Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4SWZ3

Protein Details
Accession A0A4Q4SWZ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MASKVKSKKRSHDEDGGARKRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-24VKSKKRSHDEDGGARKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 8, cyto 6.5, cyto_mito 6, plas 5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MASKVKSKKRSHDEDGGARKRRRKSAFEEDNLLFDMEAGVNRAIALMDSQLMSDHIAQKTSRFGTDLSPVELSDLYISPTSILDTTSYRETRILENLSQFLETFSEHPERLGEAPKKNGSPHTIIVTGAGLRAADLVRSVRKYQKKGNAIAKLFAKHIKIEESVQFLQSHRTGMAVGTPKRLNDLVENESVTMKHAGTLFVHVLLANTLRTSLAADVSPRNSAARRMIDGTSCDTHQYGPAFSHTLLTCVDTGAEIYTAPPGDVNIEFLRAREEGLLAGQQLPEIPGFLNLRQESAGASPVPFPTLNATPPIIPATLLTFATPAMSTTSCITRTLMPPLPPIPPLTVGMPLPRPITTITATVIPTISATAPPQGACHHFSSLTYHNNGSDGADASANPSAGADVTSSARPWISPVSKARNLMPSSYAGLVFWIAIVIAQDIWFTKTDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.84
3 0.83
4 0.82
5 0.8
6 0.79
7 0.78
8 0.79
9 0.77
10 0.74
11 0.74
12 0.76
13 0.8
14 0.78
15 0.77
16 0.67
17 0.61
18 0.54
19 0.45
20 0.33
21 0.22
22 0.18
23 0.11
24 0.11
25 0.11
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.12
41 0.18
42 0.17
43 0.2
44 0.2
45 0.22
46 0.28
47 0.29
48 0.26
49 0.22
50 0.22
51 0.23
52 0.3
53 0.3
54 0.26
55 0.25
56 0.23
57 0.24
58 0.22
59 0.19
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.21
77 0.23
78 0.24
79 0.29
80 0.3
81 0.26
82 0.28
83 0.29
84 0.28
85 0.26
86 0.23
87 0.18
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.13
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.18
98 0.26
99 0.28
100 0.29
101 0.35
102 0.39
103 0.41
104 0.41
105 0.43
106 0.4
107 0.38
108 0.36
109 0.33
110 0.3
111 0.28
112 0.26
113 0.22
114 0.17
115 0.13
116 0.1
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.08
124 0.12
125 0.15
126 0.18
127 0.26
128 0.34
129 0.4
130 0.47
131 0.55
132 0.58
133 0.64
134 0.69
135 0.69
136 0.63
137 0.62
138 0.56
139 0.49
140 0.43
141 0.39
142 0.31
143 0.24
144 0.24
145 0.22
146 0.2
147 0.21
148 0.22
149 0.24
150 0.23
151 0.24
152 0.23
153 0.21
154 0.23
155 0.21
156 0.19
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.15
162 0.18
163 0.18
164 0.22
165 0.23
166 0.23
167 0.25
168 0.25
169 0.21
170 0.18
171 0.22
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.12
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.12
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.18
214 0.19
215 0.18
216 0.19
217 0.2
218 0.17
219 0.15
220 0.15
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.1
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.14
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.06
250 0.06
251 0.09
252 0.08
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.09
260 0.1
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.08
274 0.1
275 0.11
276 0.17
277 0.16
278 0.17
279 0.17
280 0.17
281 0.14
282 0.13
283 0.15
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.13
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.13
300 0.11
301 0.1
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.2
321 0.26
322 0.29
323 0.27
324 0.3
325 0.31
326 0.32
327 0.29
328 0.29
329 0.24
330 0.21
331 0.21
332 0.18
333 0.18
334 0.17
335 0.2
336 0.2
337 0.2
338 0.2
339 0.18
340 0.18
341 0.18
342 0.2
343 0.18
344 0.18
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.18
349 0.16
350 0.13
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.13
360 0.16
361 0.19
362 0.21
363 0.23
364 0.22
365 0.22
366 0.22
367 0.27
368 0.3
369 0.32
370 0.31
371 0.3
372 0.28
373 0.28
374 0.28
375 0.23
376 0.19
377 0.15
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.13
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.12
397 0.14
398 0.21
399 0.22
400 0.29
401 0.37
402 0.45
403 0.5
404 0.53
405 0.55
406 0.55
407 0.54
408 0.49
409 0.43
410 0.37
411 0.35
412 0.34
413 0.29
414 0.2
415 0.19
416 0.16
417 0.14
418 0.1
419 0.07
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.08
428 0.1