FuNGI

A0A4Q4TS61

Protein Details

Accession

A0A4Q4TS61

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-54	VTPASDRKDKSSKKDQKSKKRHRETTDNTEAGERKHKKSKSRVSLGDGDD	Basic
70-95	ADEVGAHRKKSKKHKKADLTVDEEPK	Basic
118-143	QDDAPNKEKKKSKKDKRRNDIQEGET	Basic
158-188	DSQEAPSPQQKKKKKEKRKEKQSETTQPEPM	Hydrophilic
447-468	MEADRRRKLKHGGLLRKPFKRL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-29	RKDKSSKKDQKSKKRHRET
35-45	AGERKHKKSKS
76-85	HRKKSKKHKK
123-135	NKEKKKSKKDKRR
167-178	QKKKKKEKRKEK
451-467	RRRKLKHGGLLRKPFKR

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSSPVTPASDRKDKSSKKDQKSKKRHRETTDNTEAGERKHKKSKSRVSLGDGDDVAADQPESSAPAPPAADEVGAHRKKSKKHKKADLTVDEEPKAEAAEDDVKHKGKSRKQLGGDVQDDAPNKEKKKSKKDKRRNDIQEGETAAADVDTAQTAVIPDSQEAPSPQQKKKKKEKRKEKQSETTQPEPMDIDPAPSQLTPATSQAQGDRPDVSFPFFTQTVSQYLPLFPSGMVEPIEGYAEQHLRPLLNRYVPAFRGVLLSYRNPRIGEAPGKGSLTEASQMQDTALLESIDEYAVGFSWLTVEADLFCPKRGSWMEGSLNLQSEGFIGVICFGMFNASIEASRLPSGWKWVDLLSKKGGKQQTGKSAAETKLPTPDPQDENEEEDDGTDQAHSTGYWVDESGSKVGGKLWFRIKNYEVGSLGDYGYLSIEGTMLDEEAERAKVAGEMEADRRRKLKHGGLLRKPFKRLPEFSMTKFGNDDEQEDDILRSNKSKSNRPGTVASE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.72
3	0.74
4	0.76
5	0.85
6	0.88
7	0.88
8	0.92
9	0.95
10	0.95
11	0.95
12	0.94
13	0.93
14	0.93
15	0.91
16	0.9
17	0.89
18	0.79
19	0.68
20	0.65
21	0.58
22	0.5
23	0.52
24	0.48
25	0.45
26	0.53
27	0.58
28	0.62
29	0.71
30	0.78
31	0.78
32	0.82
33	0.81
34	0.78
35	0.81
36	0.73
37	0.67
38	0.56
39	0.45
40	0.35
41	0.29
42	0.22
43	0.14
44	0.11
45	0.05
46	0.06
47	0.06
48	0.08
49	0.09
50	0.12
51	0.12
52	0.14
53	0.14
54	0.14
55	0.16
56	0.14
57	0.13
58	0.1
59	0.15
60	0.24
61	0.26
62	0.27
63	0.32
64	0.38
65	0.46
66	0.57
67	0.63
68	0.63
69	0.72
70	0.82
71	0.86
72	0.9
73	0.92
74	0.89
75	0.85
76	0.82
77	0.76
78	0.65
79	0.55
80	0.45
81	0.34
82	0.26
83	0.18
84	0.11
85	0.09
86	0.15
87	0.15
88	0.18
89	0.23
90	0.25
91	0.25
92	0.33
93	0.39
94	0.39
95	0.49
96	0.56
97	0.59
98	0.62
99	0.7
100	0.69
101	0.69
102	0.63
103	0.55
104	0.47
105	0.42
106	0.39
107	0.32
108	0.32
109	0.29
110	0.3
111	0.35
112	0.41
113	0.48
114	0.58
115	0.68
116	0.73
117	0.78
118	0.87
119	0.91
120	0.94
121	0.95
122	0.93
123	0.91
124	0.88
125	0.79
126	0.73
127	0.63
128	0.54
129	0.42
130	0.33
131	0.22
132	0.14
133	0.11
134	0.06
135	0.04
136	0.04
137	0.04
138	0.03
139	0.04
140	0.04
141	0.05
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.09
146	0.1
147	0.11
148	0.12
149	0.16
150	0.23
151	0.3
152	0.35
153	0.43
154	0.51
155	0.6
156	0.71
157	0.77
158	0.81
159	0.85
160	0.9
161	0.92
162	0.95
163	0.96
164	0.94
165	0.93
166	0.92
167	0.92
168	0.88
169	0.81
170	0.73
171	0.62
172	0.53
173	0.44
174	0.34
175	0.26
176	0.19
177	0.16
178	0.12
179	0.13
180	0.13
181	0.12
182	0.12
183	0.09
184	0.11
185	0.09
186	0.11
187	0.13
188	0.12
189	0.13
190	0.15
191	0.19
192	0.19
193	0.19
194	0.18
195	0.17
196	0.18
197	0.18
198	0.18
199	0.14
200	0.12
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.15
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.13
233	0.14
234	0.15
235	0.16
236	0.17
237	0.2
238	0.2
239	0.21
240	0.17
241	0.14
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.15
247	0.17
248	0.19
249	0.2
250	0.19
251	0.19
252	0.19
253	0.21
254	0.22
255	0.2
256	0.2
257	0.2
258	0.2
259	0.2
260	0.18
261	0.14
262	0.11
263	0.1
264	0.08
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.07
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.07
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.11
297	0.18
298	0.18
299	0.2
300	0.2
301	0.26
302	0.27
303	0.28
304	0.31
305	0.25
306	0.25
307	0.21
308	0.19
309	0.12
310	0.1
311	0.08
312	0.06
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.17
338	0.24
339	0.25
340	0.28
341	0.29
342	0.33
343	0.33
344	0.39
345	0.42
346	0.4
347	0.45
348	0.48
349	0.52
350	0.54
351	0.53
352	0.49
353	0.51
354	0.47
355	0.45
356	0.4
357	0.32
358	0.32
359	0.33
360	0.31
361	0.29
362	0.34
363	0.31
364	0.32
365	0.36
366	0.31
367	0.33
368	0.33
369	0.29
370	0.23
371	0.2
372	0.19
373	0.13
374	0.11
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.16
393	0.2
394	0.2
395	0.23
396	0.32
397	0.37
398	0.39
399	0.45
400	0.43
401	0.45
402	0.46
403	0.45
404	0.37
405	0.32
406	0.31
407	0.26
408	0.24
409	0.17
410	0.14
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.08
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.1
431	0.11
432	0.12
433	0.14
434	0.21
435	0.3
436	0.32
437	0.34
438	0.37
439	0.38
440	0.42
441	0.48
442	0.49
443	0.51
444	0.59
445	0.67
446	0.73
447	0.81
448	0.84
449	0.82
450	0.79
451	0.75
452	0.73
453	0.72
454	0.67
455	0.63
456	0.65
457	0.64
458	0.62
459	0.67
460	0.58
461	0.5
462	0.46
463	0.4
464	0.36
465	0.32
466	0.3
467	0.24
468	0.25
469	0.24
470	0.24
471	0.23
472	0.22
473	0.23
474	0.22
475	0.22
476	0.25
477	0.3
478	0.36
479	0.45
480	0.5
481	0.58
482	0.62
483	0.64

A0A4Q4TS61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer