Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VJK6

Protein Details
Accession A0A4Q4VJK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-39SKAASKKAPKNPLLEKRPRNFGIHydrophilic
240-262IMGAKANKRIEKKKRALEMAIKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-35KSGKKAAPAPFGSSKAASKKAPKNPLLEKRPR
105-125KAEKKERLLKEATAVKEGKKK
243-255AKANKRIEKKKRA
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029064  L30e-like  
IPR001921  Ribosomal_L7A/L8  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MPPKSGKKAAPAPFGSSKAASKKAPKNPLLEKRPRNFGIGQDIQPRRNLTRMVKWPEYVRLQRQRKIINMRLKVPPAIAQFQHVLDRNTAAQAFKLLNKYRPETKAEKKERLLKEATAVKEGKKKEDVSKKPYTVKYGLNHVVGLIENKKASLVLIPNDVDPIELVIFLPALCRKMGVPYAVVKGKARLGTVVHKKTAAVLAITEVRSEDKNELSKLVSAIKDGYMPGTENARRQWGGGIMGAKANKRIEKKKRALEMAIKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.53
3 0.46
4 0.43
5 0.41
6 0.44
7 0.42
8 0.47
9 0.54
10 0.6
11 0.68
12 0.67
13 0.69
14 0.74
15 0.79
16 0.8
17 0.81
18 0.81
19 0.77
20 0.81
21 0.75
22 0.69
23 0.6
24 0.54
25 0.54
26 0.49
27 0.47
28 0.48
29 0.5
30 0.48
31 0.49
32 0.49
33 0.42
34 0.4
35 0.42
36 0.39
37 0.44
38 0.52
39 0.56
40 0.55
41 0.56
42 0.54
43 0.55
44 0.57
45 0.54
46 0.54
47 0.57
48 0.61
49 0.64
50 0.68
51 0.67
52 0.66
53 0.69
54 0.68
55 0.67
56 0.64
57 0.64
58 0.62
59 0.59
60 0.52
61 0.43
62 0.4
63 0.33
64 0.32
65 0.27
66 0.24
67 0.23
68 0.23
69 0.27
70 0.24
71 0.21
72 0.18
73 0.19
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.12
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.2
83 0.21
84 0.26
85 0.29
86 0.33
87 0.38
88 0.4
89 0.43
90 0.44
91 0.51
92 0.55
93 0.6
94 0.63
95 0.61
96 0.68
97 0.64
98 0.61
99 0.54
100 0.44
101 0.42
102 0.4
103 0.36
104 0.31
105 0.3
106 0.27
107 0.31
108 0.31
109 0.29
110 0.27
111 0.29
112 0.33
113 0.43
114 0.47
115 0.49
116 0.56
117 0.56
118 0.59
119 0.58
120 0.54
121 0.47
122 0.46
123 0.4
124 0.39
125 0.38
126 0.32
127 0.3
128 0.25
129 0.22
130 0.16
131 0.16
132 0.11
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.1
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.21
168 0.23
169 0.24
170 0.21
171 0.21
172 0.24
173 0.23
174 0.21
175 0.18
176 0.19
177 0.27
178 0.36
179 0.38
180 0.36
181 0.35
182 0.34
183 0.34
184 0.34
185 0.25
186 0.16
187 0.12
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.23
202 0.23
203 0.23
204 0.25
205 0.21
206 0.18
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.2
216 0.22
217 0.25
218 0.27
219 0.32
220 0.31
221 0.3
222 0.32
223 0.27
224 0.26
225 0.25
226 0.24
227 0.19
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.25
232 0.29
233 0.33
234 0.4
235 0.5
236 0.57
237 0.66
238 0.74
239 0.79
240 0.83
241 0.83
242 0.82