Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4W0J9

Protein Details
Accession A0A4Q4W0J9    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-82HAPQKPPKFKEAKSLKRKREQEDLQKLQNHydrophilic
561-586EFDENGNRKRNKKKKGEVRTKYDRMFBasic
726-753VEDKMRAKERIREKRERRKAREREEMGLBasic
796-845DEVEEERRPRKKAKKWFEADEDDDGEDSGEKKKKKKKKEKGGKKVIEVAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-72QKPPKFKEAKSLKRKR
568-577RKRNKKKKGE
658-676KRREKLLKSKKAMLRFKGK
730-749MRAKERIREKRERRKARERE
802-810RRPRKKAKK
825-839EKKKKKKKKEKGGKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.166, nucl 10.5, cyto 10.5, cyto_mito 9.333, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17941  DEADc_DDX10  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MHLNPKISRKHSEKSSIVYRALIGIAVASPVVSAQQANDRYRMPVAMPSRTNGHAPQKPPKFKEAKSLKRKREQEDLQKLQNAVDEFDLKSNVTKFSELPLTAPTASGLGASHFENLTDIQAKAIPLALKGRDVLAAAKTGSGKTLAFLVPVLEKLYRARFTEYDGLGALILSPTRELAVQIFEVLRKIGRHHSFSAGLVIGGKSLKEEAERLGRMNILVCTPGRILQHFDQTAGLNVDDLQILVLDEADRIMDMGFQSTMDAIVEHLPKTRQTLLFSATQSKKVSDLARLSLNDPEYVDVHEAAETATPSTLSQHYLITPLSDKLNTLYGFIKSNLKSKMIVFLSSGKQVRFAYESLRHLQPGIPLLHLHGRQKQVARLEITSRFTAAKYACLFATDVVARGVDFPAVDWICQVDCPEDVDTYIHRVGRTARYDRDGKAVLFLDPSEEVMLKRLEQRKIPIQKVNVREKKKKSIQDQIQDMCFKDPNLKYLAQKAFVSYVRSIHLQKDKEIFDLGKLDLDAYAASLGLPGTPQIKFQKGEDAKKLKNAPRALLSSDSESEFDENGNRKRNKKKKGEVRTKYDRMFERVNQDVLTSHYTKMVGEDAQAEEDDDDDFLPVKRVLQGDELDAAAQGGQLAPGTKIIEGLGGDEPFVVDSKRREKLLKSKKAMLRFKGKGDKVVFDDEGNAHHPYRIRDEAEFLGEGDAEVQRRAFIEGEAARVRDVDVEDKMRAKERIREKRERRKAREREEMGLPAAEKGPRLGGLEDGEDPLALLASLPVAGGRSGGDEDDDDDDDEVEEERRPRKKAKKWFEADEDDDGEDSGEKKKKKKKKEKGGKKVIEVAGEPDTLEDLEALAAGLLED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.71
3 0.68
4 0.62
5 0.55
6 0.46
7 0.38
8 0.34
9 0.26
10 0.16
11 0.11
12 0.09
13 0.08
14 0.07
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.16
23 0.23
24 0.26
25 0.29
26 0.3
27 0.32
28 0.34
29 0.33
30 0.27
31 0.28
32 0.31
33 0.35
34 0.36
35 0.36
36 0.39
37 0.39
38 0.41
39 0.4
40 0.45
41 0.44
42 0.49
43 0.56
44 0.63
45 0.7
46 0.71
47 0.74
48 0.73
49 0.68
50 0.73
51 0.73
52 0.74
53 0.75
54 0.82
55 0.82
56 0.83
57 0.9
58 0.85
59 0.85
60 0.84
61 0.84
62 0.84
63 0.82
64 0.78
65 0.74
66 0.69
67 0.58
68 0.52
69 0.42
70 0.32
71 0.27
72 0.22
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.17
77 0.2
78 0.2
79 0.21
80 0.21
81 0.21
82 0.2
83 0.23
84 0.29
85 0.26
86 0.25
87 0.23
88 0.25
89 0.23
90 0.23
91 0.18
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.09
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.17
112 0.14
113 0.13
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.18
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.17
122 0.13
123 0.14
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.11
132 0.14
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.21
144 0.24
145 0.25
146 0.29
147 0.27
148 0.33
149 0.4
150 0.36
151 0.31
152 0.27
153 0.25
154 0.2
155 0.19
156 0.14
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.15
176 0.23
177 0.28
178 0.32
179 0.34
180 0.38
181 0.37
182 0.37
183 0.36
184 0.27
185 0.21
186 0.18
187 0.15
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.1
196 0.12
197 0.19
198 0.21
199 0.21
200 0.22
201 0.21
202 0.21
203 0.21
204 0.18
205 0.12
206 0.13
207 0.11
208 0.13
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.21
214 0.22
215 0.3
216 0.28
217 0.28
218 0.26
219 0.25
220 0.26
221 0.21
222 0.18
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.13
255 0.14
256 0.15
257 0.18
258 0.23
259 0.22
260 0.23
261 0.25
262 0.26
263 0.29
264 0.3
265 0.35
266 0.32
267 0.34
268 0.32
269 0.3
270 0.29
271 0.28
272 0.29
273 0.26
274 0.26
275 0.24
276 0.28
277 0.28
278 0.28
279 0.27
280 0.26
281 0.21
282 0.18
283 0.17
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.1
313 0.15
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.23
321 0.19
322 0.25
323 0.25
324 0.25
325 0.25
326 0.24
327 0.3
328 0.25
329 0.24
330 0.2
331 0.22
332 0.23
333 0.27
334 0.28
335 0.2
336 0.23
337 0.22
338 0.23
339 0.2
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.26
344 0.26
345 0.27
346 0.25
347 0.24
348 0.25
349 0.21
350 0.2
351 0.18
352 0.14
353 0.13
354 0.15
355 0.19
356 0.2
357 0.22
358 0.22
359 0.24
360 0.27
361 0.29
362 0.31
363 0.3
364 0.31
365 0.3
366 0.26
367 0.27
368 0.27
369 0.28
370 0.24
371 0.22
372 0.19
373 0.17
374 0.19
375 0.16
376 0.17
377 0.15
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.11
383 0.13
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.05
403 0.05
404 0.07
405 0.08
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.14
416 0.2
417 0.24
418 0.25
419 0.25
420 0.28
421 0.31
422 0.31
423 0.33
424 0.28
425 0.23
426 0.22
427 0.21
428 0.17
429 0.15
430 0.13
431 0.1
432 0.08
433 0.09
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.14
441 0.2
442 0.22
443 0.24
444 0.28
445 0.35
446 0.43
447 0.47
448 0.45
449 0.45
450 0.5
451 0.56
452 0.62
453 0.62
454 0.62
455 0.66
456 0.67
457 0.71
458 0.72
459 0.72
460 0.68
461 0.7
462 0.71
463 0.69
464 0.7
465 0.62
466 0.57
467 0.51
468 0.45
469 0.36
470 0.28
471 0.21
472 0.22
473 0.2
474 0.19
475 0.21
476 0.23
477 0.23
478 0.31
479 0.33
480 0.27
481 0.27
482 0.25
483 0.25
484 0.24
485 0.26
486 0.18
487 0.17
488 0.17
489 0.19
490 0.2
491 0.22
492 0.27
493 0.25
494 0.28
495 0.32
496 0.31
497 0.29
498 0.3
499 0.24
500 0.19
501 0.2
502 0.17
503 0.12
504 0.11
505 0.1
506 0.08
507 0.08
508 0.07
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.03
513 0.04
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.04
518 0.06
519 0.06
520 0.1
521 0.13
522 0.17
523 0.18
524 0.19
525 0.29
526 0.33
527 0.38
528 0.43
529 0.48
530 0.46
531 0.51
532 0.58
533 0.53
534 0.55
535 0.52
536 0.46
537 0.43
538 0.44
539 0.4
540 0.35
541 0.31
542 0.26
543 0.25
544 0.23
545 0.18
546 0.17
547 0.16
548 0.12
549 0.11
550 0.13
551 0.18
552 0.22
553 0.31
554 0.35
555 0.42
556 0.53
557 0.62
558 0.67
559 0.73
560 0.79
561 0.8
562 0.87
563 0.9
564 0.88
565 0.88
566 0.88
567 0.85
568 0.77
569 0.73
570 0.65
571 0.59
572 0.56
573 0.5
574 0.45
575 0.41
576 0.39
577 0.32
578 0.3
579 0.25
580 0.23
581 0.24
582 0.19
583 0.16
584 0.17
585 0.17
586 0.17
587 0.17
588 0.16
589 0.11
590 0.1
591 0.12
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.11
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.06
600 0.05
601 0.05
602 0.06
603 0.06
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.12
608 0.13
609 0.14
610 0.17
611 0.18
612 0.17
613 0.17
614 0.17
615 0.13
616 0.12
617 0.11
618 0.07
619 0.06
620 0.04
621 0.03
622 0.03
623 0.04
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.07
628 0.07
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.1
634 0.11
635 0.1
636 0.1
637 0.09
638 0.09
639 0.08
640 0.09
641 0.07
642 0.08
643 0.14
644 0.21
645 0.26
646 0.29
647 0.32
648 0.39
649 0.5
650 0.58
651 0.63
652 0.62
653 0.67
654 0.7
655 0.77
656 0.78
657 0.74
658 0.74
659 0.67
660 0.7
661 0.7
662 0.66
663 0.64
664 0.59
665 0.55
666 0.48
667 0.49
668 0.41
669 0.31
670 0.32
671 0.25
672 0.24
673 0.23
674 0.21
675 0.16
676 0.18
677 0.2
678 0.21
679 0.27
680 0.3
681 0.3
682 0.28
683 0.32
684 0.32
685 0.31
686 0.28
687 0.22
688 0.17
689 0.15
690 0.13
691 0.11
692 0.11
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.11
699 0.11
700 0.09
701 0.15
702 0.16
703 0.21
704 0.23
705 0.22
706 0.21
707 0.2
708 0.21
709 0.16
710 0.17
711 0.15
712 0.17
713 0.2
714 0.22
715 0.26
716 0.27
717 0.3
718 0.33
719 0.34
720 0.38
721 0.46
722 0.55
723 0.61
724 0.7
725 0.76
726 0.82
727 0.9
728 0.92
729 0.91
730 0.91
731 0.93
732 0.91
733 0.92
734 0.85
735 0.79
736 0.74
737 0.67
738 0.58
739 0.49
740 0.39
741 0.3
742 0.28
743 0.23
744 0.18
745 0.15
746 0.15
747 0.15
748 0.16
749 0.15
750 0.15
751 0.16
752 0.18
753 0.18
754 0.17
755 0.16
756 0.13
757 0.12
758 0.1
759 0.08
760 0.05
761 0.05
762 0.03
763 0.04
764 0.04
765 0.04
766 0.04
767 0.05
768 0.05
769 0.05
770 0.05
771 0.07
772 0.08
773 0.08
774 0.09
775 0.09
776 0.11
777 0.14
778 0.14
779 0.13
780 0.13
781 0.13
782 0.12
783 0.12
784 0.11
785 0.1
786 0.12
787 0.16
788 0.24
789 0.3
790 0.35
791 0.45
792 0.55
793 0.64
794 0.71
795 0.78
796 0.81
797 0.83
798 0.87
799 0.85
800 0.83
801 0.77
802 0.71
803 0.62
804 0.52
805 0.44
806 0.35
807 0.26
808 0.19
809 0.16
810 0.19
811 0.23
812 0.28
813 0.37
814 0.48
815 0.57
816 0.68
817 0.78
818 0.82
819 0.86
820 0.92
821 0.95
822 0.96
823 0.97
824 0.95
825 0.9
826 0.88
827 0.79
828 0.72
829 0.61
830 0.54
831 0.45
832 0.36
833 0.29
834 0.2
835 0.18
836 0.14
837 0.13
838 0.09
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.06
843 0.04