FuNGI

A0A4Q4TV54

Protein Details

Accession

A0A4Q4TV54

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-65	PLPFPPRSGNQDPKQRKQRKQSWSHKLYRGPENE	Hydrophilic
390-416	GSPRPMPSTSKLQRKRRRGGYSPYGGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
404-406	KRR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding
Pfam	View protein in Pfam PF00570 HRDC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC

Amino Acid Sequences

MEEALAAGNAAQANTASDKLTAPAWPLSYKIPLPFPPRSGNQDPKQRKQRKQSWSHKLYRGPENEEVKALFSTTKQQSEEIARKFLQEYILGPEDSIAPSLRKIIESPGIIKTGVKLSDLHNEVANRRPNDLGLVALAKQVECHLGLPLYKGDDVRKSNWSAPLNSEQCLYAEDDAYASFMLYHCMTAKKSKMNSISAAVPKSLPASIHDKQASSPLVSSPELFKILKNSRLRLGKAANVPPNSVANDDLLQALAQDRPTDTRALDRIKGINPEQIAKFGTGWIAIIKEFLATRRRVSGWKSENQPTRTILSTRTTSELNARGPSRRQNPVGSHTIKPATTTTTPTQDQMVSTIPQLHTGLSFEMAGTKLDGDGQKRACADDSTDSSAFGSPRPMPSTSKLQRKRRRGGYSPYGGSPSLGLAHQQPASSVSCVVQKNPGRREGFAGHEPHGDAAGIDYFADDDESLWAEIFDKSEFTH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.13
3	0.11
4	0.12
5	0.13
6	0.14
7	0.15
8	0.14
9	0.16
10	0.18
11	0.2
12	0.2
13	0.21
14	0.23
15	0.27
16	0.29
17	0.29
18	0.32
19	0.36
20	0.42
21	0.46
22	0.48
23	0.5
24	0.52
25	0.57
26	0.6
27	0.63
28	0.65
29	0.7
30	0.75
31	0.78
32	0.84
33	0.86
34	0.86
35	0.87
36	0.89
37	0.89
38	0.9
39	0.91
40	0.91
41	0.91
42	0.91
43	0.87
44	0.85
45	0.82
46	0.8
47	0.75
48	0.71
49	0.69
50	0.65
51	0.58
52	0.53
53	0.46
54	0.38
55	0.32
56	0.26
57	0.18
58	0.14
59	0.22
60	0.24
61	0.29
62	0.28
63	0.29
64	0.33
65	0.4
66	0.48
67	0.42
68	0.42
69	0.38
70	0.38
71	0.39
72	0.36
73	0.3
74	0.22
75	0.21
76	0.21
77	0.24
78	0.22
79	0.2
80	0.19
81	0.18
82	0.17
83	0.16
84	0.11
85	0.09
86	0.1
87	0.13
88	0.14
89	0.13
90	0.14
91	0.17
92	0.21
93	0.22
94	0.25
95	0.24
96	0.24
97	0.24
98	0.23
99	0.2
100	0.19
101	0.18
102	0.16
103	0.15
104	0.16
105	0.25
106	0.27
107	0.26
108	0.25
109	0.26
110	0.27
111	0.33
112	0.38
113	0.31
114	0.31
115	0.3
116	0.28
117	0.28
118	0.26
119	0.19
120	0.12
121	0.13
122	0.11
123	0.12
124	0.11
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.09
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.13
139	0.15
140	0.21
141	0.23
142	0.25
143	0.28
144	0.3
145	0.33
146	0.39
147	0.39
148	0.34
149	0.35
150	0.41
151	0.38
152	0.35
153	0.32
154	0.25
155	0.22
156	0.22
157	0.19
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.07
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.06
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.1
173	0.11
174	0.16
175	0.2
176	0.25
177	0.26
178	0.32
179	0.36
180	0.37
181	0.37
182	0.35
183	0.36
184	0.33
185	0.32
186	0.26
187	0.21
188	0.19
189	0.18
190	0.16
191	0.11
192	0.1
193	0.17
194	0.18
195	0.24
196	0.24
197	0.24
198	0.23
199	0.27
200	0.26
201	0.19
202	0.18
203	0.13
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.12
208	0.12
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.18
213	0.21
214	0.29
215	0.3
216	0.31
217	0.35
218	0.39
219	0.4
220	0.37
221	0.35
222	0.33
223	0.35
224	0.39
225	0.38
226	0.34
227	0.34
228	0.3
229	0.29
230	0.24
231	0.2
232	0.14
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.09
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.05
244	0.06
245	0.08
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.13
250	0.17
251	0.2
252	0.21
253	0.21
254	0.23
255	0.24
256	0.28
257	0.25
258	0.24
259	0.21
260	0.23
261	0.21
262	0.2
263	0.19
264	0.15
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.08
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.06
277	0.09
278	0.14
279	0.15
280	0.16
281	0.2
282	0.22
283	0.24
284	0.27
285	0.34
286	0.35
287	0.4
288	0.45
289	0.5
290	0.56
291	0.55
292	0.54
293	0.47
294	0.43
295	0.39
296	0.34
297	0.29
298	0.26
299	0.26
300	0.24
301	0.24
302	0.22
303	0.21
304	0.25
305	0.25
306	0.24
307	0.25
308	0.25
309	0.27
310	0.31
311	0.38
312	0.4
313	0.42
314	0.43
315	0.45
316	0.48
317	0.5
318	0.55
319	0.51
320	0.46
321	0.43
322	0.42
323	0.36
324	0.33
325	0.29
326	0.25
327	0.23
328	0.26
329	0.25
330	0.28
331	0.29
332	0.28
333	0.29
334	0.25
335	0.23
336	0.2
337	0.19
338	0.14
339	0.14
340	0.18
341	0.16
342	0.18
343	0.18
344	0.16
345	0.14
346	0.15
347	0.14
348	0.1
349	0.1
350	0.07
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.1
358	0.13
359	0.14
360	0.2
361	0.21
362	0.24
363	0.25
364	0.26
365	0.24
366	0.22
367	0.23
368	0.23
369	0.25
370	0.28
371	0.28
372	0.27
373	0.26
374	0.27
375	0.25
376	0.19
377	0.2
378	0.16
379	0.21
380	0.24
381	0.26
382	0.27
383	0.32
384	0.42
385	0.46
386	0.54
387	0.6
388	0.68
389	0.76
390	0.82
391	0.88
392	0.87
393	0.89
394	0.86
395	0.86
396	0.85
397	0.84
398	0.77
399	0.69
400	0.61
401	0.51
402	0.43
403	0.34
404	0.24
405	0.17
406	0.13
407	0.13
408	0.12
409	0.16
410	0.18
411	0.17
412	0.17
413	0.18
414	0.2
415	0.2
416	0.18
417	0.16
418	0.21
419	0.22
420	0.23
421	0.3
422	0.34
423	0.42
424	0.47
425	0.55
426	0.51
427	0.51
428	0.57
429	0.52
430	0.52
431	0.5
432	0.48
433	0.41
434	0.41
435	0.39
436	0.33
437	0.29
438	0.22
439	0.15
440	0.13
441	0.12
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.07
449	0.06
450	0.07
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.11

A0A4Q4TV54

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer