA
599-621RGRGRGRRPYRGRGGFPPRASRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR002483  PWI_dom  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045137  RBM26/27  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12257  RRM1_RBM26_like  
cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MLFAESDAPHLKAWIVRRLANTSDADADVLADYVLALLRHDDSTENIRQIFNEEIPDFLRDDAVAFTDDVFQALKYKSYLPGAPPAPPLVRQPPPQVPTQLPPRPDAQYQPQAPFVQNTSFPPFGPGASRKRAYNDRDDNDVDIILDDRDAYNPAQPYKQARRGGRDFAPRGGRFDNGFGMRDQRGGPTAYPAPPAATAGHFGQPLPYPSYPRTQNLPQIDHNSIMENIQRLQQLGIPIPPTPELPRPVYSGSALPPPRRRKGRCRDYDTKGYCSRGSRCLYEHGSESVYVPPFGPSPTDEYDPNDASLSFGSFGLPPQPQGMPPLPQGMQPLDMSALSMAPSNRRDPKKPKKPFGKSRAPIAANGPVHDRTKSTIVVQNIPKEHFTEVDLRGFFSQFGNIVEMILQEESNLAIIKFDSWEAANAAWSSPKVIFDNRFVKVFWYKDEVEHGQGLRGKMANGAKNGVGNGDALNNETSEPEFDMDEFLRKQEEAQRLHEEKAQKRQEIEKQRQELEERQKELLARQQEEKRKLQAKLAAKTSAKDPSSSPVDIRTSNTDKKPSTQAEALRAQLAKLEEEANSLGIDPNDVQDDSYPWGMRGRGRGRRPYRGRGGFPPRASRGGYGYRGRGGVESRHAAYAAYSLDLRPKIIAITGADFTVPEKEEVLRQYLFGIGEFKEIHIDPGTTHITFKDRKTAEQFMFGVTAASNNQIPGIDEKLELAWASSAPTAEPTAPGEGPGDGDALMASGLEDAAKEKASVADNHAAADMEDGEVYDGGERDEGDMDYEAPPSHELIQGHPRRMDVNSHIQRAFAPTAGTRGSTNAALRLMQPDVALLLASLIGYQGVSIAAVSDAARYGVKDGRPDDLKRARAGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.35
4 0.4
5 0.44
6 0.45
7 0.46
8 0.43
9 0.37
10 0.35
11 0.3
12 0.26
13 0.21
14 0.19
15 0.14
16 0.12
17 0.09
18 0.06
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.05
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.12
29 0.14
30 0.21
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.28
35 0.27
36 0.3
37 0.31
38 0.25
39 0.26
40 0.23
41 0.23
42 0.24
43 0.26
44 0.23
45 0.19
46 0.18
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.1
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.18
64 0.21
65 0.25
66 0.28
67 0.26
68 0.34
69 0.34
70 0.36
71 0.36
72 0.36
73 0.34
74 0.33
75 0.36
76 0.35
77 0.4
78 0.42
79 0.48
80 0.52
81 0.53
82 0.56
83 0.55
84 0.5
85 0.51
86 0.56
87 0.54
88 0.47
89 0.47
90 0.47
91 0.46
92 0.45
93 0.44
94 0.43
95 0.47
96 0.5
97 0.5
98 0.51
99 0.49
100 0.47
101 0.43
102 0.37
103 0.31
104 0.28
105 0.3
106 0.31
107 0.3
108 0.28
109 0.29
110 0.27
111 0.24
112 0.28
113 0.31
114 0.32
115 0.39
116 0.42
117 0.41
118 0.47
119 0.55
120 0.54
121 0.58
122 0.61
123 0.56
124 0.6
125 0.59
126 0.54
127 0.46
128 0.4
129 0.29
130 0.2
131 0.17
132 0.11
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.13
140 0.17
141 0.19
142 0.21
143 0.24
144 0.33
145 0.41
146 0.49
147 0.52
148 0.55
149 0.62
150 0.65
151 0.68
152 0.66
153 0.66
154 0.6
155 0.59
156 0.63
157 0.55
158 0.54
159 0.49
160 0.44
161 0.35
162 0.35
163 0.34
164 0.26
165 0.27
166 0.23
167 0.26
168 0.24
169 0.24
170 0.23
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.19
175 0.2
176 0.23
177 0.22
178 0.24
179 0.22
180 0.21
181 0.2
182 0.21
183 0.16
