Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4SXT0

Protein Details
Accession A0A4Q4SXT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-141AGGEKKKPSSATKPKPKPKKSEAESSRBasic
443-462LTGLVRKRTKQEQQEQESKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-135EKKKPSSATKPKPKPKKS
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12.333, nucl 10, mito_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MAEPTINDAPVLSAVPSAVASATASGAATPVSLPPLDEEEREKSVKVSLADLTAKASALYLQKNYEEAAEVYAQASEMQAELNGEMDPENADILFLYGRSLFKVGQAKSDVLGTAGGEKKKPSSATKPKPKPKKSEAESSRASAIAGEKAEAEKAVEEGAAEVAEEVGESEMNKAQPSDAKKPLFQFTGDEDFVDSDEEEEAEGEVEEEEEDDLAVAFEILDLARVLFEKRLNAEQEAEGKGKDTANGTDSPTTKHVKERLADTHDLLAEISLENEKYSEAINDGRASLNYKLELYPKESEIVAEAHFKLSLALEFASITTTSEEAAAGGSKQLDQGLRDEAAAELEKAIESTQLKLQNKEVELATMHAPEDNEVTRQQIAEVKDLVADMEQRLVELRKPPMDVDSVLAANDPVSGILGAALGDSSEDAKARVEEAKKNATDLTGLVRKRTKQEQQEQESKPEAEVAPASTETTNGASKRKAEESAEGADDEPKKPKVQEEAAVEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.06
17 0.06
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.11
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.24
26 0.27
27 0.31
28 0.32
29 0.31
30 0.26
31 0.28
32 0.3
33 0.26
34 0.24
35 0.21
36 0.24
37 0.26
38 0.25
39 0.23
40 0.2
41 0.19
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.16
46 0.2
47 0.2
48 0.22
49 0.23
50 0.24
51 0.24
52 0.21
53 0.19
54 0.15
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.11
88 0.11
89 0.16
90 0.24
91 0.24
92 0.27
93 0.3
94 0.29
95 0.28
96 0.29
97 0.23
98 0.16
99 0.16
100 0.1
101 0.13
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.2
106 0.22
107 0.25
108 0.29
109 0.3
110 0.37
111 0.47
112 0.56
113 0.67
114 0.75
115 0.81
116 0.88
117 0.9
118 0.89
119 0.87
120 0.87
121 0.81
122 0.82
123 0.77
124 0.74
125 0.68
126 0.6
127 0.52
128 0.41
129 0.35
130 0.26
131 0.21
132 0.16
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.13
164 0.2
165 0.26
166 0.31
167 0.33
168 0.36
169 0.39
170 0.42
171 0.39
172 0.33
173 0.28
174 0.25
175 0.29
176 0.26
177 0.23
178 0.19
179 0.18
180 0.17
181 0.16
182 0.11
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.03
207 0.02
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.16
223 0.19
224 0.2
225 0.18
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.11
232 0.09
233 0.11
234 0.13
235 0.13
236 0.16
237 0.16
238 0.17
239 0.19
240 0.21
241 0.2
242 0.23
243 0.26
244 0.27
245 0.28
246 0.3
247 0.33
248 0.35
249 0.35
250 0.31
251 0.28
252 0.24
253 0.23
254 0.18
255 0.12
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.18
287 0.17
288 0.15
289 0.15
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.11
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.15
341 0.23
342 0.25
343 0.26
344 0.3
345 0.33
346 0.33
347 0.33
348 0.29
349 0.22
350 0.21
351 0.21
352 0.19
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.19
370 0.17
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.11
375 0.11
376 0.08
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.11
381 0.12
382 0.15
383 0.19
384 0.24
385 0.24
386 0.26
387 0.26
388 0.27
389 0.28
390 0.26
391 0.22
392 0.2
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.13
397 0.1
398 0.09
399 0.07
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.08
417 0.09
418 0.11
419 0.17
420 0.21
421 0.27
422 0.33
423 0.41
424 0.4
425 0.41
426 0.4
427 0.34
428 0.3
429 0.24
430 0.26
431 0.25
432 0.25
433 0.3
434 0.35
435 0.38
436 0.44
437 0.53
438 0.55
439 0.59
440 0.68
441 0.73
442 0.76
443 0.83
444 0.79
445 0.76
446 0.72
447 0.62
448 0.51
449 0.45
450 0.36
451 0.28
452 0.26
453 0.22
454 0.19
455 0.19
456 0.21
457 0.16
458 0.16
459 0.15
460 0.16
461 0.2
462 0.19
463 0.23
464 0.25
465 0.29
466 0.35
467 0.38
468 0.39
469 0.38
470 0.42
471 0.41
472 0.43
473 0.4
474 0.35
475 0.31
476 0.33
477 0.32
478 0.29
479 0.31
480 0.29
481 0.32
482 0.33
483 0.38
484 0.41
485 0.45
486 0.5