Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TJB9

Protein Details
Accession A0A4Q4TJB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-229KTDEKHSSRRKEDRHSRRHRHRSHSREHRHRKHRRSDSRERDDSRDRRHRHRRSDSRDRSTSMBasic
287-308EEPPRERRRYDRYQEGRRDARDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-295KHSSRRKEDRHSRRHRHRSHSREHRHRKHRRSDSRERDDSRDRRHRHRRSDSRDRSTSMDRYESRRSRHHERSGRERSASPERTRDYARSRRDRSPSPRRSGYNDEHRPNRRRDYSEEPPRERRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MSLLLKKSWHPALMKNQARVYEAEQAEIAERKKTAARLQEIKDERAKEALQADLEKAGGKPRLNRVDWMYEGPSDGQTGTAEELEGFLLGKRRIDNILTRGSERESLKKQAAAGPDVTLAPKLNERDTVAKLREDPLLAIKRKEQEAYEAMVSDPIRRQQLLASMGKTDEKHSSRRKEDRHSRRHRHRSHSREHRHRKHRRSDSRERDDSRDRRHRHRRSDSRDRSTSMDRYESRRSRHHERSGRERSASPERTRDYARSRRDRSPSPRRSGYNDEHRPNRRRDYSEEPPRERRRYDRYQEGRRDARDGKQNDARRNDRYGGDNGGGGSTSGSPGATAVAEERARKLAAMQANASDLDQDRAKRLTALEEKERLEREADEKARERSGKYGDKEFVHGLRRQLIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.62
3 0.61
4 0.58
5 0.57
6 0.51
7 0.45
8 0.43
9 0.37
10 0.32
11 0.28
12 0.26
13 0.27
14 0.29
15 0.26
16 0.19
17 0.19
18 0.2
19 0.24
20 0.29
21 0.33
22 0.37
23 0.45
24 0.5
25 0.54
26 0.62
27 0.62
28 0.62
29 0.62
30 0.55
31 0.48
32 0.44
33 0.41
34 0.35
35 0.32
36 0.3
37 0.26
38 0.25
39 0.24
40 0.2
41 0.2
42 0.17
43 0.16
44 0.19
45 0.21
46 0.23
47 0.28
48 0.37
49 0.46
50 0.47
51 0.51
52 0.5
53 0.52
54 0.51
55 0.48
56 0.41
57 0.32
58 0.31
59 0.28
60 0.23
61 0.17
62 0.15
63 0.12
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.11
76 0.12
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.19
81 0.22
82 0.27
83 0.27
84 0.34
85 0.33
86 0.34
87 0.33
88 0.33
89 0.36
90 0.32
91 0.35
92 0.32
93 0.36
94 0.37
95 0.37
96 0.37
97 0.35
98 0.36
99 0.31
100 0.27
101 0.22
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.15
106 0.12
107 0.1
108 0.13
109 0.14
110 0.15
111 0.16
112 0.19
113 0.22
114 0.26
115 0.31
116 0.29
117 0.29
118 0.29
119 0.29
120 0.28
121 0.24
122 0.21
123 0.22
124 0.29
125 0.29
126 0.29
127 0.31
128 0.33
129 0.34
130 0.35
131 0.28
132 0.25
133 0.25
134 0.26
135 0.23
136 0.19
137 0.17
138 0.19
139 0.18
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.2
148 0.23
149 0.24
150 0.21
151 0.2
152 0.21
153 0.23
154 0.22
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.29
159 0.37
160 0.44
161 0.51
162 0.59
163 0.64
164 0.67
165 0.75
166 0.78
167 0.81
168 0.84
169 0.86
170 0.88
171 0.93
172 0.9
173 0.9
174 0.89
175 0.87
176 0.86
177 0.87
178 0.86
179 0.87
180 0.9
181 0.89
182 0.9
183 0.92
184 0.91
185 0.9
186 0.91
187 0.9
188 0.89
189 0.89
190 0.89
191 0.88
192 0.86
193 0.79
194 0.74
195 0.73
196 0.7
197 0.69
198 0.68
199 0.64
200 0.66
201 0.74
202 0.77
203 0.78
204 0.82
205 0.83
206 0.83
207 0.89
208 0.89
209 0.86
210 0.8
211 0.72
212 0.65
213 0.59
214 0.53
215 0.44
216 0.41
217 0.34
218 0.36
219 0.44
220 0.45
221 0.45
222 0.48
223 0.53
224 0.56
225 0.63
226 0.68
227 0.66
228 0.67
229 0.73
230 0.75
231 0.72
232 0.65
233 0.57
234 0.52
235 0.55
236 0.56
237 0.48
238 0.46
239 0.44
240 0.45
241 0.46
242 0.46
243 0.46
244 0.47
245 0.54
246 0.57
247 0.6
248 0.65
249 0.69
250 0.73
251 0.74
252 0.76
253 0.76
254 0.74
255 0.75
256 0.7
257 0.7
258 0.69
259 0.67
260 0.67
261 0.67
262 0.65
263 0.67
264 0.73
265 0.74
266 0.73
267 0.73
268 0.7
269 0.65
270 0.65
271 0.66
272 0.67
273 0.71
274 0.73
275 0.71
276 0.74
277 0.78
278 0.78
279 0.73
280 0.7
281 0.69
282 0.7
283 0.71
284 0.72
285 0.73
286 0.77
287 0.82
288 0.82
289 0.8
290 0.71
291 0.7
292 0.63
293 0.6
294 0.59
295 0.52
296 0.51
297 0.53
298 0.58
299 0.59
300 0.64
301 0.63
302 0.58
303 0.61
304 0.58
305 0.52
306 0.49
307 0.44
308 0.39
309 0.34
310 0.3
311 0.25
312 0.21
313 0.18
314 0.14
315 0.12
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.06
326 0.11
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.19
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.2
335 0.23
336 0.26
337 0.25
338 0.24
339 0.25
340 0.25
341 0.24
342 0.2
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.18
347 0.21
348 0.22
349 0.23
350 0.22
351 0.23
352 0.29
353 0.33
354 0.39
355 0.43
356 0.47
357 0.49
358 0.52
359 0.53
360 0.46
361 0.4
362 0.36
363 0.31
364 0.36
365 0.37
366 0.39
367 0.43
368 0.45
369 0.51
370 0.51
371 0.5
372 0.47
373 0.52
374 0.54
375 0.53
376 0.57
377 0.55
378 0.54
379 0.57
380 0.54
381 0.51
382 0.48
383 0.47
384 0.44