FuNGI

A0A4Q4VW46

Protein Details

Accession

A0A4Q4VW46

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-20	MDRSRRRRPTRELLVLNCRA	Hydrophilic
1147-1168	QIDQPQKPYRGLRRRRLLKNSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MDRSRRRRPTRELLVLNCRAWNDEKNVFPVNPSLDSSLKKNTAFIKRLRTAITPATLNTFLQEIRTLSLHKYLSEIVSACYEGLTKLKNPGEIEAAVEIVSALHQRFGPDEFTEYLGWLLGKGMATPDKSLLKTLPPEVREKEEKDRLVRQRALLRVITELWLLGVLRTLDDVKPDDATRGVSGKNAELKIKSTSSSKGGGAEPFPLEVLKDLLGHDREHVNLPLLVIFVKSFSWDILGVKSAGSDGRKTVEEDGVTKSAEDPSDNNGQHIETGSDSDDSSFAGPEIQERFRNIIRRYFDDVKAHILQDQKNIVTQKGRNSEAYVKSGEVFEDRQANFERLVKAQERLVSNAQVIAEAIGAEMPDLKEAGDGLSASNGSIGLVKTGEYLRGQSDGAGIWEDEDERRFYENLVDLKGKVPGMLLEDGKKKKPDTDEQVGKRVDTPEASETPKPSEPADDQSTAIANKTIGAQVDAVLARLPELTNKDAIDEIAVDFCFLNSKASRNRLVKALTEVPKGRTDLLPFWSRLVATLGRYMPDIPKGVVEYLDAEFRSLQRRKDKDFLGQVRLSNIRYLAELTKFGVVPEHVVFHCLKVSLDDFSRMNIEIICNLLENCGRYLLRNADTSPRMATFLETLQRKKSVQHIGQPERMLIENAVYYVDPPERTSIQQKERTPTELFIRKLIYVDLTKRNYTKILKQIRRLHWEEPEVVDILAKVFSRPGKVKYGSIHILAILLSAIYRYHPDFAVMVIDNVIESINFGLEQNDFKFNQRRIAEVKYLGELYNYRMLEHPVIFDTMYKIMTFGHGGAPIPGRLNPFDLPDDYFRIRLIATILETCGMFFNRGAAGKKLDYFLSFLQYYIHTKHPLPMDIDFIVQDTFSLTRPQWKLATNLEEASKAFQLAIAQDQKNAGLDKSADQDDASSDSSSDDEGAEADGDIVLPEAEGDEEESESGEDDEAEIDSQPQSARASESEDEAIVVTRKAEEVDPEDEADFEREYAKMMAESLESRKFDRKPLFDVPLPTRTVALPSDSTFAVAMRTQQQAEREEQQRIKNLVLNYDLRHEKQAYHPNRLDKSGKDRGGQRVRRLQLSDVDWYDKTRQNKGPSEDRSISKAQPVAHMRAEESASLPRGERAQNKCSMASADQQTQIDQPQKPYRGLRRRRLLKNSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.8
3	0.71
4	0.63
5	0.53
6	0.46
7	0.42
8	0.4
9	0.37
10	0.37
11	0.39
12	0.42
13	0.46
14	0.42
15	0.4
16	0.39
17	0.36
18	0.32
19	0.31
20	0.3
21	0.29
22	0.32
23	0.34
24	0.38
25	0.39
26	0.37
27	0.39
28	0.44
29	0.5
30	0.54
31	0.57
32	0.59
33	0.59
34	0.62
35	0.62
36	0.56
37	0.52
38	0.51
39	0.49
40	0.4
41	0.36
42	0.37
43	0.35
44	0.31
45	0.27
46	0.22
47	0.18
48	0.17
49	0.19
50	0.15
51	0.15
52	0.18
53	0.19
54	0.19
55	0.26
56	0.25
57	0.22
58	0.24
59	0.24
60	0.23
61	0.25
62	0.23
63	0.18
64	0.19
65	0.19
66	0.16
67	0.14
68	0.13
69	0.11
70	0.14
71	0.16
72	0.16
73	0.24
74	0.27
75	0.31
76	0.32
77	0.34
78	0.34
79	0.31
80	0.31
81	0.23
82	0.21
83	0.16
84	0.14
85	0.11
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.1
92	0.11
93	0.13
94	0.15
95	0.18
96	0.16
97	0.2
98	0.19
99	0.21
100	0.21
101	0.2
102	0.18
103	0.15
104	0.14
105	0.1
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.08
110	0.11
111	0.15
112	0.16
113	0.17
114	0.21
115	0.24
116	0.25
117	0.27
118	0.26
119	0.28
120	0.31
121	0.36
122	0.39
123	0.37
124	0.43
125	0.45
126	0.5
127	0.52
128	0.53
129	0.56
130	0.57
131	0.61
132	0.6
133	0.66
134	0.67
135	0.7
136	0.68
137	0.65
138	0.64
139	0.62
140	0.61
141	0.54
142	0.46
143	0.39
144	0.36
145	0.31
146	0.23
147	0.18
148	0.13
149	0.12
150	0.1
151	0.08
152	0.09
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.11
157	0.11
158	0.14
159	0.16
160	0.15
161	0.18
162	0.18
163	0.18
164	0.17
165	0.19
166	0.18
167	0.18
168	0.17
169	0.18
170	0.19
171	0.21
172	0.27
173	0.27
174	0.29
175	0.28
