FuNGI

A0A4V1XDM3

Protein Details

Accession

A0A4V1XDM3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
508-530	TSKSKTPSSKHSKPSSLKKETPI	Hydrophilic
549-579	TPSKAAPVSKSKDKKDKKSKKDTATQSSATK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
61-91	RKKLDAKMASKKKGSEAKVNGTKPQTQRERK
470-475	KRKSPA
557-569	SKSKDKKDKKSKK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MASSVRDKKAAASSKGTHARAHEQNAAKKEFTEDTSSDEASDETSSSGSDSDDDDDLDAARKKLDAKMASKKKGSEAKVNGTKPQTQRERKPAEPAVKPEPASESESESESESESESESESETSPSTAAGNETAAKPNGTKNLPNANKSESESESEDSSSESEDNDAQAGAKVAVQNQVTAKTQGTNRDGSDSSESSGGEGESKSDSEEEGDKDASGNSTAVATVNGNAEAGSSSQLSRPNWLNNADFTLRKASSDNPGKEVADFFNKTNLEGKQVWYFTAPASLPITVLKEMEIDLAKATAGGPILNHQGDNYGLDLEAYATSTQIQLLIPSKGGDKYNTLNRGIDSTVHLRRMAKFGPEGTISPTASEQYAPPSRAVREQPQGLKARFFPIGVPAPPPNKPTPVVNQPQKAAKQTVAQEDSESSTSDSESGSDGDSDKEMADAPASSVPISSTPSKMPTAPNADSKLKRKSPAKDATPSEQSPKRHKSSKSASEAAMTEVAAPSGTSKSKTPSSKHSKPSSLKKETPIVPPSFHRVASDASAASTSTPSKAAPVSKSKDKKDKKSKKDTATQSSATKVRQTPIPPPAVPGMRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.64
3	0.61
4	0.55
5	0.51
6	0.55
7	0.54
8	0.56
9	0.55
10	0.54
11	0.59
12	0.63
13	0.63
14	0.54
15	0.48
16	0.46
17	0.41
18	0.37
19	0.36
20	0.29
21	0.31
22	0.34
23	0.34
24	0.29
25	0.26
26	0.23
27	0.18
28	0.18
29	0.12
30	0.09
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.09
35	0.08
36	0.08
37	0.09
38	0.11
39	0.12
40	0.12
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.16
45	0.17
46	0.15
47	0.15
48	0.16
49	0.18
50	0.22
51	0.3
52	0.32
53	0.37
54	0.48
55	0.58
56	0.64
57	0.66
58	0.64
59	0.64
60	0.66
61	0.63
62	0.62
63	0.6
64	0.62
65	0.67
66	0.67
67	0.65
68	0.61
69	0.64
70	0.59
71	0.61
72	0.62
73	0.62
74	0.69
75	0.74
76	0.77
77	0.73
78	0.77
79	0.75
80	0.73
81	0.7
82	0.66
83	0.63
84	0.6
85	0.57
86	0.49
87	0.45
88	0.39
89	0.37
90	0.31
91	0.28
92	0.25
93	0.25
94	0.25
95	0.22
96	0.19
97	0.16
98	0.15
99	0.12
100	0.11
101	0.1
102	0.1
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.1
108	0.11
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.1
113	0.09
114	0.08
115	0.09
116	0.08
117	0.09
118	0.11
119	0.12
120	0.15
121	0.16
122	0.16
123	0.16
124	0.19
125	0.25
126	0.26
127	0.27
128	0.3
129	0.4
130	0.44
131	0.46
132	0.45
133	0.42
134	0.42
135	0.41
136	0.4
137	0.31
138	0.3
139	0.29
140	0.27
141	0.25
142	0.22
143	0.2
144	0.16
145	0.15
146	0.12
147	0.1
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.09
161	0.14
162	0.13
163	0.15
164	0.15
165	0.18
166	0.18
167	0.19
168	0.18
169	0.18
170	0.2
171	0.26
172	0.28
173	0.28
174	0.27
175	0.29
176	0.29
177	0.28
178	0.3
179	0.23
180	0.21
181	0.2
182	0.19
183	0.15
184	0.15
185	0.12
186	0.09
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.11
196	0.11
197	0.12
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.11
203	0.09
204	0.08
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.09
223	0.13
224	0.14
225	0.17
226	0.2
227	0.22
228	0.24
229	0.27
230	0.26
231	0.22
232	0.26
233	0.24
234	0.21
235	0.19
236	0.21
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.16
241	0.24
242	0.32
243	0.32
244	0.29
245	0.31
246	0.3
247	0.29
248	0.29
249	0.22
250	0.19
251	0.19
252	0.17
253	0.2
254	0.2
255	0.21
256	0.24
257	0.22
258	0.21
259	0.21
260	0.22
261	0.21
262	0.21
263	0.21
264	0.17
265	0.18
266	0.13
267	0.15
268	0.13
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.11
275	0.08
276	0.09
277	0.07
278	0.06
279	0.07
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.06
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.09
300	0.07
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.04
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.12
322	0.13
323	0.12
324	0.13
325	0.17
326	0.23
327	0.26
328	0.26
329	0.25
330	0.24
331	0.25
332	0.23
333	0.2
334	0.16
335	0.18
336	0.2
337	0.21
338	0.22
339	0.22
340	0.23
341	0.26
342	0.25
343	0.21
344	0.2
345	0.19
346	0.2
347	0.2
348	0.19
349	0.18
350	0.2
351	0.18
352	0.16
353	0.16
354	0.14
355	0.13
356	0.13
357	0.1
358	0.13
359	0.17
360	0.17
361	0.19
362	0.2
363	0.21
364	0.26
365	0.3
366	0.3
367	0.32
368	0.36
369	0.38
370	0.43
371	0.48
372	0.44
373	0.43
374	0.37
375	0.35
376	0.3
377	0.27
378	0.21
379	0.19
380	0.22
381	0.2
382	0.22
383	0.23
384	0.26
385	0.28
386	0.31
387	0.28
388	0.28
389	0.28
390	0.29
391	0.32
392	0.38
393	0.45
394	0.48
395	0.49
396	0.49
397	0.54
398	0.53
399	0.5
400	0.43
401	0.36
402	0.34
403	0.34
404	0.39
405	0.36
406	0.33
407	0.3
408	0.29
409	0.29
410	0.24
411	0.21
412	0.13
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.09
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.07
431	0.06
432	0.07
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.09
438	0.09
439	0.12
440	0.13
441	0.14
442	0.15
443	0.19
444	0.2
445	0.22
446	0.24
447	0.28
448	0.33
449	0.34
450	0.38
451	0.41
452	0.47
453	0.51
454	0.55
455	0.58
456	0.55
457	0.6
458	0.62
459	0.64
460	0.67
461	0.71
462	0.71
463	0.7
464	0.7
465	0.69
466	0.68
467	0.63
468	0.6
469	0.56
470	0.55
471	0.57
472	0.6
473	0.61
474	0.62
475	0.64
476	0.67
477	0.71
478	0.75
479	0.73
480	0.69
481	0.62
482	0.57
483	0.54
484	0.46
485	0.36
486	0.25
487	0.18
488	0.14
489	0.13
490	0.09
491	0.08
492	0.07
493	0.1
494	0.12
495	0.13
496	0.15
497	0.2
498	0.29
499	0.36
500	0.39
501	0.46
502	0.55
503	0.63
504	0.7
505	0.74
506	0.76
507	0.78
508	0.85
509	0.84
510	0.84
511	0.8
512	0.77
513	0.77
514	0.72
515	0.71
516	0.68
517	0.61
518	0.55
519	0.53
520	0.54
521	0.49
522	0.44
523	0.37
524	0.31
525	0.3
526	0.29
527	0.28
528	0.21
529	0.18
530	0.18
531	0.17
532	0.15
533	0.15
534	0.13
535	0.12
536	0.13
537	0.12
538	0.15
539	0.19
540	0.24
541	0.28
542	0.37
543	0.43
544	0.52
545	0.61
546	0.68
547	0.75
548	0.79
549	0.84
550	0.86
551	0.89
552	0.9
553	0.92
554	0.93
555	0.92
556	0.92
557	0.91
558	0.89
559	0.86
560	0.8
561	0.72
562	0.69
563	0.64
564	0.57
565	0.54
566	0.48
567	0.45
568	0.46
569	0.47
570	0.5
571	0.53
572	0.58
573	0.51
574	0.51
575	0.54

A0A4V1XDM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer