Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4W542

Protein Details
Accession A0A4Q4W542    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-96VEQSEKKGKKRVAKTAKDQSQEKRLRRFRPKPTQDFQVVHydrophilic
483-512PSGKIISNATRKRRRDTERRELKMLKRRYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-88KKGKKRVAKTAKDQSQEKRLRRFRPK
493-509RKRRRDTERRELKMLKR
Subcellular Location(s) mito 10.5, cyto_mito 10, cyto 8.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd09917  F-box_SF  
cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MSTASDPVPALTGIASGASTSRPSRKRILPESFGTTDRPRKANKAPAVADEDKNGDGVEQSEKKGKKRVAKTAKDQSQEKRLRRFRPKPTQDFQVVYDRATSQRFYVLNRSRAGTDDKCPEEIVEMTGSTGNIYHVHISQLPTCTCPHATKGNQCKHMIYVMARVLRARFDLVYQLALLPSELREIFSHAPPIEISGHHSAKEREEEKSRKAIDGDCPICFTPLEGPDDTVYCRAQCGQNMHSECFEMWAATKSTSARVQVTCPMCRAPWQGDDDVVKKLHNRGVIGDEGYVNVAGQLGISGVRGTMIISLCAVFGPEKAMRLHPIPHVIRGKAISTGKHRLKEPYPENMLHTTPAPSLDTLPTEVQCSIFRLLDPVGLISASQTCKSFRGIINPERRHFVERLLALECLEEHGGPSAIFRARDNALQPNWDDEKWESMRWACTGCLRLLPHRHFDNHSLLRLGYRKPVTGSPAAMAPSSWEPSGKIISNATRKRRRDTERRELKMLKRRYAIATTLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.05
4 0.06
5 0.07
6 0.11
7 0.15
8 0.25
9 0.3
10 0.35
11 0.44
12 0.51
13 0.6
14 0.67
15 0.71
16 0.68
17 0.69
18 0.71
19 0.66
20 0.59
21 0.55
22 0.53
23 0.52
24 0.52
25 0.52
26 0.49
27 0.54
28 0.62
29 0.66
30 0.66
31 0.67
32 0.63
33 0.62
34 0.66
35 0.63
36 0.55
37 0.48
38 0.42
39 0.33
40 0.3
41 0.25
42 0.17
43 0.12
44 0.13
45 0.18
46 0.18
47 0.21
48 0.29
49 0.33
50 0.38
51 0.46
52 0.51
53 0.53
54 0.6
55 0.68
56 0.71
57 0.77
58 0.82
59 0.85
60 0.86
61 0.83
62 0.8
63 0.76
64 0.76
65 0.76
66 0.74
67 0.73
68 0.74
69 0.77
70 0.82
71 0.85
72 0.85
73 0.87
74 0.9
75 0.89
76 0.85
77 0.83
78 0.77
79 0.7
80 0.62
81 0.61
82 0.5
83 0.41
84 0.38
85 0.31
86 0.29
87 0.28
88 0.26
89 0.17
90 0.22
91 0.23
92 0.24
93 0.33
94 0.38
95 0.42
96 0.43
97 0.44
98 0.38
99 0.4
100 0.44
101 0.37
102 0.34
103 0.36
104 0.37
105 0.36
106 0.35
107 0.32
108 0.28
109 0.25
110 0.2
111 0.13
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.18
127 0.21
128 0.2
129 0.21
130 0.21
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.23
135 0.27
136 0.32
137 0.4
138 0.49
139 0.55
140 0.58
141 0.58
142 0.56
143 0.48
144 0.45
145 0.38
146 0.29
147 0.27
148 0.24
149 0.25
150 0.24
151 0.23
152 0.22
153 0.2
154 0.2
155 0.16
156 0.12
157 0.1
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.06
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.12
173 0.15
174 0.15
175 0.19
176 0.17
177 0.18
178 0.16
179 0.18
180 0.15
181 0.13
182 0.16
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.22
187 0.22
188 0.23
189 0.3
190 0.27
191 0.25
192 0.33
193 0.36
194 0.37
195 0.44
196 0.43
197 0.37
198 0.37
199 0.36
200 0.32
201 0.37
202 0.35
203 0.27
204 0.28
205 0.27
206 0.26
207 0.23
208 0.18
209 0.12
210 0.13
211 0.16
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.16
217 0.14
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.24
227 0.26
228 0.27
229 0.25
230 0.24
231 0.2
232 0.18
233 0.16
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.21
248 0.24
249 0.23
250 0.22
251 0.21
252 0.19
253 0.21
254 0.22
255 0.19
256 0.19
257 0.21
258 0.21
259 0.22
260 0.24
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.17
265 0.15
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.18
272 0.18
273 0.17
274 0.15
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.06
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.04
302 0.04
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.12
307 0.13
308 0.15
309 0.17
310 0.2
311 0.18
312 0.26
313 0.25
314 0.31
315 0.34
316 0.32
317 0.32
318 0.3
319 0.29
320 0.26
321 0.27
322 0.24
323 0.27
324 0.36
325 0.39
326 0.42
327 0.43
328 0.43
329 0.45
330 0.51
331 0.49
332 0.48
333 0.48
334 0.46
335 0.47
336 0.44
337 0.4
338 0.31
339 0.28
340 0.21
341 0.16
342 0.16
343 0.14
344 0.11
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.15
357 0.14
358 0.13
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.13
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.06
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.15
374 0.17
375 0.22
376 0.2
377 0.29
378 0.35
379 0.43
380 0.53
381 0.58
382 0.58
383 0.58
384 0.58
385 0.53
386 0.47
387 0.42
388 0.38
389 0.32
390 0.33
391 0.29
392 0.27
393 0.22
394 0.22
395 0.18
396 0.13
397 0.12
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.12
405 0.13
406 0.14
407 0.15
408 0.17
409 0.19
410 0.22
411 0.25
412 0.28
413 0.27
414 0.3
415 0.3
416 0.33
417 0.34
418 0.31
419 0.31
420 0.25
421 0.31
422 0.31
423 0.31
424 0.27
425 0.27
426 0.29
427 0.28
428 0.28
429 0.22
430 0.24
431 0.26
432 0.24
433 0.27
434 0.27
435 0.34
436 0.42
437 0.45
438 0.48
439 0.5
440 0.53
441 0.52
442 0.54
443 0.57
444 0.52
445 0.5
446 0.44
447 0.39
448 0.4
449 0.4
450 0.38
451 0.36
452 0.34
453 0.33
454 0.35
455 0.38
456 0.38
457 0.38
458 0.38
459 0.3
460 0.31
461 0.29
462 0.26
463 0.22
464 0.2
465 0.19
466 0.2
467 0.19
468 0.17
469 0.17
470 0.2
471 0.26
472 0.24
473 0.22
474 0.25
475 0.33
476 0.43
477 0.5
478 0.58
479 0.63
480 0.67
481 0.74
482 0.79
483 0.81
484 0.82
485 0.83
486 0.84
487 0.85
488 0.86
489 0.86
490 0.84
491 0.84
492 0.83
493 0.82
494 0.79
495 0.73
496 0.71
497 0.68
498 0.64