Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4T5A2

Protein Details
Accession A0A4Q4T5A2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-65RYDASGKRVNTRYRRCREHLEDERBasic
190-209VTTPEPKNERKRQQLRDLAIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 8.5, cyto 8.5, pero 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MTSEQIDAYVMQVRIEEITQKLRFDHVVPADLDRRSPSPPPRYDASGKRVNTRYRRCREHLEDERHSLVRLAAHAIPNYRAPQGYIRGPRRLITDRVYIPAKDFPEANFIGQLLGPRGRSIADMTAQSGATVAIRGKGSVKEGRGRVRDRPAWIDTNDKEGPLHCLITADTQDKVDKAKALVQAVIETAVTTPEPKNERKRQQLRDLAIANGNFRDDEGRYGIPGAWERSMSSGVSCHVCNNGGHVACDCPDKKANDVPWRSTVRLQTNAGQRTEDALDLAPSFYRSYELTCVSSELVNYACIGKGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.18
4 0.15
5 0.23
6 0.25
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.3
11 0.28
12 0.33
13 0.27
14 0.3
15 0.29
16 0.33
17 0.35
18 0.34
19 0.33
20 0.28
21 0.27
22 0.27
23 0.33
24 0.38
25 0.43
26 0.47
27 0.51
28 0.52
29 0.57
30 0.61
31 0.61
32 0.59
33 0.58
34 0.55
35 0.59
36 0.62
37 0.65
38 0.67
39 0.7
40 0.74
41 0.74
42 0.81
43 0.78
44 0.81
45 0.8
46 0.8
47 0.79
48 0.78
49 0.74
50 0.7
51 0.68
52 0.59
53 0.51
54 0.41
55 0.32
56 0.24
57 0.19
58 0.18
59 0.16
60 0.18
61 0.2
62 0.2
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.21
67 0.18
68 0.18
69 0.2
70 0.23
71 0.29
72 0.36
73 0.39
74 0.43
75 0.44
76 0.44
77 0.46
78 0.46
79 0.43
80 0.38
81 0.39
82 0.35
83 0.38
84 0.38
85 0.32
86 0.3
87 0.31
88 0.27
89 0.21
90 0.21
91 0.17
92 0.21
93 0.21
94 0.19
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.09
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.09
125 0.13
126 0.16
127 0.18
128 0.22
129 0.25
130 0.32
131 0.37
132 0.39
133 0.4
134 0.44
135 0.46
136 0.43
137 0.44
138 0.4
139 0.37
140 0.36
141 0.36
142 0.3
143 0.33
144 0.3
145 0.25
146 0.22
147 0.19
148 0.22
149 0.17
150 0.17
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.14
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.09
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.12
181 0.16
182 0.23
183 0.33
184 0.42
185 0.51
186 0.61
187 0.7
188 0.73
189 0.79
190 0.81
191 0.74
192 0.71
193 0.63
194 0.54
195 0.48
196 0.4
197 0.31
198 0.23
199 0.2
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.09
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.16
212 0.17
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.15
227 0.14
228 0.17
229 0.21
230 0.19
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.25
236 0.21
237 0.2
238 0.25
239 0.27
240 0.3
241 0.36
242 0.44
243 0.47
244 0.52
245 0.52
246 0.54
247 0.58
248 0.56
249 0.54
250 0.54
251 0.51
252 0.52
253 0.5
254 0.49
255 0.53
256 0.56
257 0.52
258 0.45
259 0.38
260 0.36
261 0.34
262 0.27
263 0.19
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.11
274 0.15
275 0.19
276 0.21
277 0.22
278 0.22
279 0.24
280 0.23
281 0.23
282 0.19
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.12