Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Q4TK66

Protein Details
Accession A0A4Q4TK66    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-254EQERRQQQRQQQQRQQQQRQQQQQQHydrophilic
312-335ERGDTDKKRAAKRRINVAIREKKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-326KKRAAKRRI
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039693  Rtr1/RPAP2  
IPR007308  Rtr1/RPAP2_dom  
IPR038534  Rtr1/RPAP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0043175  F:RNA polymerase core enzyme binding  
GO:0008420  F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04181  RPAP2_Rtr1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51479  ZF_RTR1  
Amino Acid Sequences MASQTKKAPPKGILKKPTVAASPSPSSSAPAPASASASASASPSPQQKPDPREIAIQHAKIIHDRRALEDTITDSIILLAKLPTTKEPSPSPSRTIQKTTTTSSSASTSTSSTNDYSEQDAELFKSHVRLFQPSDYEALIEERNALGSCGYGLCGQPRTRLGPGAGGYKLLNWGRRDFAIVPRAEAERWCSRRCARRAMYVKVQLSETAAWERAGIETIRIELLEEQEAEQERRQQQRQQQQRQQQQRQQQQQQQQQQQQEERQRQQGVPEKEKSENEDAVAAAAAAAAQVARDETDRRQKAAKDAMDLALERGDTDKKRAAKRRINVAIREKKVVTEVREPSLAAGGGGDGHLVLDGYKTKFDPKSETINGHKGTSTIPNAKEEEDGKATE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.7
4 0.68
5 0.61
6 0.54
7 0.48
8 0.46
9 0.44
10 0.4
11 0.38
12 0.33
13 0.32
14 0.3
15 0.3
16 0.25
17 0.22
18 0.23
19 0.21
20 0.23
21 0.21
22 0.2
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.16
30 0.22
31 0.24
32 0.29
33 0.37
34 0.44
35 0.51
36 0.59
37 0.6
38 0.55
39 0.58
40 0.55
41 0.57
42 0.56
43 0.5
44 0.44
45 0.4
46 0.39
47 0.39
48 0.42
49 0.38
50 0.35
51 0.35
52 0.37
53 0.39
54 0.38
55 0.32
56 0.29
57 0.25
58 0.22
59 0.21
60 0.17
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.1
69 0.11
70 0.14
71 0.2
72 0.22
73 0.26
74 0.29
75 0.35
76 0.43
77 0.45
78 0.46
79 0.47
80 0.53
81 0.53
82 0.55
83 0.53
84 0.52
85 0.52
86 0.53
87 0.48
88 0.43
89 0.39
90 0.34
91 0.31
92 0.24
93 0.21
94 0.18
95 0.15
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.1
112 0.13
113 0.13
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.23
118 0.26
119 0.28
120 0.25
121 0.26
122 0.22
123 0.2
124 0.17
125 0.15
126 0.12
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.09
141 0.13
142 0.14
143 0.17
144 0.19
145 0.22
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.2
150 0.21
151 0.22
152 0.19
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.18
157 0.17
158 0.2
159 0.18
160 0.19
161 0.2
162 0.2
163 0.23
164 0.2
165 0.23
166 0.25
167 0.23
168 0.22
169 0.23
170 0.23
171 0.21
172 0.19
173 0.19
174 0.21
175 0.25
176 0.25
177 0.28
178 0.33
179 0.42
180 0.45
181 0.5
182 0.44
183 0.5
184 0.56
185 0.57
186 0.59
187 0.56
188 0.54
189 0.45
190 0.42
191 0.33
192 0.28
193 0.23
194 0.16
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.17
219 0.22
220 0.29
221 0.32
222 0.37
223 0.44
224 0.52
225 0.62
226 0.67
227 0.69
228 0.72
229 0.79
230 0.83
231 0.85
232 0.82
233 0.8
234 0.79
235 0.81
236 0.8
237 0.78
238 0.76
239 0.76
240 0.78
241 0.77
242 0.74
243 0.69
244 0.66
245 0.63
246 0.61
247 0.62
248 0.61
249 0.57
250 0.57
251 0.55
252 0.5
253 0.52
254 0.54
255 0.53
256 0.51
257 0.51
258 0.49
259 0.5
260 0.5
261 0.48
262 0.44
263 0.37
264 0.3
265 0.27
266 0.23
267 0.19
268 0.17
269 0.11
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.02
276 0.02
277 0.02
278 0.03
279 0.04
280 0.05
281 0.08
282 0.14
283 0.25
284 0.28
285 0.3
286 0.35
287 0.37
288 0.43
289 0.5
290 0.46
291 0.4
292 0.4
293 0.39
294 0.36
295 0.34
296 0.27
297 0.19
298 0.17
299 0.12
300 0.12
301 0.16
302 0.16
303 0.2
304 0.26
305 0.32
306 0.42
307 0.52
308 0.6
309 0.64
310 0.71
311 0.77
312 0.81
313 0.81
314 0.8
315 0.81
316 0.81
317 0.75
318 0.72
319 0.62
320 0.53
321 0.52
322 0.49
323 0.43
324 0.42
325 0.43
326 0.41
327 0.42
328 0.4
329 0.35
330 0.32
331 0.26
332 0.16
333 0.12
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.07
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.06
344 0.1
345 0.12
346 0.14
347 0.16
348 0.23
349 0.27
350 0.31
351 0.37
352 0.37
353 0.45
354 0.49
355 0.55
356 0.55
357 0.6
358 0.58
359 0.52
360 0.48
361 0.39
362 0.36
363 0.37
364 0.38
365 0.36
366 0.37
367 0.4
368 0.41
369 0.42
370 0.44
371 0.38
372 0.36