Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TNP7

Protein Details
Accession A0A4Q4TNP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-103VVNEPKKWKRHIPTDNLPNGTHydrophilic
169-194SEQDVNLKKEKRKSKKTKDNPYGLTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-11RGRGRARK
176-185KKEKRKSKKT
Subcellular Location(s) mito 23, cyto_mito 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPKRGRGRARKTAVPVRGGWDVLPHGLGAAPTLGTTTEPLTAEQIILTTASGRTQATTSAKTSATASEIISATATTTTSTLAVVNEPKKWKRHIPTDNLPNGTKAETEINEQPEAEPEGGLRRSKRIRTIALNSKTPQETPAEPLSWKRRSKVEAYHTQQEDTRPSQGSEQDVNLKKEKRKSKKTKDNPYGLTPGKTPFPYWTAPTPAQCEEVYKLLANMHDDVQPQAPEVIPAPSLEVAGCGEVPSVLDALLRTLLSGATTFDNADKMIKGLVEKFGILPEGIGRGSIDWNKVRLSPLEDVVDAIRVGGLGNNKAKSIKAILDMVHQETIERRDAYLQERDTGVAAAVIGASVKTKGQKDLEIEKVEKNILSLDHIRDLSVDEAMKEFTKYPGVGVKTSACVILFCLQRPCFAVDTHVDKFSRWLRWVPENATVDDIFSHLEVRCPNHLKYGLHQLFIRHGKTCGKCRRGTVEGTEEWKTLVCPLEHLLDRFDKRQSMAKLKVSKQKQEADNAIKEGAGAVKDEEADGLDGIEGGNATTGEGNMSDVDEDDDGGVAQDADMDPMAMEVDEGVVGHGAESPDSELSAVDGVESGQKDVQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.64
3 0.58
4 0.54
5 0.47
6 0.38
7 0.32
8 0.27
9 0.23
10 0.21
11 0.16
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.12
25 0.12
26 0.13
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.14
31 0.12
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.18
43 0.21
44 0.24
45 0.25
46 0.28
47 0.28
48 0.27
49 0.28
50 0.24
51 0.21
52 0.19
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.12
70 0.19
71 0.21
72 0.27
73 0.35
74 0.4
75 0.45
76 0.51
77 0.57
78 0.59
79 0.67
80 0.71
81 0.73
82 0.78
83 0.82
84 0.83
85 0.78
86 0.69
87 0.6
88 0.51
89 0.42
90 0.32
91 0.24
92 0.21
93 0.18
94 0.22
95 0.26
96 0.28
97 0.27
98 0.27
99 0.25
100 0.23
101 0.24
102 0.19
103 0.14
104 0.11
105 0.16
106 0.19
107 0.23
108 0.22
109 0.28
110 0.35
111 0.4
112 0.48
113 0.49
114 0.53
115 0.58
116 0.66
117 0.68
118 0.66
119 0.67
120 0.6
121 0.59
122 0.54
123 0.46
124 0.38
125 0.32
126 0.28
127 0.27
128 0.3
129 0.26
130 0.25
131 0.32
132 0.39
133 0.44
134 0.45
135 0.43
136 0.46
137 0.48
138 0.54
139 0.56
140 0.56
141 0.58
142 0.62
143 0.67
144 0.62
145 0.59
146 0.55
147 0.48
148 0.44
149 0.36
150 0.34
151 0.27
152 0.26
153 0.28
154 0.29
155 0.3
156 0.26
157 0.26
158 0.31
159 0.35
160 0.37
161 0.4
162 0.44
163 0.45
164 0.52
165 0.6
166 0.62
167 0.68
168 0.76
169 0.81
170 0.86
171 0.91
172 0.94
173 0.93
174 0.92
175 0.84
176 0.78
177 0.75
178 0.65
179 0.56
180 0.46
181 0.38
182 0.33
183 0.29
184 0.25
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.25
190 0.27
191 0.29
192 0.3
193 0.32
194 0.29
195 0.3
196 0.27
197 0.25
198 0.21
199 0.2
200 0.19
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.09
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.15
283 0.17
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.13
291 0.09
292 0.07
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.13
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.16
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.14
322 0.16
323 0.2
324 0.24
325 0.22
326 0.2
327 0.2
328 0.2
329 0.18
330 0.16
331 0.12
332 0.07
333 0.06
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.02
339 0.03
340 0.03
341 0.05
342 0.08
343 0.1
344 0.14
345 0.16
346 0.19
347 0.23
348 0.29
349 0.34
350 0.34
351 0.35
352 0.32
353 0.32
354 0.3
355 0.25
356 0.19
357 0.14
358 0.11
359 0.12
360 0.14
361 0.14
362 0.17
363 0.17
364 0.16
365 0.15
366 0.16
367 0.13
368 0.12
369 0.1
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.16
381 0.18
382 0.17
383 0.19
384 0.19
385 0.17
386 0.18
387 0.17
388 0.12
389 0.1
390 0.11
391 0.15
392 0.15
393 0.16
394 0.22
395 0.22
396 0.23
397 0.25
398 0.26
399 0.21
400 0.2
401 0.21
402 0.19
403 0.25
404 0.26
405 0.28
406 0.26
407 0.24
408 0.29
409 0.31
410 0.32
411 0.28
412 0.31
413 0.32
414 0.39
415 0.44
416 0.42
417 0.45
418 0.42
419 0.4
420 0.39
421 0.34
422 0.27
423 0.22
424 0.19
425 0.11
426 0.09
427 0.1
428 0.07
429 0.11
430 0.13
431 0.16
432 0.23
433 0.27
434 0.28
435 0.32
436 0.37
437 0.35
438 0.37
439 0.45
440 0.4
441 0.37
442 0.38
443 0.33
444 0.36
445 0.4
446 0.38
447 0.28
448 0.29
449 0.36
450 0.41
451 0.5
452 0.52
453 0.54
454 0.55
455 0.59
456 0.64
457 0.6
458 0.58
459 0.54
460 0.5
461 0.46
462 0.47
463 0.44
464 0.36
465 0.32
466 0.28
467 0.22
468 0.18
469 0.18
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.21
474 0.23
475 0.23
476 0.24
477 0.28
478 0.31
479 0.32
480 0.34
481 0.3
482 0.3
483 0.38
484 0.41
485 0.43
486 0.48
487 0.54
488 0.59
489 0.64
490 0.71
491 0.71
492 0.72
493 0.7
494 0.72
495 0.68
496 0.67
497 0.68
498 0.67
499 0.63
500 0.56
501 0.49
502 0.4
503 0.35
504 0.28
505 0.21
506 0.14
507 0.1
508 0.09
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.08
514 0.09
515 0.08
516 0.07
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.04
523 0.05
524 0.04
525 0.05
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.05
554 0.05
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.11
570 0.11
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.09
575 0.07
576 0.06
577 0.07
578 0.11
579 0.12