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.17
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.19
193 0.22
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.32
198 0.34
199 0.35
200 0.38
201 0.38
202 0.45
203 0.47
204 0.5
205 0.47
206 0.49
207 0.48
208 0.43
209 0.38
210 0.32
211 0.26
212 0.22
213 0.19
214 0.15
215 0.14
216 0.16
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.17
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.21
231 0.23
232 0.25
233 0.27
234 0.28
235 0.29
236 0.29
237 0.26
238 0.23
239 0.21
240 0.25
241 0.27
242 0.3
243 0.38
244 0.45
245 0.53
246 0.61
247 0.66
248 0.69
249 0.77
250 0.81
251 0.83
252 0.84
253 0.84
254 0.82
255 0.85
256 0.79
257 0.74
258 0.67
259 0.6
260 0.53
261 0.5
262 0.46
263 0.43
264 0.42
265 0.37
266 0.35
267 0.39
268 0.39
269 0.35
270 0.34
271 0.27
272 0.25
273 0.23
274 0.22
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.09
284 0.14
285 0.16
286 0.18
287 0.18
288 0.21
289 0.25
290 0.24
291 0.24
292 0.19
293 0.16
294 0.15
295 0.14
296 0.11
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.17
312 0.2
313 0.19
314 0.19
315 0.21
316 0.18
317 0.18
318 0.15
319 0.14
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.1
329 0.12
330 0.18
331 0.26
332 0.3
333 0.38
334 0.47
335 0.58
336 0.66
337 0.74
338 0.78
339 0.81
340 0.87
341 0.9
342 0.89
343 0.89
344 0.81
345 0.78
346 0.76
347 0.66
348 0.57
349 0.49
350 0.46
351 0.35
352 0.33
353 0.28
354 0.23
355 0.23
356 0.22
357 0.2
358 0.15
359 0.17
360 0.18
361 0.18
362 0.19
363 0.2
364 0.26
365 0.28
366 0.31
367 0.3
368 0.31
369 0.28
370 0.25
371 0.24
372 0.18
373 0.17
374 0.18
375 0.17
376 0.2
377 0.19
378 0.19
379 0.19
380 0.18
381 0.17
382 0.11
383 0.1
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.11
420 0.13
421 0.19
422 0.24
423 0.24
424 0.25
425 0.23
426 0.24
427 0.26
428 0.25
429 0.2
430 0.2
431 0.19
432 0.19
433 0.24
434 0.22
435 0.2
436 0.21
437 0.19
438 0.16
439 0.18
440 0.18
441 0.15
442 0.14
443 0.12
444 0.15
445 0.18
446 0.19
447 0.17
448 0.18
449 0.17
450 0.17
451 0.17
452 0.13
453 0.1
454 0.07
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.11
477 0.16
478 0.23
479 0.23
480 0.28
481 0.35
482 0.37
483 0.38
484 0.4
485 0.4
486 0.37
487 0.45
488 0.46
489 0.4
490 0.4
491 0.45
492 0.51
493 0.55
494 0.6
495 0.58
496 0.56
497 0.57
498 0.57
499 0.54
500 0.53
501 0.53
502 0.5
503 0.44
504 0.41
505 0.4
506 0.38
507 0.36
508 0.34
509 0.28
510 0.24
511 0.28
512 0.34
513 0.41
514 0.46
515 0.48
516 0.5
517 0.52
518 0.51
519 0.49
520 0.5
521 0.5
522 0.5
523 0.5
524 0.48
525 0.42
526 0.41
527 0.39
528 0.39
529 0.32
530 0.27
531 0.24
532 0.23
533 0.27
534 0.27
535 0.25
536 0.22
537 0.24
538 0.24
539 0.25
540 0.27
541 0.28
542 0.34
543 0.37
544 0.39
545 0.37
546 0.4
547 0.45
548 0.41
549 0.39
550 0.38
551 0.38
552 0.38
553 0.4
554 0.37
555 0.32
556 0.3
