Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Q4TKU3

Protein Details
Accession A0A4Q4TKU3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-49ILFQQGPRKRVKQNPTELKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
533-582AARGGTNQRGNHRAGSQRGGQQQRGGRGGNQRGRGGPPRASHAPGHMGRA
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, nucl 7.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MADADLVSSLQKLQLANEQAGADFNIDDILFQQGPRKRVKQNPTELKAELERKFLTPSHKFSNEWLNRLQQRWDCPADLTELFRIAPTQTRTVTRFQRHGLEGRVTGYKNVTIPANSVTAKNSTSLMRKPAGRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEATAAMEDQMLRTAGAGIDGTTNKLQRVIKLGNEGGLLEVAPGLQRGIDFSKKKSKIDEKQAKAIEAELDQEPEQGPESEHVDGQPAADGIEEEADQEEAEDIDALLPIEFPALEPHGKLAASSAMKAGKEWAHMVDIKKDITNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAIYHLEGGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAARHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQQFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDFERGVVWEEVIIMLPEHVSLILLSATVPNTYEFASWVGRTKQKDIYVISTPKRPVPLEHYLWAGKDIYKIVDSQKRFLEKGWKEADQALRGKDKALPAPAARGGTNQRGNHRAGSQRGGQQQRGGRGGNQRGRGGPPRASHAPGHMGRAGRPGGFVSVNQDKNLWVHLVHFLKKSNLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTAQEKSHIHMIIERSVARLRPEDRSLPQIIRLRDLLRRGIAVHHGGLLPIVKEIVEILFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVPPGGIDEAPPVADLQKMILDPPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKLSEADLAKVKREPCDICDPTLDDCHQASMNYKQLTQELHKGLLTIPIGRKMFTQQRLIVWNKDGVRTPGILLSEGVSTKTLAGQPTVHVFEIKTGRETRDTTDILPFIPGLRNLFTPLPRTKRQVTAKTLHVPLSDVECLTGSIVAGVVPEYFQKGDAHQNAKERMLDICTTWDSGVWNEMDFSKIKSLPLQEIIGKRKEEAQVIQATATTPCPNFLKHFAMCHDQWLIKEHISSLRQALSDQNLQLLPDYEQRIEVLKDLSFIDAETRIQLKGKVACEIHSADELVLTELILDNVLAEYEPAEIAALLSAFVFQEKTESVPNLTGNLERGMKTIIDISEKVNTVQTERQVIQSSEDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIIGDPELYQKMQTAQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.24
3 0.25
4 0.27
5 0.26
6 0.24
7 0.24
8 0.23
9 0.16
10 0.12
11 0.11
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.2
20 0.24
21 0.3
22 0.39
23 0.46
24 0.5
25 0.6
26 0.7
27 0.73
28 0.79
29 0.84
30 0.81
31 0.79
32 0.7
33 0.65
34 0.63
35 0.61
36 0.52
37 0.47
38 0.44
39 0.4
40 0.43
41 0.41
42 0.43
43 0.42
44 0.46
45 0.49
46 0.52
47 0.51
48 0.51
49 0.59
50 0.56
51 0.53
52 0.51
53 0.51
54 0.53
55 0.55
56 0.59
57 0.53
58 0.54
59 0.57
60 0.57
61 0.48
62 0.44
63 0.43
64 0.4
65 0.36
66 0.32
67 0.27
68 0.24
69 0.22
70 0.2
71 0.2
72 0.16
73 0.21
74 0.22
75 0.26
76 0.28
77 0.34
78 0.37
79 0.44
80 0.52
81 0.53
82 0.55
83 0.55
84 0.59
85 0.58
86 0.6
87 0.58
88 0.53
89 0.46
90 0.43
91 0.44
92 0.38
93 0.35
94 0.31
95 0.29
96 0.25
97 0.25
98 0.25
99 0.2
100 0.21
101 0.21
102 0.23
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.22
108 0.21
109 0.21
110 0.21
111 0.26
112 0.29
113 0.33
114 0.36
115 0.38
116 0.41
117 0.47
118 0.46
119 0.46
120 0.44
121 0.45
122 0.45
123 0.43
124 0.41
125 0.33
126 0.3
127 0.26
128 0.24
129 0.17
130 0.11
131 0.13
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.16
163 0.17
164 0.17
165 0.23
166 0.24
167 0.23
168 0.3
169 0.31
170 0.31
171 0.37
172 0.37
173 0.33
174 0.31
175 0.29
176 0.22
177 0.18
178 0.14
179 0.08
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.08
188 0.12
189 0.21
190 0.24
191 0.3
192 0.41
193 0.45
194 0.47
195 0.54
196 0.6
197 0.62
198 0.7
199 0.75
200 0.7
201 0.75
202 0.75
203 0.67
204 0.56
205 0.48
206 0.38
207 0.28
208 0.25
209 0.17
210 0.17
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.13
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.17
266 0.18
267 0.18
268 0.19
269 0.21
270 0.17
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.18
275 0.22
276 0.24
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.25
281 0.26
282 0.26
283 0.25
284 0.29
285 0.25
286 0.23
287 0.27
288 0.26
289 0.27
290 0.25
291 0.24
292 0.19
293 0.25
294 0.24
295 0.2
296 0.21
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.18
308 0.19
309 0.17
310 0.15
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.07
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.11
347 0.15
348 0.16
349 0.18
350 0.21
351 0.24
352 0.24
353 0.27
354 0.35
355 0.38
356 0.47
357 0.47
358 0.52
359 0.53
360 0.55
361 0.62
362 0.54
363 0.49
364 0.46
365 0.46
366 0.39
367 0.36
368 0.34
369 0.23
370 0.21
371 0.17
372 0.1
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.11
397 0.1
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.09
411 0.07
412 0.06
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.1
420 0.1
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.04
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.1
455 0.1
456 0.13
457 0.17
458 0.21
459 0.23
460 0.26
461 0.3
462 0.31
463 0.35
464 0.33
465 0.34
466 0.36
467 0.4
468 0.38
469 0.38
470 0.37
471 0.35
472 0.37
473 0.33
474 0.28
475 0.29
476 0.35
477 0.33
478 0.33
479 0.34
480 0.31
481 0.3
482 0.29
483 0.22
484 0.15
485 0.13
486 0.13
487 0.11
488 0.1
489 0.12
490 0.16
491 0.22
492 0.23
493 0.25
494 0.28
495 0.31
496 0.31
497 0.31
498 0.36
499 0.31
500 0.37
501 0.38
502 0.35
503 0.33
504 0.37
505 0.38
506 0.33
507 0.34
508 0.29
509 0.28
510 0.27
511 0.27
512 0.25
513 0.24
514 0.22
515 0.22
516 0.22
517 0.19
518 0.21
519 0.22
520 0.21
521 0.18
522 0.18
523 0.19
524 0.23
525 0.29
526 0.29
527 0.31
528 0.33
529 0.35
530 0.34
531 0.34
532 0.32
533 0.29
534 0.3
535 0.3
536 0.32
537 0.38
538 0.39
539 0.36
540 0.37
541 0.37
542 0.37
543 0.36
544 0.31
545 0.28
546 0.31
547 0.39
548 0.39
549 0.4
550 0.37
551 0.36
552 0.39
553 0.41
554 0.37
555 0.34
556 0.3
557 0.33
558 0.34
559 0.35
560 0.32
561 0.27
562 0.31
563 0.27
564 0.28
565 0.25
566 0.23
567 0.21
568 0.24
569 0.23
570 0.15
571 0.15
572 0.13
573 0.12
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.19
578 0.19
579 0.19
580 0.19
581 0.18
582 0.18
583 0.19
584 0.14
585 0.07
586 0.08
587 0.14
588 0.16
589 0.18
590 0.19
591 0.19
592 0.2
593 0.23
594 0.22
595 0.23
596 0.21
597 0.21
598 0.19
599 0.2
600 0.2
601 0.17
602 0.17
603 0.12
604 0.18
605 0.18
606 0.24
607 0.25
608 0.26
609 0.27
610 0.33
611 0.34
612 0.34
