Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4W9H8

Protein Details
Accession A0A4Q4W9H8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-126AKPSSQSKDKSKGKQKQSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-331RRKKRK
455-461PRLKGKY
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPKGKWIDKKTAQHFTLVHRPQNDPRIHDSDAPSMVLNPTTAPNSHKVKKLDDLASELGSDAAAVRANEGEAANYGVYFDDTEYDYMQHLRDLNSSSAGGEVVFVEAKPSSQSKDKSKGKQKQSLDDALRQLDIEDAERKKRQLLDDDILPSKNLTRLTYQAQQDVPDAIGRFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDDDDIFQELAKEGRELDDFEFEEQGDFFDDDDDNDDDGDGWESDDTAKPKREYKTAARGADEEVPTLVPVPGSGSGEEAPAPNQNWLEDFKQFKKDQKVQSSEKKKTPLPPPSNSDLQSSLFTTTTNGGLRRKKRKGALTSQSGYSMTSSSLVRTEQLGILDERFEKLEECHYNPVHEDGEDDFLYGDDDGTASALSGITGITGASTASSVTGPTRADFDSILDDFLGGYSMHGKKQLKKGGWKNGAEQLDDIRRELGPPRLKGKYAGGGGKTKSPAAAAALAFGAPSASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.62
3 0.63
4 0.6
5 0.57
6 0.51
7 0.56
8 0.58
9 0.64
10 0.62
11 0.56
12 0.57
13 0.57
14 0.56
15 0.57
16 0.53
17 0.49
18 0.46
19 0.41
20 0.34
21 0.29
22 0.26
23 0.21
24 0.17
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.19
30 0.25
31 0.33
32 0.39
33 0.45
34 0.46
35 0.49
36 0.55
37 0.6
38 0.57
39 0.51
40 0.5
41 0.45
42 0.42
43 0.37
44 0.29
45 0.21
46 0.15
47 0.13
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.08
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.2
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.17
84 0.16
85 0.14
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.11
97 0.14
98 0.21
99 0.27
100 0.34
101 0.45
102 0.54
103 0.61
104 0.71
105 0.77
106 0.79
107 0.82
108 0.79
109 0.78
110 0.76
111 0.75
112 0.68
113 0.64
114 0.57
115 0.49
116 0.44
117 0.34
118 0.28
119 0.2
120 0.16
121 0.13
122 0.17
123 0.18
124 0.24
125 0.27
126 0.28
127 0.3
128 0.34
129 0.35
130 0.36
131 0.41
132 0.39
133 0.4
134 0.44
135 0.42
136 0.38
137 0.34
138 0.27
139 0.21
140 0.2
141 0.17
142 0.15
143 0.16
144 0.19
145 0.24
146 0.3
147 0.31
148 0.31
149 0.3
150 0.3
151 0.28
152 0.26
153 0.21
154 0.16
155 0.15
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.11
161 0.13
162 0.13
163 0.17
164 0.18
165 0.19
166 0.19
167 0.22
168 0.22
169 0.19
170 0.18
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.09
228 0.12
229 0.16
230 0.17
231 0.23
232 0.26
233 0.29
234 0.33
235 0.38
236 0.45
237 0.48
238 0.49
239 0.44
240 0.42
241 0.4
242 0.4
243 0.32
244 0.22
245 0.15
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.09
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.2
272 0.22
273 0.29
274 0.31
275 0.37
276 0.43
277 0.5
278 0.54
279 0.59
280 0.63
281 0.63
282 0.72
283 0.75
284 0.73
285 0.7
286 0.67
287 0.61
288 0.62
289 0.64
290 0.64
291 0.62
292 0.61
293 0.61
294 0.61
295 0.62
296 0.55
297 0.48
298 0.39
299 0.33
300 0.28
301 0.23
302 0.2
303 0.15
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.13
308 0.14
309 0.16
310 0.21
311 0.29
312 0.38
313 0.48
314 0.54
315 0.59
316 0.64
317 0.7
318 0.73
319 0.75
320 0.75
321 0.73
322 0.68
323 0.62
324 0.56
325 0.47
326 0.38
327 0.28
328 0.2
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.14
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.19
351 0.22
352 0.24
353 0.31
354 0.31
355 0.32
356 0.32
357 0.34
358 0.26
359 0.22
360 0.2
361 0.14
362 0.18
363 0.16
364 0.15
365 0.12
366 0.11
367 0.12
368 0.1
369 0.09
370 0.04
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.14
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.06
411 0.06
412 0.13
413 0.15
414 0.16
415 0.24
416 0.29
417 0.35
418 0.45
419 0.54
420 0.54
421 0.63
422 0.72
423 0.75
424 0.8
425 0.75
426 0.71
427 0.7
428 0.66
429 0.56
430 0.48
431 0.43
432 0.42
433 0.39
434 0.35
435 0.29
436 0.26
437 0.27
438 0.3
439 0.33
440 0.33
441 0.38
442 0.44
443 0.47
444 0.49
445 0.51
446 0.52
447 0.5
448 0.48
449 0.49
450 0.46
451 0.48
452 0.49
453 0.51
454 0.48
455 0.4
456 0.35
457 0.29
458 0.26
459 0.23
460 0.26
461 0.19
462 0.18
463 0.18
464 0.17
465 0.15
466 0.14