Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TR61

Protein Details
Accession A0A4Q4TR61    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-321DDNPPPSPPPPKQRQRRTRGTQQAAARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-227RKRAAGASRAGKRKA
303-363PPPKQRQRRTRGTQQAAARGRSSRAATARTAAAAAPKGGSSGSRAGKKKGPASSRAKPATP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.5, cyto 12, nucl 11, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MAGIPVLRFQISGKEGEFFLLEVMPYGSKPLDLKLRGSEGSAVFAAKPNGHCTDAEWEAILTATLVDQKPEHDIEIRAEVQEDGSAVELCVRKNIQGITQRLGAIKLPENPDEEISPFAWCVSAIAARARVEEELAAAAARAGALESSVAELKAQLRELIRAREDDEAQLLEKFRDLLNEKKVKIRQQQRLLAAANVDPAKLARVAAADATARKRAAGASRAGKRKAAGGGDNDDAVDDDDADASVKMEVDSVAGADGGPQLDPEEDEPETTDAEETASSAAAREAETESDNDIDDNPPPSPPPPKQRQRRTRGTQQAAARGRSSRAATARTAAAAAPKGGSSGSRAGKKKGPASSRAKPATPRQQRGGTTDDGDEEDKGEEEPLPRNLPLSKGKKPAAPAPANGSDNDETESDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.23
4 0.22
5 0.15
6 0.13
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.11
14 0.1
15 0.12
16 0.13
17 0.17
18 0.25
19 0.26
20 0.3
21 0.33
22 0.37
23 0.36
24 0.36
25 0.36
26 0.28
27 0.28
28 0.26
29 0.21
30 0.17
31 0.2
32 0.21
33 0.19
34 0.21
35 0.23
36 0.25
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.29
41 0.28
42 0.26
43 0.21
44 0.18
45 0.16
46 0.16
47 0.13
48 0.07
49 0.05
50 0.05
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.17
57 0.18
58 0.19
59 0.17
60 0.19
61 0.2
62 0.25
63 0.25
64 0.21
65 0.21
66 0.19
67 0.16
68 0.15
69 0.12
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.2
81 0.21
82 0.23
83 0.29
84 0.33
85 0.32
86 0.34
87 0.35
88 0.32
89 0.32
90 0.27
91 0.22
92 0.23
93 0.25
94 0.25
95 0.26
96 0.28
97 0.28
98 0.28
99 0.25
100 0.22
101 0.19
102 0.16
103 0.14
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.02
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.16
145 0.19
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.22
150 0.23
151 0.23
152 0.19
153 0.17
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.12
163 0.15
164 0.19
165 0.28
166 0.34
167 0.35
168 0.41
169 0.45
170 0.48
171 0.54
172 0.58
173 0.58
174 0.61
175 0.67
176 0.62
177 0.62
178 0.55
179 0.46
180 0.37
181 0.28
182 0.22
183 0.16
184 0.13
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.09
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.14
204 0.16
205 0.19
206 0.25
207 0.32
208 0.37
209 0.38
210 0.37
211 0.34
212 0.34
213 0.32
214 0.26
215 0.22
216 0.2
217 0.22
218 0.21
219 0.21
220 0.18
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.08
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.14
288 0.21
289 0.27
290 0.35
291 0.44
292 0.54
293 0.65
294 0.75
295 0.83
296 0.85
297 0.89
298 0.88
299 0.88
300 0.89
301 0.85
302 0.81
303 0.75
304 0.75
305 0.69
306 0.63
307 0.54
308 0.45
309 0.4
310 0.37
311 0.34
312 0.3
313 0.29
314 0.3
315 0.29
316 0.3
317 0.29
318 0.25
319 0.23
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.17
331 0.23
332 0.31
333 0.34
334 0.38
335 0.44
336 0.5
337 0.54
338 0.55
339 0.55
340 0.57
341 0.63
342 0.67
343 0.71
344 0.69
345 0.66
346 0.64
347 0.68
348 0.7
349 0.72
350 0.7
351 0.67
352 0.7
353 0.69
354 0.67
355 0.62
356 0.54
357 0.46
358 0.4
359 0.34
360 0.29
361 0.27
362 0.22
363 0.18
364 0.16
365 0.13
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.19
371 0.22
372 0.25
373 0.24
374 0.27
375 0.27
376 0.31
377 0.39
378 0.42
379 0.46
380 0.52
381 0.56
382 0.57
383 0.61
384 0.62
385 0.63
386 0.6
387 0.55
388 0.54
389 0.57
390 0.54
391 0.5
392 0.48
393 0.39
394 0.35
395 0.34
396 0.26
397 0.2