176	0.3
177	0.32
178	0.32
179	0.3
180	0.26
181	0.28
182	0.28
183	0.29
184	0.28
185	0.26
186	0.27
187	0.28
188	0.25
189	0.25
190	0.22
191	0.19
192	0.18
193	0.15
194	0.13
195	0.11
196	0.11
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.15
201	0.17
202	0.17
203	0.19
204	0.19
205	0.2
206	0.22
207	0.22
208	0.19
209	0.18
210	0.18
211	0.16
212	0.14
213	0.13
214	0.1
215	0.09
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.11
225	0.13
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.1
230	0.12
231	0.13
232	0.13
233	0.12
234	0.15
235	0.16
236	0.18
237	0.2
238	0.21
239	0.2
240	0.21
241	0.24
242	0.23
243	0.22
244	0.2
245	0.18
246	0.17
247	0.17
248	0.16
249	0.13
250	0.16
251	0.24
252	0.24
253	0.24
254	0.22
255	0.22
256	0.21
257	0.21
258	0.17
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.1
273	0.14
274	0.17
275	0.19
276	0.21
277	0.25
278	0.28
279	0.36
280	0.36
281	0.39
282	0.4
283	0.43
284	0.5
285	0.51
286	0.52
287	0.49
288	0.47
289	0.46
290	0.43
291	0.38
292	0.33
293	0.32
294	0.3
295	0.3
296	0.32
297	0.26
298	0.28
299	0.29
300	0.28
301	0.3
302	0.31
303	0.34
304	0.37
305	0.39
306	0.36
307	0.39
308	0.45
309	0.41
310	0.41
311	0.34
312	0.29
313	0.27
314	0.26
315	0.22
316	0.16
317	0.14
318	0.13
319	0.19
320	0.19
321	0.21
322	0.23
323	0.24
324	0.23
325	0.26
326	0.26
327	0.2
328	0.25
329	0.24
330	0.23
331	0.24
332	0.27
333	0.25
334	0.27
335	0.28
336	0.25
337	0.23
338	0.23
339	0.2
340	0.15
341	0.14
342	0.1
343	0.07
344	0.06
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.03
349	0.05
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.08
372	0.08
373	0.1
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.1
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.09
391	0.09
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.14
396	0.18
397	0.18
398	0.2
399	0.2
400	0.19
401	0.2
402	0.21
403	0.18
404	0.13
405	0.11
406	0.09
407	0.11
408	0.13
409	0.13
410	0.15
411	0.23
412	0.25
413	0.29
414	0.31
415	0.29
416	0.32
417	0.37
418	0.42
419	0.43
420	0.5
421	0.56
422	0.56
423	0.63
424	0.58
425	0.52
426	0.46
427	0.39
428	0.3
429	0.21
430	0.21
431	0.17
432	0.19
433	0.22
434	0.21
435	0.21
436	0.25
437	0.25
438	0.24
439	0.2
440	0.21
441	0.2
442	0.24
443	0.27
444	0.24
445	0.22
446	0.22
447	0.23
448	0.19
449	0.17
450	0.12
451	0.08
452	0.07
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.09
461	0.08
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.07
468	0.09
469	0.1
470	0.12
471	0.12
472	0.12
473	0.12
474	0.12
475	0.1
476	0.08
477	0.07
478	0.06
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.05
483	0.07
484	0.06
485	0.09
486	0.09
487	0.13
488	0.18
489	0.23
490	0.3
491	0.32
492	0.33
493	0.34
494	0.36
495	0.32
496	0.32
497	0.36
498	0.32
499	0.33
500	0.33
501	0.31
502	0.32
503	0.31
504	0.28
505	0.21
506	0.21
507	0.19
508	0.21
509	0.22
510	0.2
511	0.2
512	0.19
513	0.18
514	0.16
515	0.16
516	0.13
517	0.11
518	0.14
519	0.14
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.12
