Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VSZ8

Protein Details
Accession A0A4Q4VSZ8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-444LAVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGALDVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-10IKKAEK
422-435KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKKIKKAEKSKAAPAAPAADNQAPPTQLMDLVESFLSDQGFNNAHREFQKHRAKNGWKSDGSSKSDNKGHTSLVSVFQAWETFSSKGGATAPKQQAIDRVTKVSSSSSSSSSSSSSDSDSSGDDSSDSDSDGDDVSMADAPAAEAESFDSSDSSSCSSSSSDSDSDSDSESDDEVATPKAKVPAAKALNTTNPLKRKAKSDSEVSSSESDSDEDMSDSSSEDERPRAKKAKTAESSDESSSESSDSDSSSDASSSDDEAAKPKASRKAQATHSSSSSSSSESDSSSSDSNSDSDSEIDTAAVASKVPLPESDSSSSSSDSESDDEDAKPASKDVTVNGTGSDTSATLDKTSPQFQEAPLPPDPVKTNNRGKNGAKTAKTQNKPFSRIRQDMAIDPRLSSNAYVSHSWGDKAHEDLAVTRGKGFTKEKNKKKRGSYKGGALDVHQVRSIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.6
3 0.55
4 0.46
5 0.4
6 0.36
7 0.31
8 0.3
9 0.3
10 0.3
11 0.24
12 0.23
13 0.23
14 0.19
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.14
19 0.15
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.13
28 0.16
29 0.17
30 0.21
31 0.2
32 0.24
33 0.27
34 0.32
35 0.33
36 0.41
37 0.51
38 0.52
39 0.58
40 0.64
41 0.71
42 0.75
43 0.8
44 0.79
45 0.7
46 0.69
47 0.71
48 0.68
49 0.65
50 0.63
51 0.57
52 0.54
53 0.57
54 0.55
55 0.51
56 0.46
57 0.41
58 0.34
59 0.34
60 0.29
61 0.28
62 0.27
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.18
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.17
76 0.2
77 0.19
78 0.29
79 0.32
80 0.34
81 0.35
82 0.35
83 0.38
84 0.37
85 0.41
86 0.34
87 0.33
88 0.29
89 0.29
90 0.29
91 0.25
92 0.23
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.21
100 0.2
101 0.18
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.13
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.15
171 0.23
172 0.26
173 0.28
174 0.28
175 0.27
176 0.29
177 0.31
178 0.33
179 0.29
180 0.3
181 0.35
182 0.38
183 0.37
184 0.41
185 0.44
186 0.48
187 0.47
188 0.48
189 0.45
190 0.45
191 0.44
192 0.4
193 0.34
194 0.26
195 0.23
196 0.17
197 0.14
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.11
211 0.16
212 0.18
213 0.23
214 0.29
215 0.3
216 0.33
217 0.37
218 0.44
219 0.44
220 0.47
221 0.46
222 0.42
223 0.44
224 0.4
225 0.35
226 0.26
227 0.22
228 0.17
229 0.13
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.17
251 0.24
252 0.26
253 0.32
254 0.35
255 0.41
256 0.46
257 0.54
258 0.54
259 0.49
260 0.47
261 0.44
262 0.39
263 0.34
264 0.28
265 0.2
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.14
271 0.12
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.11
297 0.13
298 0.18
299 0.2
300 0.19
301 0.21
302 0.22
303 0.23
304 0.2
305 0.18
306 0.15
307 0.13
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.08
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.13
337 0.16
338 0.2
339 0.21
340 0.22
341 0.23
342 0.23
343 0.32
344 0.32
345 0.34
346 0.32
347 0.35
348 0.32
349 0.34
350 0.36
351 0.33
352 0.36
353 0.39
354 0.47
355 0.51
356 0.57
357 0.61
358 0.62
359 0.64
360 0.68
361 0.68
362 0.61
363 0.61
364 0.65
365 0.68
366 0.72
367 0.7
368 0.7
369 0.7
370 0.74
371 0.75
372 0.74
373 0.74
374 0.72
375 0.67
376 0.64
377 0.58
378 0.58
379 0.58
380 0.54
381 0.45
382 0.4
383 0.39
384 0.33
385 0.31
386 0.24
387 0.19
388 0.16
389 0.19
390 0.19
391 0.2
392 0.23
393 0.24
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.23
398 0.25
399 0.25
400 0.21
401 0.21
402 0.21
403 0.24
404 0.24
405 0.22
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.27
410 0.31
411 0.37
412 0.44
413 0.55
414 0.64
415 0.73
416 0.82
417 0.85
418 0.9
419 0.91
420 0.9
421 0.9
422 0.88
423 0.87
424 0.85
425 0.81
426 0.7
427 0.61
428 0.6
429 0.53
430 0.47
431 0.4
432 0.33
433 0.28