557 0.25
558 0.23
559 0.2
560 0.14
561 0.13
562 0.13
563 0.1
564 0.11
565 0.12
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.08
572 0.06
573 0.07
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.09
579 0.1
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.13
584 0.15
585 0.17
586 0.24
587 0.31
588 0.38
589 0.45
590 0.55
591 0.6
592 0.69
593 0.74
594 0.74
595 0.75
596 0.74
597 0.71
598 0.7
599 0.73
600 0.7
601 0.67
602 0.65
603 0.58
604 0.54
605 0.5
606 0.42
607 0.37
608 0.36
609 0.38
610 0.35
611 0.33
612 0.32
613 0.31
614 0.3
615 0.27
616 0.23
617 0.21
618 0.22
619 0.23
620 0.22
621 0.22
622 0.22
623 0.2
624 0.17
625 0.16
626 0.12
627 0.09
628 0.09
629 0.08
630 0.14
631 0.14
632 0.14
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.12
637 0.14
638 0.1
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.12
646 0.12
647 0.09
648 0.1
649 0.11
650 0.14
651 0.16
652 0.2
653 0.17
654 0.16
655 0.16
656 0.17
657 0.17
658 0.14
659 0.14
660 0.11
661 0.14
662 0.14
663 0.13
664 0.14
665 0.14
666 0.15
667 0.14
668 0.14
669 0.11
670 0.16
671 0.19
672 0.16
673 0.17
674 0.16
675 0.21
676 0.25
677 0.27
678 0.31
679 0.3
680 0.35
681 0.41
682 0.48
683 0.43
684 0.45
685 0.44
686 0.36
687 0.35
688 0.3
689 0.23
690 0.15
691 0.15
692 0.09
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.09
697 0.09
698 0.1
699 0.11
700 0.14
701 0.13
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.14
706 0.12
707 0.1
708 0.08
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.08
713 0.08
714 0.1
715 0.11
716 0.1
717 0.12
718 0.12
719 0.15
720 0.14
721 0.15
722 0.14
723 0.13
724 0.13
725 0.13
726 0.11
727 0.08
728 0.08
729 0.07
730 0.06
731 0.05
732 0.04
733 0.04
734 0.03
735 0.03
736 0.03
737 0.04
738 0.05
739 0.06
740 0.07
741 0.07
742 0.08
743 0.12
744 0.15
745 0.17
746 0.21
747 0.26
748 0.26
749 0.27
750 0.26
751 0.23
752 0.2
753 0.19
754 0.14
755 0.07
756 0.07
757 0.06
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.08
766 0.08
767 0.1
768 0.1
769 0.1
770 0.11
771 0.12
772 0.12
773 0.13
774 0.12
775 0.12
776 0.12
777 0.12
778 0.14
779 0.17
780 0.16
781 0.21
782 0.31
783 0.36
784 0.4
785 0.4
786 0.39
787 0.38
788 0.39
789 0.41
790 0.37
791 0.42
792 0.44
793 0.49
794 0.48
795 0.46
796 0.45
797 0.44
798 0.39
799 0.29
800 0.24
801 0.19
802 0.22
803 0.23
804 0.23
805 0.18
806 0.18
807 0.2
808 0.21
809 0.21
810 0.21
811 0.21
812 0.21
813 0.21
814 0.23
815 0.21
816 0.18
817 0.17
818 0.14
819 0.13
820 0.12
821 0.1
822 0.07
823 0.06
824 0.05
825 0.05
826 0.04
827 0.04
828 0.04
829 0.04
830 0.04
831 0.04
832 0.04
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.04
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.07
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.12
845 0.17
846 0.2
847 0.26
848 0.27
849 0.34
850 0.4
851 0.43
852 0.5
853 0.53
854 0.55