Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Q4SWM0

Protein Details
Accession A0A4Q4SWM0    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-252LRMSSRPKKKGFKYAPIAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011502  Nucleoporin_Nup85  
Gene Ontology GO:0031965  C:nuclear membrane  
GO:0031080  C:nuclear pore outer ring  
GO:0017056  F:structural constituent of nuclear pore  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF07575  Nucleopor_Nup85  
Amino Acid Sequences MPFTLSDFSPAPSTPDRRNASSSYGYDSDEEHPTTTPAGPPPPSSAPSYTPAGDPSPSYLNSSIGAMTGKVKPLNFKKASSKPSLGKGAKVPLGSSIRGSTTRQPSRLSRQYYADDDDDDEEEEDYGDDEDEQELPTKPSGTYGVPMNDNARELGDAETEDEEDEEDEEEMEDMMEDDVEQDIEEDLLREIAETAGMDPDPYLHQFDDSDSDIMMMATPGVDERIRRDAEHMLRMSSRPKKKGFKYAPIAKDVCSHHNLAEVSEPDSILLQTEDIINRLYDEGVGTKDDREKLAHTLSQACIKLIDDVWGPYVESLSRRFEEHAAKVGPPPDAPNFEKAKYLAALILRIHHTPPVRNEFGGSRYPALPSILFNWQDTHHNLDGDQISLILRHRPSPASHSLFWQGAFSSLVRGNVETAVELLRGAGWESIKKSARGEPLYKGQALENIRLAVEDLSQVIEICPAISNDSWDIRSSDWTLFRLKAKAAKENLIDFAEGKDRHHLAVSRFGEPAFADSIDSRRSLTGLARKAESQIPWDIYESLQSLYAILIGEADAILAASQDWCEATIGLLGWWNEEESRRSMNKSQPRPATEYTESSADEYFLDRLASCFYQATHAEFHFDSTDMVELAIACVFEDNIEDVIQILRTWSLPVASAIAEIGALGGWLLPPESNLISMSSLDMEDLELLGVDQNASPDEKDGIKDATLIHYARGLRNRKIISGTISKGKVSREGWEIAVQVVGRIDSADRSEEMVRDLLQSVLSTINEDSHETVDKVWRLLNELGMINFAEDTAEAFGDVLAGETFRFGETLWYYALAHRPGKVRDVLNTLMSISLVESTTYPPKGELDNYLKRLLTERATTLEQFAKQDLEAAELLGKMLSGYATLRRFYELRDGDGKTNTHSLARRQQAASALMAVIASADDNIRGGLYDDTRDAVVSEDFLLALLGEASVFVNQSPPVITLEQIDILLKAVEDIQTVGSRVYEAADEFFKLILASGHGLKGSSPADLLKRSTGNLGGSFVMTGSSMMASQLHQSVVKSGMIKGPIKRAWDWRTSVLSGSSSGDVLKRIRLGLTKDLANLWLEQADSVIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.45
3 0.49
4 0.51
5 0.56
6 0.53
7 0.53
8 0.54
9 0.49
10 0.46
11 0.42
12 0.39
13 0.35
14 0.35
15 0.32
16 0.29
17 0.29
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.27
26 0.28
27 0.3
28 0.35
29 0.38
30 0.38
31 0.39
32 0.38
33 0.36
34 0.37
35 0.39
36 0.34
37 0.3
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.23
42 0.23
43 0.24
44 0.24
45 0.27
46 0.25
47 0.24
48 0.23
49 0.23
50 0.19
51 0.15
52 0.15
53 0.12
54 0.14
55 0.16
56 0.19
57 0.21
58 0.23
59 0.31
60 0.39
61 0.49
62 0.49
63 0.52
64 0.58
65 0.64
66 0.7
67 0.69
68 0.69
69 0.63
70 0.67
71 0.72
72 0.64
73 0.59
74 0.57
75 0.56
76 0.52
77 0.47
78 0.4
79 0.37
80 0.39
81 0.35
82 0.32
83 0.27
84 0.26
85 0.28
86 0.31
87 0.33
88 0.39
89 0.46
90 0.47
91 0.51
92 0.55
93 0.63
94 0.69
95 0.67
96 0.61
97 0.59
98 0.61
99 0.6
100 0.57
101 0.49
102 0.41
103 0.36
104 0.33
105 0.28
106 0.23
107 0.19
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.1
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.14
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.22
131 0.24
132 0.25
133 0.27
134 0.27
135 0.26
136 0.25
137 0.23
138 0.18
139 0.15
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.1
188 0.11
189 0.13
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.07
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.12
211 0.19
212 0.2
213 0.21
214 0.23
215 0.3
216 0.34
217 0.41
218 0.38
219 0.34
220 0.35
221 0.36
222 0.42
223 0.44
224 0.47
225 0.47
226 0.55
227 0.62
228 0.67
229 0.76
230 0.76
231 0.77
232 0.79
233 0.81
234 0.76
235 0.74
236 0.68
237 0.58
238 0.56
239 0.49
240 0.44
241 0.37
242 0.34
243 0.27
244 0.31
245 0.3
246 0.24
247 0.25
248 0.21
249 0.2
250 0.19
251 0.19
252 0.13
253 0.14
254 0.12
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.05
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.1
273 0.12
274 0.16
275 0.18
276 0.18
277 0.19
278 0.2
279 0.22
280 0.26
281 0.25
282 0.23
283 0.25
284 0.25
285 0.3
286 0.28
287 0.24
288 0.21
289 0.19
290 0.19
291 0.15
292 0.16
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.12
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.23
308 0.28
309 0.28
310 0.32
311 0.29
312 0.29
313 0.3
314 0.31
315 0.27
316 0.22
317 0.23
318 0.19
319 0.24
320 0.24
321 0.29
322 0.3
323 0.29
324 0.31
325 0.28
326 0.27
327 0.22
328 0.21
329 0.17
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.18
338 0.19
339 0.21
340 0.27
341 0.32
342 0.32
343 0.31
344 0.32
345 0.3
346 0.31
347 0.31
348 0.26
349 0.21
350 0.19
351 0.2
352 0.19
353 0.19
354 0.16
355 0.13
356 0.14
357 0.17
358 0.18
359 0.18
360 0.18
361 0.18
362 0.22
363 0.22
364 0.25
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.22
369 0.21
370 0.18
371 0.16
372 0.1
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.13
379 0.15
380 0.17
381 0.19
382 0.24
383 0.32
384 0.33
385 0.32
386 0.33
387 0.34
388 0.33
389 0.31
390 0.26
391 0.17
392 0.13
393 0.13
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.09
416 0.16
417 0.18
418 0.18
419 0.2
420 0.24
421 0.3
422 0.33
423 0.34
424 0.32
425 0.37
426 0.38
427 0.37
428 0.32
429 0.26
430 0.26
431 0.26
432 0.24
433 0.18
434 0.16
435 0.15
436 0.14
437 0.15
438 0.09
439 0.08
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.04
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.1
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.12
461 0.13
462 0.15
463 0.15
464 0.16
465 0.18
466 0.19
467 0.2
468 0.2
469 0.19
470 0.22
471 0.23
472 0.29
473 0.29
474 0.31
475 0.3
476 0.3
477 0.3
478 0.25
479 0.23
480 0.16
481 0.15
482 0.17
483 0.15
484 0.15
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.18
489 0.2
490 0.16
491 0.25
492 0.26
493 0.24
494 0.24
495 0.23
496 0.22
497 0.19
498 0.19
499 0.1
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.1
505 0.1
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.12
511 0.17
512 0.2
513 0.21
514 0.22
515 0.22
516 0.24
517 0.26
518 0.22
519 0.19
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.17
524 0.15
525 0.12
526 0.13
527 0.11
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.03
541 0.02
542 0.02
543 0.02
544 0.02
545 0.02
546 0.02
547 0.02
548 0.02
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.06
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.09
565 0.09
566 0.14
567 0.15
568 0.18
569 0.23
570 0.31
571 0.39
572 0.44
573 0.5
574 0.51
575 0.53
576 0.56
577 0.53
578 0.52
579 0.45
580 0.4
581 0.34
582 0.3
583 0.26
584 0.22
585 0.19
586 0.13
587 0.11
588 0.09
589 0.08
590 0.07
591 0.07
592 0.06
593 0.06
594 0.08
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.11
600 0.12
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.15
605 0.15
606 0.16
607 0.13
608 0.12
609 0.1
610 0.08
611 0.09
612 0.06
613 0.06
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.03
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.05
627 0.05
628 0.05
629 0.05
630 0.05
631 0.05
632 0.05
633 0.04
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.07
641 0.06
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.04
646 0.04
647 0.03
648 0.02
649 0.02
650 0.02
651 0.02
652 0.02
653 0.02
654 0.03
655 0.02
656 0.03
657 0.05
658 0.05
659 0.06
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.08
664 0.08
665 0.07
666 0.06
667 0.06
668 0.05
669 0.05
670 0.04
671 0.04
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.03
676 0.03
677 0.03
678 0.04
679 0.04
680 0.05
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.08
685 0.08
686 0.09
687 0.1
688 0.11
689 0.1
690 0.11
691 0.11
692 0.12
693 0.14
694 0.14
695 0.12
696 0.15
697 0.16
698 0.19
699 0.27
700 0.3
701 0.3
702 0.37
703 0.38
704 0.36
705 0.38
706 0.36
707 0.33
708 0.34
709 0.33
710 0.32
711 0.32
712 0.31
713 0.3
714 0.3
715 0.31
716 0.26
717 0.27
718 0.24
719 0.25
720 0.25
721 0.25
722 0.24
723 0.18
724 0.18
725 0.14
726 0.11
727 0.09
728 0.08
729 0.06
730 0.05
731 0.06
732 0.05
733 0.07
734 0.08
735 0.08
736 0.1
737 0.12
738 0.12
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.12
743 0.12
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.08
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.1
754 0.11
755 0.11
756 0.11
757 0.13
758 0.12
759 0.13
760 0.16
761 0.17
762 0.16
763 0.17
764 0.16
765 0.19
766 0.2
767 0.2
768 0.17
769 0.17
770 0.16
771 0.15
772 0.15
773 0.1
774 0.09
775 0.07
776 0.05
777 0.04
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.04
782 0.05
783 0.04
784 0.04
785 0.04
786 0.04
787 0.03
788 0.04
789 0.04
790 0.04
791 0.05
792 0.05
793 0.05
794 0.04
795 0.09
796 0.09
797 0.11
798 0.11
799 0.12
800 0.12
801 0.14
802 0.19
803 0.2
804 0.2
805 0.22
806 0.27
807 0.28
808 0.32
809 0.35
810 0.31
811 0.31
812 0.35
813 0.33
814 0.29
815 0.28
816 0.24
817 0.19
818 0.17
819 0.13
820 0.08
821 0.07
822 0.06
823 0.06
824 0.07
825 0.1
826 0.14
827 0.15
828 0.15
829 0.15
830 0.17
831 0.19
832 0.2
833 0.25
834 0.29
835 0.36
836 0.39
837 0.41
838 0.39
839 0.37
840 0.39
841 0.35
842 0.3
843 0.25
844 0.23
845 0.25
846 0.27
847 0.27
848 0.27
849 0.27
850 0.25
851 0.23
852 0.23
853 0.2
854 0.18
855 0.21
856 0.18
857 0.16
858 0.14
859 0.13
860 0.13
861 0.12
862 0.12
863 0.08
864 0.08
865 0.05
866 0.05
867 0.04
868 0.04
869 0.06
870 0.12
871 0.15
872 0.16
873 0.17
874 0.2
875 0.2
876 0.22
877 0.31
878 0.26
879 0.29
880 0.34
881 0.36
882 0.36
883 0.4
884 0.38
885 0.31
886 0.33
887 0.29
888 0.28
889 0.29
890 0.33
891 0.38
892 0.44
893 0.47
894 0.44
895 0.46
896 0.45
897 0.43
898 0.37
899 0.28
900 0.22
901 0.16
902 0.15
903 0.12
904 0.07
905 0.05
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.05
912 0.05
913 0.05
914 0.06
915 0.09
916 0.1
917 0.12
918 0.12
919 0.13
920 0.14
921 0.13
922 0.12
923 0.11
924 0.1
925 0.09
926 0.1
927 0.09
928 0.08
929 0.08
930 0.08
931 0.06
932 0.06
933 0.05
934 0.03
935 0.03
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.05
940 0.05
941 0.07
942 0.07
943 0.08
944 0.09
945 0.1
946 0.12
947 0.13
948 0.13
949 0.13
950 0.15
951 0.15
952 0.14
953 0.14
954 0.11
955 0.11
956 0.1
957 0.08
958 0.07
959 0.07
960 0.07
961 0.07
962 0.08
963 0.09
964 0.1
965 0.11
966 0.11
967 0.1
968 0.1
969 0.1
970 0.1
971 0.09
972 0.09
973 0.11
974 0.11
975 0.12
976 0.12
977 0.12
978 0.11
979 0.1
980 0.1
981 0.08
982 0.09
983 0.1
984 0.11
985 0.12
986 0.12
987 0.13
988 0.12
989 0.16
990 0.15
991 0.13
992 0.13
993 0.15
994 0.19
995 0.23
996 0.25
997 0.26
998 0.27
999 0.27
1000 0.29
1001 0.29
1002 0.28
1003 0.26
1004 0.26
1005 0.21
1006 0.2
1007 0.19
1008 0.15
1009 0.12
1010 0.09
1011 0.08
1012 0.06
1013 0.06
1014 0.06
1015 0.06
1016 0.07
1017 0.08
1018 0.1
1019 0.12
1020 0.13
1021 0.14
1022 0.14
1023 0.17
1024 0.19
1025 0.21
1026 0.2
1027 0.2
1028 0.23
1029 0.27
1030 0.32
1031 0.33
1032 0.4
1033 0.41
1034 0.45
1035 0.48
1036 0.53
1037 0.54
1038 0.57
1039 0.57
1040 0.54
1041 0.56
1042 0.52
1043 0.5
1044 0.42
1045 0.37
1046 0.31
1047 0.28
1048 0.23
1049 0.18
1050 0.17
1051 0.17
1052 0.18
1053 0.19
1054 0.21
1055 0.21
1056 0.21
1057 0.25
1058 0.29
1059 0.33
1060 0.37
1061 0.41
1062 0.39
1063 0.38
1064 0.38
1065 0.36
1066 0.32
1067 0.28
1068 0.21
1069 0.17
1070 0.14
1071 0.13