FuNGI

A0A4Q4W3I2

Protein Details

Accession

A0A4Q4W3I2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-54	VAPASDRKDKSSKKEQKSKKRHRETTDNTEASERKHKKSKSRVSLGDGDG	Hydrophilic
70-93	ADEVGAYRKKSKKYKKADLAIDEE	Hydrophilic
118-143	QDDVPSKEKKKSKKDKRRNDTQGETA	Basic
158-188	SQEAPSSQPKKKKKEKRKEKKKETVQPEPMD	Basic
446-467	MEADRRRKLKHGGLLRKPFKRL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-28	RKDKSSKKEQKSKKRHRE
37-44	ERKHKKSK
78-84	KKSKKYK
124-135	KEKKKSKKDKRR
166-179	PKKKKKEKRKEKKK
450-466	RRRKLKHGGLLRKPFKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSSPVAPASDRKDKSSKKEQKSKKRHRETTDNTEASERKHKKSKSRVSLGDGDGVAADQPESSAPAPAAADEVGAYRKKSKKYKKADLAIDEESKAEAAEDDVKHKGESRKQLGGGVQDDVPSKEKKKSKKDKRRNDTQGETAAADVDVAQAAVIPDSQEAPSSQPKKKKKEKRKEKKKETVQPEPMDIDPAPSQPTPAVSQAHGGRPDVSFPFFTQTVSQYLPLFPSGMVEPIEGYVEQHLRPLLNRYVPAFRGVLLSYRNPRIGEAPGKGSLTEASQMEDTALLESIDEYAVGFSWLTVEADLFCPKRGSWMEGSLNLQSEGFIGVICFGMFNASIEASRLPSGWKWVDLLSKKGGKQQNGKSAAEAKLPTPEPQDENGEEDDGTDQAHSTGYWVDERGSKVGGKLRFRIKNYEVGSVGDYGYLSIEGTMLDEEAERAKVADEMEADRRRKLKHGGLLRKPFKRLPEFSMTKFGKDDEQEDDILRSNKPKSNRPGTVASE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.7
3	0.73
4	0.74
5	0.83
6	0.87
7	0.88
8	0.92
9	0.95
10	0.95
11	0.95
12	0.94
13	0.93
14	0.93
15	0.91
16	0.9
17	0.89
18	0.79
19	0.69
20	0.66
21	0.59
22	0.53
23	0.54
24	0.5
25	0.47
26	0.55
27	0.61
28	0.65
29	0.75
30	0.81
31	0.81
32	0.84
33	0.83
34	0.8
35	0.81
36	0.72
37	0.66
38	0.55
39	0.44
40	0.34
41	0.27
42	0.2
43	0.12
44	0.1
45	0.04
46	0.05
47	0.05
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.11
54	0.1
55	0.11
56	0.09
57	0.08
58	0.07
59	0.09
60	0.12
61	0.13
62	0.15
63	0.22
64	0.29
65	0.38
66	0.48
67	0.58
68	0.64
69	0.73
70	0.83
71	0.85
72	0.88
73	0.87
74	0.83
75	0.78
76	0.72
77	0.64
78	0.53
79	0.42
80	0.33
81	0.25
82	0.19
83	0.13
84	0.07
85	0.07
86	0.13
87	0.13
88	0.16
89	0.18
90	0.19
91	0.2
92	0.25
93	0.31
94	0.32
95	0.42
96	0.45
97	0.49
98	0.49
99	0.52
100	0.48
101	0.46
102	0.4
103	0.32
104	0.26
105	0.22
106	0.22
107	0.21
108	0.21
109	0.21
110	0.22
111	0.28
112	0.35
113	0.43
114	0.53
115	0.63
116	0.71
117	0.78
118	0.87
119	0.9
120	0.93
121	0.94
122	0.93
123	0.91
124	0.85
125	0.79
126	0.72
127	0.62
128	0.53
129	0.41
130	0.31
131	0.22
132	0.16
133	0.1
134	0.06
135	0.04
136	0.04
137	0.03
138	0.03
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.11
149	0.19
150	0.26
151	0.31
152	0.4
153	0.49
154	0.59
155	0.69
156	0.76
157	0.79
158	0.84
159	0.9
160	0.92
161	0.95
162	0.96
163	0.96
164	0.96
165	0.96
166	0.94
167	0.91
168	0.9
169	0.87
170	0.78
171	0.68
172	0.6
173	0.49
174	0.42
175	0.33
176	0.25
177	0.17
178	0.15
179	0.16
180	0.14
181	0.14
182	0.12
183	0.14
184	0.13
185	0.15
186	0.15
187	0.13
188	0.17
189	0.19
190	0.23
191	0.22
192	0.2
193	0.19
194	0.18
195	0.19
196	0.16
197	0.15
198	0.12
199	0.12
200	0.15
201	0.13
202	0.14
203	0.13
204	0.13
205	0.15
206	0.15
207	0.15
208	0.12
209	0.13
210	0.13
211	0.12
212	0.11
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.09
229	0.08
230	0.09
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.16
235	0.17
236	0.2
237	0.2
238	0.21
239	0.17
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.15
246	0.17
247	0.19
248	0.2
249	0.19
250	0.19
251	0.19
252	0.21
253	0.22
254	0.2
255	0.2
256	0.2
257	0.2
258	0.19
259	0.18
260	0.14
261	0.11
262	0.11
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.05
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.05
290	0.07
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.18
297	0.18
298	0.2
299	0.2
300	0.26
301	0.27
302	0.28
303	0.31
304	0.25
305	0.25
306	0.21
307	0.19
308	0.12
309	0.1
310	0.08
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.03
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.15
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.17
337	0.24
338	0.25
339	0.28
340	0.29
341	0.33
342	0.33
343	0.41
344	0.44
345	0.44
346	0.51
347	0.55
348	0.59
349	0.59
350	0.59
351	0.53
352	0.53
353	0.48
354	0.43
355	0.36
356	0.27
357	0.27
358	0.28
359	0.28
360	0.26
361	0.27
362	0.26
363	0.27
364	0.31
365	0.26
366	0.28
367	0.27
368	0.23
369	0.2
370	0.18
371	0.16
372	0.11
373	0.1
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.15
386	0.17
387	0.18
388	0.18
389	0.17
390	0.2
391	0.26
392	0.31
393	0.32
394	0.37
395	0.45
396	0.51
397	0.54
398	0.59
399	0.56
400	0.58
401	0.56
402	0.55
403	0.46
404	0.4
405	0.38
406	0.3
407	0.27
408	0.19
409	0.16
410	0.1
411	0.09
412	0.08
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.04
417	0.05
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.08
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.1
429	0.1
430	0.12
431	0.12
432	0.16
433	0.25
434	0.32
435	0.33
436	0.37
437	0.41
438	0.42
439	0.46
440	0.51
441	0.51
442	0.52
443	0.62
444	0.67
445	0.73
446	0.81
447	0.84
448	0.82
449	0.79
450	0.75
451	0.73
452	0.72
453	0.67
454	0.63
455	0.65
456	0.64
457	0.62
458	0.68
459	0.6
460	0.53
461	0.49
462	0.43
463	0.39
464	0.36
465	0.35
466	0.3
467	0.32
468	0.31
469	0.31
470	0.31
471	0.3
472	0.29
473	0.28
474	0.29
475	0.32
476	0.36
477	0.42
478	0.5
479	0.55
480	0.63
481	0.68
482	0.68

A0A4Q4W3I2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer