FuNGI

A0A4Q4TL49

Protein Details

Accession

A0A4Q4TL49

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
305-329	EYNTVRRKFNEAKQRRKDAEKRLKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
317-322	KQRRKD

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MPSLAPRRRSRAHFEEDEDESSGSDTPKKQKLNGDHGVLDEEDSEGDIDGGDDSFANAGNRRRRTAGNAKGNDGEFQPGAIVRVMVDNFVTYEHAEFLPGPNLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGYHPKHLGRASNVGEFVKHGKDTATIEVELQKRPGEPSNHIVRVRINREDNSRKWWLNGKEASHKAVQSVTRNLRIQIDNLCQFLPQDKVAEFAGLTPIQLLHETLRAAAPEQMINEQSALHDLHKDYKKVKEQVEMTAETLKGHENRQQGVQGDVDRMRQREEIEKEIEELRKARTVVEYNTVRRKFNEAKQRRKDAEKRLKELEMACGPALQAVNEKKTYRDKMVPVIAQRKNALKNAETAVDQLFRDIEAQDDRIKHLGNKREAEAKSFQAKKAQIGKIRKSITDLEAKLKNKPPEFSPAEWNLKIRQKDSILRDNEKAKREIMDRIQQLKARGRAKTDEIKEVLRSRKELESAQGQQLALLKKINPDAAAGWAWLQEHQDEFEKEVSGPPMITCSVKDDRYSDLVQSLLQRDDFFCFTTQTRHDHKKLSAKFYGELGISVTIRTCGSPFASFRPPIPIEQAQEMGLDRYAIDLIDGPEPVLAMLCAEKRLHASGVSLGDITDAQYQQLVNGERISNWAAGQIMYRITRRREYGAGAVSTTTRKVIPGSFWKDQLPDDGESARLQQRHDELRDEVEELKRALQELNNKIQGINEGEEQVREEIDNLKRQKNDLQRAATQYESLGTKIEIEKRAQDTAQDELGAARQRVLDIRAQEDQLVIERARSVLKHKEQLSRIRDAHQALLEAQIRLIEANSDVQALEAQNEDIKSRLDREKADISLAKTELDRLRDEAKTAQEKVQEAIADGHGMLEKLNELSEGKTVEDIDGDIEAKSANLGVLHRVDPQVLRQFEKRARDIQDLTRRKEELTHKLEGLSGQIEELMQRWEPKADELVSRINEAFSHNFEQISCAGEVGIHKDEDFEQWAIEIKVKFREHETLQQLNQHRQSGGERAVSTIFYLMALQSMAQAPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERMVEIACREHTSQYFLITPKLLTGLRYDPRMRVLCIASGEHVPPEGRKLDFRRLVRIQRAVKAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.66
3	0.62
4	0.57
5	0.5
6	0.41
7	0.32
8	0.26
9	0.23
10	0.19
11	0.2
12	0.24
13	0.3
14	0.39
15	0.43
16	0.48
17	0.55
18	0.63
19	0.67
20	0.69
21	0.66
22	0.59
23	0.56
24	0.53
25	0.43
26	0.34
27	0.25
28	0.17
29	0.12
30	0.1
31	0.1
32	0.07
33	0.07
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.05
40	0.05
41	0.06
42	0.08
43	0.09
44	0.13
45	0.21
46	0.3
47	0.36
48	0.4
49	0.43
50	0.46
51	0.53
52	0.59
53	0.62
54	0.64
55	0.63
56	0.63
57	0.64
58	0.61
59	0.53
60	0.43
61	0.37
62	0.26
63	0.22
64	0.19
65	0.14
66	0.15
67	0.13
68	0.12
69	0.08
70	0.13
71	0.13
72	0.12
73	0.12
74	0.11
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.09
79	0.1
80	0.12
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.14
85	0.18
86	0.18
87	0.17
88	0.16
89	0.16
90	0.15
91	0.16
92	0.14
93	0.1
94	0.09
95	0.1
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.11
102	0.13
103	0.16
104	0.14
105	0.14
106	0.14
107	0.13
108	0.13
109	0.12
110	0.11
111	0.1
112	0.18
113	0.19
114	0.22
115	0.27
116	0.27
117	0.3
118	0.32
119	0.35
120	0.32
121	0.38
122	0.38
123	0.37
124	0.39
125	0.36
126	0.34
127	0.3
128	0.29
129	0.25
130	0.21
131	0.18
132	0.16
133	0.19
134	0.22
135	0.25
136	0.24
137	0.21
138	0.22
139	0.28
140	0.3
141	0.29
142	0.28
143	0.24
144	0.22
145	0.25
146	0.31
147	0.29
148	0.32
149	0.38
150	0.46
151	0.52
152	0.51
153	0.49
154	0.49
155	0.54
156	0.55
157	0.55
158	0.5
159	0.48
160	0.58
161	0.65
162	0.61
163	0.59
164	0.61
165	0.54
166	0.52
167	0.56
168	0.51
169	0.52
170	0.54
171	0.52
172	0.54
173	0.56
174	0.56
175	0.51
176	0.47
177	0.39
178	0.38
179	0.37
180	0.33
181	0.39
182	0.42
183	0.45
184	0.46
185	0.46
186	0.48
187	0.44
188	0.41
189	0.38
190	0.4
191	0.35
192	0.35
193	0.33
194	0.27
195	0.26
196	0.26
197	0.23
198	0.16
199	0.16
200	0.15
201	0.17
202	0.17
203	0.17
204	0.14
205	0.11
206	0.14
207	0.12
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.08
215	0.1
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.11
220	0.12
221	0.14
222	0.14
223	0.13
224	0.14
225	0.15
226	0.15
227	0.15
228	0.14
229	0.12
230	0.1
231	0.12
232	0.12
233	0.1
234	0.13
235	0.13
236	0.23
237	0.27
238	0.31
239	0.33
240	0.4
241	0.49
242	0.53
243	0.55
244	0.54
245	0.51
246	0.54
247	0.55
248	0.48
249	0.4
250	0.37
251	0.33
252	0.25
253	0.24
254	0.21
255	0.18
256	0.19
257	0.24
258	0.24
259	0.26
260	0.28
261	0.31
262	0.28
263	0.28
264	0.28
265	0.23
266	0.24
267	0.23
268	0.26
269	0.26
270	0.26
271	0.27
272	0.27
273	0.28
274	0.32
275	0.35
276	0.34
277	0.34
278	0.34
279	0.33
280	0.35
281	0.35
282	0.29
283	0.26
284	0.23
285	0.24
286	0.24
287	0.23
288	0.24
289	0.26
290	0.26
291	0.33
292	0.36
293	0.38
294	0.48
295	0.49
296	0.45
297	0.43
298	0.49
299	0.47
300	0.5
301	0.55
302	0.56
303	0.64
304	0.72
305	0.8
306	0.77
307	0.79
308	0.8
309	0.8
310	0.81
311	0.79
312	0.75
313	0.71
314	0.67
315	0.6
316	0.52
317	0.47
318	0.38
319	0.31
320	0.25
321	0.21
322	0.19
323	0.18
324	0.17
325	0.1
326	0.14
327	0.15
328	0.19
329	0.22
330	0.23
331	0.25
332	0.33
333	0.37
334	0.37
335	0.4
336	0.4
337	0.43
338	0.49
339	0.48
340	0.47
341	0.52
342	0.49
343	0.46
344	0.45
345	0.44
346	0.42
347	0.43
348	0.39
349	0.31
350	0.31
351	0.3
352	0.29
353	0.24
354	0.21
355	0.19
356	0.17
357	0.16
358	0.13
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.11
366	0.14
367	0.15
368	0.16
369	0.17
370	0.18
371	0.2
372	0.25
373	0.32
374	0.35
375	0.37
376	0.38
377	0.44
378	0.44
379	0.44
380	0.41
381	0.37
382	0.39
383	0.39
384	0.38
385	0.36
386	0.37
387	0.39
388	0.45
389	0.46
390	0.46
391	0.51
392	0.56
393	0.57
394	0.58
395	0.52
396	0.46
397	0.44
398	0.39
399	0.39
400	0.35
401	0.32
402	0.37
403	0.37
404	0.4
405	0.43
406	0.46
407	0.41
408	0.41
409	0.37
410	0.4
411	0.44
412	0.4
413	0.4
414	0.41
415	0.44
416	0.43
417	0.42
418	0.39
419	0.4
420	0.4
421	0.34
422	0.32
423	0.31
424	0.37
425	0.41
426	0.44
427	0.44
428	0.45
429	0.48
430	0.52
431	0.53
432	0.5
433	0.46
434	0.38
435	0.36
436	0.34
437	0.36
438	0.34
439	0.36
440	0.37
441	0.39
442	0.42
443	0.4
444	0.43
445	0.43
446	0.45
447	0.41
448	0.38
449	0.37
450	0.37
451	0.4
452	0.44
453	0.4
454	0.38
455	0.35
456	0.35
457	0.35
458	0.38
459	0.38
460	0.32
461	0.31
462	0.28
463	0.29
464	0.3
465	0.27
466	0.25
467	0.26
468	0.27
469	0.27
470	0.26
471	0.23
472	0.22
473	0.25
474	0.23
475	0.17
476	0.15
477	0.14
478	0.14
479	0.16
480	0.16
481	0.12
482	0.12
483	0.11
484	0.12
485	0.12
486	0.1
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.07
494	0.08
495	0.1
496	0.1
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.11
501	0.13
502	0.12
503	0.1
504	0.09
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.12
511	0.15
512	0.16
513	0.17
514	0.17
515	0.19
516	0.22
517	0.22
518	0.17
519	0.15
520	0.14
521	0.14
522	0.14
523	0.14
524	0.11
525	0.11
526	0.1
527	0.1
528	0.12
529	0.12
530	0.11
531	0.1
532	0.11
533	0.11
534	0.15
535	0.16
536	0.2
537	0.26
538	0.32
539	0.34
540	0.37
541	0.41
542	0.47
543	0.49
544	0.5
545	0.47
546	0.41
547	0.39
548	0.35
549	0.33
550	0.23
551	0.18
552	0.13
553	0.1
554	0.09
555	0.08
556	0.07
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.07
563	0.09
564	0.1
565	0.14
566	0.18
567	0.18
568	0.18
569	0.24
570	0.24
571	0.22
572	0.27
573	0.25
574	0.22
575	0.23
576	0.23
577	0.17
578	0.16
579	0.16
580	0.11
581	0.08
582	0.07
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.06
590	0.07
591	0.07
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.05
597	0.03
598	0.03
599	0.04
600	0.04
601	0.06
602	0.06
603	0.07
604	0.08
605	0.09
606	0.1
607	0.09
608	0.09
609	0.1
610	0.11
611	0.11
612	0.1
613	0.08
614	0.08
615	0.08
616	0.08
617	0.08
618	0.07
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.11
624	0.11
625	0.1
626	0.11
627	0.12
628	0.11
629	0.13
630	0.14
631	0.11
632	0.1
633	0.1
634	0.08
635	0.08
636	0.09
637	0.08
638	0.08
639	0.1
640	0.12
641	0.16
642	0.19
643	0.22
644	0.24
645	0.26
646	0.26
647	0.27
648	0.29
649	0.28
650	0.26
651	0.22
652	0.2
653	0.18
654	0.17
655	0.15
656	0.11
657	0.08
658	0.08
659	0.09
660	0.1
661	0.14
662	0.22
663	0.29
664	0.3
665	0.31
666	0.32
667	0.32
668	0.31
669	0.3
670	0.24
671	0.18
672	0.17
673	0.16
674	0.16
675	0.15
676	0.18
677	0.17
678	0.16
679	0.15
680	0.17
681	0.22
682	0.27
683	0.28
684	0.28
685	0.26
686	0.27
687	0.27
688	0.26
689	0.23
690	0.19
691	0.19
692	0.16
693	0.17
694	0.14
695	0.14
696	0.14
697	0.14
698	0.21
699	0.25
700	0.31
701	0.32
702	0.32
703	0.31
704	0.3
705	0.29
706	0.24
707	0.2
708	0.14
709	0.13
710	0.13
711	0.13
712	0.14
713	0.12
714	0.1
715	0.08
716	0.08
717	0.13
718	0.16
719	0.24
720	0.27
721	0.31
722	0.32
723	0.34
724	0.41
725	0.45
726	0.51
727	0.5
728	0.51
729	0.5
730	0.54
731	0.54
732	0.46
733	0.37
734	0.27
735	0.22
736	0.18
737	0.14
738	0.11
739	0.09
740	0.1
741	0.13
742	0.19
743	0.19
744	0.2
745	0.25
746	0.27
747	0.29
748	0.27
749	0.26
750	0.23
751	0.22
752	0.22
753	0.16
754	0.14
755	0.12
756	0.15
757	0.16
758	0.14
759	0.12
760	0.11
761	0.12
762	0.13
763	0.15
764	0.15
765	0.14
766	0.18
767	0.19
768	0.19
769	0.19
770	0.18
771	0.16
772	0.15
773	0.16
774	0.12
775	0.1
776	0.1
777	0.11
778	0.12
779	0.12
780	0.16
781	0.23
782	0.28
783	0.35
784	0.4
785	0.47
786	0.52
787	0.6
788	0.6
789	0.59
790	0.55
791	0.51
792	0.51
793	0.44
794	0.42
795	0.33
796	0.3
797	0.22
798	0.25
799	0.23
800	0.19
801	0.17
802	0.14
803	0.13
804	0.12
805	0.11
806	0.06
807	0.06
808	0.07
809	0.07
810	0.08
811	0.07
812	0.07
813	0.09
814	0.08
815	0.08
816	0.07
817	0.07
818	0.09
819	0.09
820	0.1
821	0.09
822	0.11
823	0.11
824	0.16
825	0.21
826	0.23
827	0.25
828	0.31
829	0.35
830	0.34
831	0.38
832	0.36
833	0.32
834	0.33
835	0.31
836	0.26
837	0.21
838	0.26
839	0.24
840	0.24
841	0.23
842	0.22
843	0.26
844	0.26
845	0.28
846	0.26
847	0.3
848	0.34
849	0.35
850	0.35
851	0.34
852	0.35
853	0.34
854	0.32
855	0.25
856	0.2
857	0.2
858	0.17
859	0.13
860	0.12
861	0.11
862	0.09
863	0.09
864	0.08
865	0.06
866	0.06
867	0.06
868	0.06
869	0.07
870	0.07
871	0.08
872	0.1
873	0.11
874	0.11
875	0.11
876	0.12
877	0.11
878	0.1
879	0.1
880	0.08
881	0.08
882	0.08
883	0.07
884	0.07
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.05
889	0.05
890	0.06
891	0.06
892	0.09
893	0.12
894	0.13
895	0.16
896	0.16
897	0.17
898	0.17
899	0.22
900	0.28
901	0.28
902	0.31
903	0.32
904	0.39
905	0.44
906	0.51
907	0.49
908	0.47
909	0.5
910	0.53
911	0.55
912	0.56
913	0.61
914	0.62
915	0.63
916	0.63
917	0.58
918	0.51
919	0.55
920	0.53
921	0.53
922	0.5
923	0.49
924	0.43
925	0.43
926	0.43
927	0.36
928	0.3
929	0.21
930	0.15
931	0.1
932	0.1
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.1
937	0.1
938	0.12
939	0.13
940	0.15
941	0.16
942	0.18
943	0.22
944	0.22
945	0.23
946	0.24
947	0.29
948	0.28
949	0.29
950	0.28
951	0.23
952	0.22
953	0.23
954	0.23
955	0.21
956	0.24
957	0.22
958	0.22
959	0.22
960	0.23
961	0.2
962	0.21
963	0.16
964	0.12
965	0.11
966	0.12
967	0.13
968	0.15
969	0.17
970	0.14
971	0.14
972	0.15
973	0.16
974	0.18
975	0.21
976	0.16
977	0.14
978	0.14
979	0.17
980	0.16
981	0.2
982	0.19
983	0.18
984	0.27
985	0.28
986	0.3
987	0.31
988	0.38
989	0.38
990	0.45
991	0.5
992	0.49
993	0.49
994	0.56
995	0.57
996	0.58
997	0.59
998	0.52
999	0.45
1000	0.4
1001	0.42
1002	0.41
1003	0.4
1004	0.36
1005	0.31
1006	0.3
1007	0.31
1008	0.28
1009	0.25
1010	0.19
1011	0.14
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.08
1015	0.07
1016	0.07
1017	0.06
1018	0.08
1019	0.1
1020	0.11
1021	0.11
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.13
1025	0.15
1026	0.15
1027	0.12
1028	0.14
1029	0.19
1030	0.21
1031	0.21
1032	0.2
1033	0.2
1034	0.21
1035	0.25
1036	0.25
1037	0.23
1038	0.28
1039	0.27
1040	0.3
1041	0.36
1042	0.38
1043	0.38
1044	0.37
1045	0.34
1046	0.31
1047	0.33
1048	0.32
1049	0.26
1050	0.25
1051	0.23
1052	0.24
1053	0.25
1054	0.26
1055	0.26
1056	0.3
1057	0.29
1058	0.28
1059	0.31
1060	0.29
1061	0.3
1062	0.27
1063	0.26
1064	0.21
1065	0.24
1066	0.22
1067	0.18
1068	0.22
1069	0.27
1070	0.3
1071	0.37
1072	0.39
1073	0.38
1074	0.45
1075	0.48
1076	0.45
1077	0.42
1078	0.4
1079	0.37
1080	0.37
1081	0.35
1082	0.29
1083	0.29
1084	0.28
1085	0.23
1086	0.23
1087	0.2
1088	0.19
1089	0.23
1090	0.24
1091	0.23
1092	0.31
1093	0.37
1094	0.45
1095	0.52
1096	0.54
1097	0.59
1098	0.64
1099	0.71
1100	0.72
1101	0.75
1102	0.71
1103	0.69

A0A4Q4TL49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer