Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TJI8

Protein Details
Accession A0A4Q4TJI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-276RGDSSERNRRRDRSRESEEDSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-147RKLRRRG
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 13, nucl 8, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MTHRADERRFLDERGTNAALAPNGLNPATIMEKAVRERIVESYFWKEQCFGLNEADVVDRVAEHVSFVGGTYGDAQRPSPFLCLAFKLLQLGPGDDILHEYLAFGGERFKYLRALAAFYVRLTRRPEDVYRTLEPLLEDRRKLRRRGRAGTSLTFVDQFVDDLLTKDRVCATSLWQMPKREILEDLDLLEPRVSPLGDIEDLLAEEEEEEEGEPPVNGGADGGDGREDSDDEGLVEERMDEDHRGRRSSSSGESGRGDSSERNRRRDRSRESEEDSMDRDRDDAPGGRDDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.33
4 0.31
5 0.32
6 0.24
7 0.22
8 0.19
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.12
13 0.1
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.13
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.23
23 0.22
24 0.23
25 0.27
26 0.27
27 0.25
28 0.26
29 0.28
30 0.32
31 0.32
32 0.31
33 0.28
34 0.26
35 0.3
36 0.3
37 0.25
38 0.23
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.15
44 0.11
45 0.09
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.17
76 0.19
77 0.18
78 0.17
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.1
83 0.11
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.15
100 0.13
101 0.15
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.2
107 0.16
108 0.2
109 0.22
110 0.23
111 0.23
112 0.26
113 0.29
114 0.3
115 0.34
116 0.35
117 0.33
118 0.34
119 0.31
120 0.28
121 0.25
122 0.22
123 0.24
124 0.21
125 0.21
126 0.23
127 0.33
128 0.38
129 0.45
130 0.5
131 0.53
132 0.59
133 0.65
134 0.67
135 0.65
136 0.65
137 0.59
138 0.53
139 0.44
140 0.36
141 0.29
142 0.22
143 0.14
144 0.1
145 0.08
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.19
160 0.23
161 0.29
162 0.33
163 0.33
164 0.33
165 0.38
166 0.35
167 0.28
168 0.26
169 0.22
170 0.2
171 0.19
172 0.2
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.1
178 0.08
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.1
228 0.14
229 0.21
230 0.25
231 0.27
232 0.28
233 0.3
234 0.32
235 0.35
236 0.35
237 0.37
238 0.36
239 0.37
240 0.38
241 0.37
242 0.35
243 0.3
244 0.27
245 0.25
246 0.32
247 0.39
248 0.44
249 0.51
250 0.59
251 0.67
252 0.74
253 0.79
254 0.79
255 0.79
256 0.81
257 0.8
258 0.79
259 0.78
260 0.72
261 0.65
262 0.59
263 0.53
264 0.44
265 0.36
266 0.3
267 0.23
268 0.21
269 0.23
270 0.23
271 0.22