Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XDF6

Protein Details
Accession A0A4V1XDF6    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPVQPTKRRSLRAKLAAREHydrophilic
64-90EKSSSTGKKALKRRRPGKKLKTNLEALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-52KR
62-84RIEKSSSTGKKALKRRRPGKKLK
114-134GKVRHRSLRTRPGALKRKEKI
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPVQPTKRRSLRAKLAAREATGPAPYEPRKAPRPDAAPTTDAFVNSKKDKRLIKHSSFVSRIEKSSSTGKKALKRRRPGKKLKTNLEALADALPDLAERSEGDEAMLRQLREGKVRHRSLRTRPGALKRKEKIVKGEVERFGVSLARLNTVGGAAEAQGMQVEGPGEGAEMSGNGAVEAQTQPHMQAQTQQAQASTSNRWAALRGFISATMEQNPAFIGKQDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.79
4 0.73
5 0.67
6 0.59
7 0.51
8 0.43
9 0.35
10 0.3
11 0.22
12 0.27
13 0.27
14 0.29
15 0.32
16 0.37
17 0.43
18 0.48
19 0.52
20 0.53
21 0.56
22 0.56
23 0.57
24 0.54
25 0.47
26 0.42
27 0.4
28 0.32
29 0.28
30 0.24
31 0.21
32 0.24
33 0.28
34 0.33
35 0.33
36 0.39
37 0.45
38 0.5
39 0.58
40 0.61
41 0.61
42 0.63
43 0.65
44 0.66
45 0.61
46 0.59
47 0.55
48 0.47
49 0.42
50 0.38
51 0.33
52 0.28
53 0.35
54 0.35
55 0.33
56 0.37
57 0.41
58 0.46
59 0.55
60 0.63
61 0.64
62 0.7
63 0.76
64 0.81
65 0.86
66 0.89
67 0.9
68 0.9
69 0.9
70 0.87
71 0.83
72 0.76
73 0.67
74 0.58
75 0.47
76 0.37
77 0.28
78 0.19
79 0.13
80 0.09
81 0.07
82 0.04
83 0.04
84 0.03
85 0.03
86 0.03
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.08
93 0.11
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.15
98 0.16
99 0.19
100 0.21
101 0.24
102 0.32
103 0.38
104 0.43
105 0.46
106 0.52
107 0.55
108 0.64
109 0.61
110 0.58
111 0.58
112 0.63
113 0.66
114 0.66
115 0.67
116 0.59
117 0.65
118 0.64
119 0.61
120 0.58
121 0.54
122 0.54
123 0.5
124 0.55
125 0.47
126 0.44
127 0.41
128 0.34
129 0.28
130 0.22
131 0.16
132 0.13
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.14
172 0.15
173 0.14
174 0.2
175 0.24
176 0.3
177 0.32
178 0.32
179 0.29
180 0.29
181 0.31
182 0.28
183 0.26
184 0.24
185 0.23
186 0.24
187 0.24
188 0.24
189 0.23
190 0.26
191 0.24
192 0.21
193 0.2
194 0.19
195 0.23
196 0.22
197 0.23
198 0.2
199 0.2
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.15
204 0.14