524	0.14
525	0.13
526	0.1
527	0.1
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.09
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.09
539	0.18
540	0.19
541	0.24
542	0.32
543	0.36
544	0.41
545	0.46
546	0.48
547	0.46
548	0.52
549	0.51
550	0.48
551	0.45
552	0.41
553	0.38
554	0.37
555	0.31
556	0.23
557	0.19
558	0.13
559	0.11
560	0.12
561	0.11
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.1
568	0.1
569	0.08
570	0.09
571	0.09
572	0.1
573	0.08
574	0.1
575	0.1
576	0.1
577	0.1
578	0.09
579	0.08
580	0.08
581	0.09
582	0.08
583	0.09
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.12
588	0.11
589	0.1
590	0.09
591	0.09
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.06
596	0.05
597	0.06
598	0.07
599	0.07
600	0.07
601	0.09
602	0.08
603	0.09
604	0.12
605	0.15
606	0.16
607	0.17
608	0.17
609	0.21
610	0.22
611	0.22
612	0.2
613	0.17
614	0.16
615	0.15
616	0.14
617	0.1
618	0.11
619	0.16
620	0.17
621	0.18
622	0.2
623	0.22
624	0.22
625	0.23
626	0.29
627	0.32
628	0.33
629	0.39
630	0.46
631	0.49
632	0.53
633	0.51
634	0.43
635	0.35
636	0.32
637	0.25
638	0.15
639	0.11
640	0.07
641	0.06
642	0.07
643	0.05
644	0.05
645	0.06
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.11
650	0.12
651	0.14
652	0.2
653	0.26
654	0.33
655	0.4
656	0.42
657	0.45
658	0.46
659	0.48
660	0.43
661	0.37
662	0.37
663	0.36
664	0.34
665	0.31
666	0.31
667	0.27
668	0.25
669	0.24
670	0.19
671	0.15
672	0.19
673	0.24
674	0.25
675	0.27
676	0.28
677	0.29
678	0.32
679	0.32
680	0.34
681	0.36
682	0.44
683	0.48
684	0.56
685	0.65
686	0.67
687	0.72
688	0.69
689	0.62
690	0.57
691	0.54
692	0.46
693	0.37
694	0.31
695	0.24
696	0.2
697	0.16
698	0.11
699	0.09
700	0.09
701	0.07
702	0.06
703	0.08
704	0.09
705	0.13
706	0.16
707	0.19
708	0.25
709	0.27
710	0.3
711	0.3
712	0.35
713	0.33
714	0.31
715	0.28
716	0.2
717	0.19
718	0.16
719	0.13
720	0.07
721	0.05
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.05
727	0.06
728	0.08
729	0.08
730	0.09
731	0.09
732	0.09
733	0.12
734	0.1
735	0.1
736	0.08
737	0.08
738	0.07
739	0.07
740	0.06
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.04
747	0.05
748	0.06
749	0.08
750	0.09
751	0.13
752	0.14
753	0.18
754	0.25
755	0.26
756	0.33
757	0.32
758	0.34
759	0.34
760	0.38
761	0.38
762	0.33
763	0.33
764	0.26
765	0.27
766	0.23
767	0.2
768	0.16
769	0.15
770	0.19
771	0.18
772	0.17
773	0.17
774	0.19
775	0.2
776	0.2
777	0.18
778	0.13
779	0.14
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.11
784	0.11
785	0.1
786	0.09
787	0.08
788	0.09
789	0.09
790	0.08
791	0.09
792	0.09
793	0.09
794	0.11
795	0.12
796	0.12
797	0.12
798	0.13
799	0.14
800	0.14
801	0.17
802	0.16
803	0.17
804	0.18
805	0.19
806	0.2
807	0.2
808	0.24
809	0.22
810	0.21
811	0.19
812	0.18
813	0.16
814	0.14
815	0.13
816	0.09
817	0.1
818	0.1
819	0.1
820	0.1
821	0.1
822	0.09
823	0.1
824	0.09
825	0.08
826	0.08
827	0.09
828	0.1
829	0.14
830	0.16
831	0.16
832	0.19
833	0.2
834	0.21
835	0.21
836	0.2
837	0.18
838	0.18
839	0.17
840	0.19
841	0.17
842	0.16
843	0.16
844	0.17
845	0.19
846	0.19
847	0.23
848	0.21
849	0.22
850	0.26
851	0.28
852	0.29
853	0.29
854	0.27
855	0.26
856	0.24
857	0.24
858	0.19
859	0.16
860	0.13
861	0.1
862	0.09
863	0.07
864	0.07
865	0.08
866	0.11
867	0.1
868	0.19
869	0.21
870	0.25
871	0.27
872	0.28
873	0.32
874	0.34
875	0.39
876	0.33
877	0.33
878	0.3
879	0.28
880	0.26
881	0.25
882	0.19
883	0.14
884	0.12
885	0.1
886	0.1
887	0.1
888	0.16
889	0.21
890	0.21
891	0.22
892	0.23
893	0.22
894	0.23
895	0.23
896	0.17
897	0.12
898	0.13
899	0.14
900	0.17
901	0.18
902	0.16
903	0.15
904	0.15
905	0.14
906	0.16
907	0.16
908	0.12
909	0.11
910	0.11
911	0.11
912	0.11
913	0.1
914	0.08
915	0.06
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.04
924	0.04
925	0.04
926	0.03
927	0.03
928	0.03
929	0.03
930	0.04
931	0.05
932	0.05
933	0.06
934	0.06
935	0.06
936	0.06
937	0.07
938	0.07
939	0.06
940	0.05
941	0.05
942	0.06
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.07
947	0.07
948	0.08
949	0.08
950	0.09
951	0.1
952	0.11
953	0.13
954	0.13
955	0.18
956	0.18
957	0.2
958	0.19
959	0.18
960	0.17
961	0.15
962	0.16
963	0.11
964	0.11
965	0.09
966	0.08
967	0.09
968	0.1
969	0.1
970	0.12
971	0.16
972	0.18
973	0.19
974	0.2
975	0.2
976	0.18
977	0.19
978	0.17
979	0.13
980	0.11
981	0.11
982	0.09
983	0.11
984	0.12
985	0.11
986	0.1
987	0.1
988	0.11
989	0.11
990	0.14
991	0.17
992	0.22
993	0.23
994	0.26
995	0.33
996	0.34
997	0.41
998	0.48
999	0.47
1000	0.49
1001	0.55
1002	0.59
1003	0.55
1004	0.6
1005	0.57
1006	0.54
1007	0.51
1008	0.44
1009	0.38
1010	0.31
1011	0.3
1012	0.25
1013	0.23
1014	0.19
1015	0.19
1016	0.21
1017	0.19
1018	0.2
1019	0.17
1020	0.16
1021	0.14
1022	0.12
1023	0.14
1024	0.16
1025	0.2
1026	0.2
1027	0.23
1028	0.28
1029	0.29
1030	0.33
1031	0.38
1032	0.38
1033	0.44
1034	0.48
1035	0.51
1036	0.55
1037	0.54
1038	0.51
1039	0.48
1040	0.45
1041	0.41
1042	0.4
1043	0.39
1044	0.32
1045	0.37
1046	0.4
1047	0.36
1048	0.4
1049	0.37
1050	0.35
1051	0.41
1052	0.5
1053	0.48
1054	0.53
1055	0.57
1056	0.6
1057	0.63
1058	0.66
1059	0.62
1060	0.58
1061	0.61
1062	0.61
1063	0.6
1064	0.57
1065	0.6
1066	0.64
1067	0.7
1068	0.71
1069	0.72
1070	0.72
1071	0.72
1072	0.73
1073	0.69
1074	0.62
1075	0.58
1076	0.54
1077	0.52
1078	0.44
1079	0.44
1080	0.38
1081	0.39
1082	0.42
1083	0.4
1084	0.42
1085	0.44
1086	0.49
1087	0.53
1088	0.61
1089	0.65
1090	0.68
1091	0.68
1092	0.72
1093	0.69
1094	0.65
1095	0.62
1096	0.58
1097	0.53
1098	0.48
1099	0.46
1100	0.38
1101	0.41
1102	0.44
1103	0.44
1104	0.43
1105	0.42
1106	0.37
1107	0.37
1108	0.37
1109	0.29
1110	0.25
1111	0.25
1112	0.23
1113	0.23
1114	0.22
1115	0.21
1116	0.25
1117	0.31
1118	0.38
1119	0.4
1120	0.45
1121	0.51
1122	0.54
1123	0.52
1124	0.49
1125	0.46
1126	0.4
1127	0.41
1128	0.4
1129	0.38
1130	0.4
1131	0.39
1132	0.39
1133	0.37
1134	0.41
1135	0.4
1136	0.37
1137	0.41
1138	0.46
1139	0.49
1140	0.54
1141	0.61
1142	0.66
1143	0.69
1144	0.76
1145	0.78
1146	0.8
1147	0.86
1148	0.9

A0A4Q4VW46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer