Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TQ06

Protein Details
Accession A0A4Q4TQ06    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-474LRSWKANRRGTYHRKRRRWAKIRHVGDGTBasic
607-630AEGKVEARGKTRPRKRKAAESQVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
450-468KANRRGTYHRKRRRWAKIR
607-624AEGKVEARGKTRPRKRKA
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSLVQPNAWVALKLPSGNVKTLQVVPNTTIALGKYGSFPSNLIIQRPYHLTYELEDRRETENFNRLRVVPASELYSDILSSGTSSTSPGTATPAPEDDDGATVTPMGVEYSLVDPDSGVVVAKTDRAQLDVSARQTLSMEEIEQLKRDATDAGKDLIAKLMLSHTAIDQKTQYSLAKYKLLKTRKYIRRFCVLPLDVPMLGNWLLDEKDPAKILEMREEMIALLGCWANVHFGGKDRCENAEPEAGSENKAADGGNKPESEPTAGRWLVVDDTGGLLVAAMAERMGVLYPAETDDSAAAKQQPTSPQMKRGELAGQVELNVSVTTEGAQRATEQDASKQMETQEGGQAVVKATQPQRKRHAGDKHRHDDLHVPYARSNTLTLIHANSQPNLSYLRYFDFDHTNPNQGLDHPLARHLMTLSWLQLLEPELDSAYSATPPQATPEELRSWKANRRGTYHRKRRRWAKIRHVGDGTRGGGFSGLVVASAMDPISVLRHTVPLLAGGAPVAVYSQAIEPLTALADCYSVSRRAAWIADPPAEAAGHSAEELERWPGTDEFPLNPSLLLGASIQTSRVRRWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYVFTAWRVKPAEGKVEARGKTRPRKRKAAESQVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.26
4 0.28
5 0.31
6 0.32
7 0.29
8 0.3
9 0.35
10 0.38
11 0.33
12 0.33
13 0.32
14 0.32
15 0.3
16 0.27
17 0.23
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.24
29 0.25
30 0.25
31 0.26
32 0.26
33 0.28
34 0.32
35 0.33
36 0.27
37 0.27
38 0.26
39 0.24
40 0.34
41 0.36
42 0.34
43 0.33
44 0.33
45 0.35
46 0.36
47 0.38
48 0.33
49 0.37
50 0.36
51 0.38
52 0.39
53 0.36
54 0.38
55 0.37
56 0.35
57 0.28
58 0.28
59 0.28
60 0.25
61 0.25
62 0.22
63 0.2
64 0.15
65 0.13
66 0.11
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.18
82 0.21
83 0.2
84 0.21
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.13
89 0.11
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.09
111 0.09
112 0.12
113 0.12
114 0.14
115 0.15
116 0.15
117 0.21
118 0.23
119 0.25
120 0.25
121 0.24
122 0.23
123 0.23
124 0.21
125 0.18
126 0.14
127 0.13
128 0.11
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.12
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.16
145 0.15
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.17
162 0.22
163 0.24
164 0.3
165 0.31
166 0.37
167 0.43
168 0.49
169 0.5
170 0.54
171 0.61
172 0.64
173 0.72
174 0.73
175 0.7
176 0.71
177 0.67
178 0.63
179 0.62
180 0.53
181 0.45
182 0.39
183 0.37
184 0.28
185 0.26
186 0.23
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.1
195 0.08
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.13
200 0.16
201 0.16
202 0.2
203 0.21
204 0.19
205 0.19
206 0.19
207 0.16
208 0.13
209 0.12
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.07
219 0.06
220 0.11
221 0.14
222 0.16
223 0.19
224 0.2
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.18
234 0.18
235 0.17
236 0.14
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.18
248 0.19
249 0.16
250 0.15
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.17
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.11
290 0.14
291 0.17
292 0.24
293 0.25
294 0.32
295 0.35
296 0.35
297 0.33
298 0.31
299 0.29
300 0.24
301 0.24
302 0.17
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.1
307 0.08
308 0.06
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.09
320 0.11
321 0.1
322 0.12
323 0.17
324 0.19
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.17
330 0.16
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.09
337 0.11
338 0.1
339 0.12
340 0.16
341 0.23
342 0.28
343 0.35
344 0.42
345 0.48
346 0.51
347 0.56
348 0.61
349 0.65
350 0.69
351 0.72
352 0.71
353 0.67
354 0.64
355 0.56
356 0.53
357 0.47
358 0.46
359 0.38
360 0.33
361 0.3
362 0.32
363 0.31
364 0.24
365 0.21
366 0.13
367 0.12
368 0.13
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.18
373 0.19
374 0.19
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.16
379 0.15
380 0.11
381 0.12
382 0.13
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.2
387 0.19
388 0.26
389 0.26
390 0.28
391 0.26
392 0.26
393 0.24
394 0.19
395 0.23
396 0.18
397 0.18
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.16
403 0.13
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.14
430 0.18
431 0.24
432 0.25
433 0.27
434 0.29
435 0.32
436 0.37
437 0.44
438 0.46
439 0.44
440 0.5
441 0.58
442 0.65
443 0.71
444 0.76
445 0.78
446 0.81
447 0.86
448 0.91
449 0.91
450 0.91
451 0.9
452 0.9
453 0.9
454 0.85
455 0.82
456 0.76
457 0.66
458 0.59
459 0.53
460 0.43
461 0.33
462 0.28
463 0.21
464 0.17
465 0.15
466 0.11
467 0.07
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.03
476 0.04
477 0.04
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.11
488 0.1
489 0.09
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.03
497 0.04
498 0.05
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.09
505 0.08
506 0.07
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.08
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.14
515 0.15
516 0.18
517 0.19
518 0.19
519 0.23
520 0.24
521 0.26
522 0.25
523 0.25
524 0.23
525 0.21
526 0.19
527 0.14
528 0.11
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.08
534 0.09
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.13
539 0.13
540 0.15
541 0.19
542 0.21
543 0.2
544 0.22
545 0.22
546 0.2
547 0.19
548 0.17
549 0.13
550 0.11
551 0.09
552 0.08
553 0.07
554 0.09
555 0.09
556 0.11
557 0.15
558 0.18
559 0.2
560 0.28
561 0.33
562 0.36
563 0.4
564 0.49
565 0.54
566 0.59
567 0.63
568 0.61
569 0.63
570 0.6
571 0.56
572 0.47
573 0.43
574 0.39
575 0.35
576 0.32
577 0.25
578 0.28
579 0.27
580 0.25
581 0.2
582 0.17
583 0.17
584 0.16
585 0.15
586 0.12
587 0.19
588 0.19
589 0.24
590 0.25
591 0.25
592 0.3
593 0.34
594 0.43
595 0.42
596 0.45
597 0.47
598 0.53
599 0.54
600 0.51
601 0.55
602 0.56
603 0.62
604 0.69
605 0.72
606 0.73
607 0.81
608 0.85
609 0.88
610 0.89