Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TCM3

Protein Details
Accession A0A4Q4TCM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-81LERFERVTSRKPHRWLRRGLFFSHydrophilic
410-431EEFMRPRKLEWRGNPQHPPPDVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 5, pero 5, cysk 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002306  Trp-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004830  F:tryptophan-tRNA ligase activity  
GO:0006436  P:tryptophanyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
CDD cd00806  TrpRS_core  
Amino Acid Sequences MENEPGRPELAETNLTSFLILSSLACDMATVGEASEPVGHDQVINPWKWNTQAIDAALLERFERVTSRKPHRWLRRGLFFSHRDFDKILDCYERGEPFFLYTGRGPSTGSLHLGHTIPMQFTQWLQECFDVPLVFMLTDDEKAIFNDNLTCEETMKYAMDNAKDIIALGFDVKKTFIYSDLKYLGGHFLMNAWEFSKLVTFNQVRGAFGFNESTNIGRSFFPSVQCVAAFATSYPEIWAEEPLQDRHPSIARIPCLIPMGIDQDPYFRLVRDNAHRMRNPSPKPALIHSKFLTALQGAGGKMSSSNPNSAIFMTDSAKQIKTKINRHAFSGGQANLEEHRRLGGNPDVDVSYIYLTYFEESDEKLAEVYKNYREGSLLTGELKKMAIDLLQEYVQQFQTRRAAVTDKVLEEFMRPRKLEWRGNPQHPPPDVTGRVAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.22
4 0.18
5 0.14
6 0.11
7 0.1
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.08
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.2
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.26
34 0.28
35 0.3
36 0.34
37 0.28
38 0.26
39 0.3
40 0.28
41 0.29
42 0.27
43 0.26
44 0.22
45 0.2
46 0.16
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.12
51 0.15
52 0.23
53 0.33
54 0.43
55 0.51
56 0.59
57 0.69
58 0.77
59 0.82
60 0.83
61 0.83
62 0.83
63 0.79
64 0.75
65 0.74
66 0.67
67 0.64
68 0.59
69 0.51
70 0.43
71 0.4
72 0.37
73 0.33
74 0.3
75 0.26
76 0.24
77 0.23
78 0.23
79 0.27
80 0.27
81 0.22
82 0.22
83 0.2
84 0.18
85 0.21
86 0.18
87 0.17
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.16
94 0.19
95 0.17
96 0.18
97 0.16
98 0.16
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.16
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.15
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.11
134 0.12
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.09
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.09
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.11
164 0.15
165 0.15
166 0.19
167 0.2
168 0.21
169 0.2
170 0.2
171 0.17
172 0.13
173 0.12
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.22
190 0.22
191 0.21
192 0.21
193 0.23
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.07
227 0.09
228 0.11
229 0.12
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.18
237 0.21
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.2
243 0.19
244 0.15
245 0.11
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.13
254 0.09
255 0.11
256 0.12
257 0.18
258 0.24
259 0.33
260 0.36
261 0.43
262 0.45
263 0.48
264 0.54
265 0.58
266 0.55
267 0.54
268 0.53
269 0.49
270 0.49
271 0.5
272 0.52
273 0.45
274 0.47
275 0.4
276 0.38
277 0.35
278 0.33
279 0.29
280 0.18
281 0.16
282 0.11
283 0.12
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.14
291 0.13
292 0.15
293 0.17
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.2
305 0.19
306 0.23
307 0.28
308 0.36
309 0.41
310 0.49
311 0.56
312 0.55
313 0.59
314 0.59
315 0.52
316 0.47
317 0.46
318 0.36
319 0.27
320 0.27
321 0.23
322 0.22
323 0.25
324 0.22
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.15
329 0.19
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.22
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.16
338 0.11
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.19
356 0.22
357 0.27
358 0.27
359 0.28
360 0.26
361 0.26
362 0.26
363 0.24
364 0.21
365 0.19
366 0.21
367 0.21
368 0.21
369 0.2
370 0.16
371 0.13
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.18
381 0.19
382 0.21
383 0.2
384 0.24
385 0.3
386 0.3
387 0.31
388 0.31
389 0.33
390 0.32
391 0.39
392 0.38
393 0.33
394 0.33
395 0.33
396 0.3
397 0.29
398 0.35
399 0.34
400 0.38
401 0.36
402 0.37
403 0.45
404 0.54
405 0.6
406 0.62
407 0.65
408 0.67
409 0.75
410 0.82
411 0.81
412 0.81
413 0.74
414 0.69
415 0.64
416 0.63
417 0.56