613 0.38
614 0.33
615 0.31
616 0.29
617 0.28
618 0.23
619 0.19
620 0.12
621 0.07
622 0.06
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.16
627 0.17
628 0.18
629 0.22
630 0.22
631 0.18
632 0.2
633 0.22
634 0.18
635 0.18
636 0.17
637 0.14
638 0.15
639 0.16
640 0.14
641 0.16
642 0.16
643 0.18
644 0.21
645 0.23
646 0.24
647 0.27
648 0.28
649 0.25
650 0.29
651 0.3
652 0.28
653 0.26
654 0.27
655 0.24
656 0.25
657 0.26
658 0.22
659 0.18
660 0.18
661 0.16
662 0.16
663 0.17
664 0.15
665 0.13
666 0.12
667 0.11
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.06
672 0.05
673 0.05
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.04
687 0.05
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.06
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.1
709 0.13
710 0.19
711 0.23
712 0.28
713 0.28
714 0.29
715 0.34
716 0.36
717 0.38
718 0.41
719 0.41
720 0.36
721 0.41
722 0.4
723 0.34
724 0.29
725 0.25
726 0.19
727 0.15
728 0.15
729 0.09
730 0.1
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.12
738 0.12
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.07
746 0.06
747 0.06
748 0.04
749 0.04
750 0.03
751 0.03
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.04
756 0.04
757 0.05
758 0.05
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.07
767 0.1
768 0.11
769 0.11
770 0.17
771 0.2
772 0.2
773 0.23
774 0.26
775 0.29
776 0.34
777 0.4
778 0.37
779 0.41
780 0.42
781 0.44
782 0.41
783 0.36
784 0.32
785 0.25
786 0.22
787 0.15
788 0.13
789 0.09
790 0.07
791 0.06
792 0.05
793 0.06
794 0.06
795 0.07
796 0.09
797 0.11
798 0.13
799 0.14
800 0.14
801 0.14
802 0.15
803 0.17
804 0.17
805 0.19
806 0.19
807 0.23
808 0.25
809 0.25
810 0.24
811 0.26
812 0.26
813 0.24
814 0.22
815 0.19
816 0.17
817 0.18
818 0.17
819 0.16
820 0.15
821 0.13
822 0.13
823 0.16
824 0.15
825 0.15
826 0.2
827 0.18
828 0.19
829 0.22
830 0.23
831 0.21
832 0.25
833 0.25
834 0.25
835 0.35
836 0.35
837 0.33
838 0.33
839 0.32
840 0.29
841 0.31
842 0.27
843 0.18
844 0.17
845 0.17
846 0.16
847 0.14
848 0.15
849 0.17
850 0.23
851 0.21
852 0.22
853 0.21
854 0.23
855 0.26
856 0.27
857 0.3
858 0.25
859 0.26
860 0.25
861 0.25
862 0.23
863 0.23
864 0.21
865 0.18
866 0.17
867 0.22
868 0.22
869 0.22
870 0.23
871 0.25
872 0.33
873 0.33
874 0.37
875 0.33
876 0.36
877 0.43
878 0.45
879 0.42
880 0.35
881 0.36
882 0.31
883 0.32
884 0.3
885 0.26
886 0.25
887 0.23
888 0.21
889 0.18
890 0.17
891 0.15
892 0.13
893 0.12
894 0.11
895 0.11
896 0.11
897 0.09
898 0.08
899 0.08
900 0.1
901 0.11
902 0.1
903 0.12
904 0.12
905 0.13
906 0.17
907 0.19
908 0.17
909 0.15
910 0.15
911 0.19
912 0.23
913 0.22
914 0.22
915 0.23
916 0.25
917 0.28
918 0.3
919 0.28
920 0.3
921 0.3
922 0.28
923 0.29
924 0.27
925 0.23
926 0.22
927 0.19
928 0.14
929 0.15
930 0.14
931 0.12
932 0.14
933 0.14
934 0.17
935 0.2
936 0.2
937 0.24
938 0.31
939 0.36
940 0.39
941 0.44
942 0.45
943 0.52
944 0.59
945 0.62
946 0.62
947 0.6
948 0.63
949 0.64
950 0.62
951 0.55
952 0.45
953 0.38
954 0.31
955 0.3
956 0.24
957 0.17
958 0.15
959 0.13
960 0.12
961 0.11
962 0.1
963 0.06
964 0.05
965 0.05
966 0.04
967 0.04
968 0.04
969 0.04
970 0.04
971 0.05
972 0.06
973 0.07
974 0.08
975 0.09
976 0.11
977 0.2
978 0.26
979 0.31
980 0.33
981 0.4
982 0.41
983 0.43
984 0.41
985 0.33
986 0.28
987 0.26
988 0.24
989 0.18
990 0.18
991 0.17
992 0.17
993 0.16
994 0.16
995 0.14
996 0.13
997 0.16
998 0.12
999 0.11
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.12
1003 0.12
1004 0.14
1005 0.16
1006 0.17
1007 0.17
1008 0.2
1009 0.23
1010 0.25
1011 0.28
1012 0.28
1013 0.28
1014 0.34
1015 0.39
1016 0.41
1017 0.38
1018 0.35
1019 0.38
1020 0.38
1021 0.37
1022 0.32
1023 0.32
1024 0.32
1025 0.31
1026 0.31
1027 0.26
1028 0.23
1029 0.21
1030 0.2
1031 0.17
1032 0.13
1033 0.15
1034 0.17
1035 0.18
1036 0.21
1037 0.26
1038 0.3
1039 0.29
1040 0.33
1041 0.33
1042 0.38
1043 0.36
1044 0.36
1045 0.34
1046 0.29
1047 0.28
1048 0.3
1049 0.29
1050 0.23
1051 0.24
1052 0.22
1053 0.26
1054 0.26
1055 0.26
1056 0.24
1057 0.24
1058 0.23
1059 0.24
1060 0.26
1061 0.24
1062 0.27
1063 0.25
1064 0.25
1065 0.23
1066 0.23
1067 0.23
1068 0.2
1069 0.18
1070 0.19
1071 0.22
1072 0.19
1073 0.19
1074 0.2
1075 0.22
1076 0.21
1077 0.2
1078 0.17
1079 0.14
1080 0.15
1081 0.15
1082 0.15
1083 0.12
1084 0.12
1085 0.12
1086 0.11
1087 0.12
1088 0.13
1089 0.14
1090 0.14
1091 0.16
1092 0.18
1093 0.21
1094 0.25
1095 0.27
1096 0.3
1097 0.3
1098 0.3
1099 0.33
1100 0.33
1101 0.3
1102 0.25
1103 0.24
1104 0.17
1105 0.17
1106 0.16
1107 0.13
1108 0.11
1109 0.09
1110 0.07
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.06
1114 0.05
1115 0.04
1116 0.04
1117 0.05
1118 0.04
1119 0.04
1120 0.04
1121 0.05
1122 0.05
1123 0.05
1124 0.05
1125 0.05
1126 0.05
1127 0.05
1128 0.05
1129 0.04
1130 0.04
1131 0.05
1132 0.05
1133 0.05
1134 0.06
1135 0.05
1136 0.08
1137 0.08
1138 0.11
1139 0.15
1140 0.17
1141 0.18
1142 0.21
1143 0.22
1144 0.21
1145 0.22
1146 0.21
1147 0.19
1148 0.21
1149 0.22
1150 0.19
1151 0.2
1152 0.2
1153 0.18
1154 0.18
1155 0.2
1156 0.18
1157 0.19
1158 0.2
1159 0.21
1160 0.25
1161 0.26
1162 0.25
1163 0.25
1164 0.24
1165 0.24
1166 0.28
1167 0.3
1168 0.31
1169 0.31
1170 0.35
1171 0.36
1172 0.35
1173 0.35
1174 0.34
1175 0.32
1176 0.29
1177 0.29
1178 0.25
1179 0.22
1180 0.23
1181 0.19
1182 0.21
1183 0.22
1184 0.21
1185 0.21
1186 0.22
1187 0.21
1188 0.2
1189 0.26
1190 0.22
1191 0.23
1192 0.21
1193 0.23
1194 0.21
1195 0.21
1196 0.2
1197 0.14
1198 0.13
1199 0.1
1200 0.12
1201 0.16
1202 0.2
1203 0.2
1204 0.25
1205 0.26
1206 0.27
1207 0.29
1208 0.27
1209 0.22
1210 0.21
1211 0.19
1212 0.15
1213 0.15
1214 0.14
1215 0.12
1216 0.15
1217 0.12
1218 0.1
1219 0.11
1220 0.11
1221 0.13
1222 0.19
1223 0.2
1224 0.22
1225 0.28
1226 0.34
1227 0.4
1228 0.42
1229 0.42
1230 0.39
1231 0.41
1232 0.45
1233 0.45
1234 0.42
1235 0.37
1236 0.36
1237 0.38
1238 0.4
1239 0.36
1240 0.27
1241 0.26
1242 0.28
1243 0.27
1244 0.26
1245 0.23
1246 0.23
1247 0.25
1248 0.26
1249 0.26
1250 0.26
1251 0.32
1252 0.37
1253 0.38
1254 0.38
1255 0.36
1256 0.35
1257 0.33
1258 0.3
1259 0.25