Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4STW0

Protein Details
Accession A0A4Q4STW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
402-424AITKPTRVKRPPSHGEKPKPEDHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-420TKPTRVKRPPSHGEKPK
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 7, cysk 7, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017896  4Fe4S_Fe-S-bd  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51379  4FE4S_FER_2  
PS50280  SET  
PS50865  ZF_MYND_2  
CDD cd20071  SET_SMYD  
Amino Acid Sequences MDPSPGNQGGFHEDAQLCQYILGGITTMHPLEIRQSQITQAGSGLFAMNDVLEGQEIFRSSPLVECVADEVADSVCDWCYTNKLSRVHPSGRFRTKEDVAPDMEACRGCGRCYYCSRSCQDEAWEAYHKHECELLCRELRVRSLRPIKAGEELLQCYTDVTCDVLMRRKRLKDQFFFDCTCPRCEREFESHKRRTFNDMSEVEFVRKTQEALTELINSAIIKMKTSPDGLPLVELEARGRSLVNDAFPGSRWPDSLDPVPLLYKRLGNMHLLRGSGVAAFQCSIKGCAYTDWKLGPEWVNDLHDLIRIMTAIVIQPSAREVFRDKHFLSSREFWDVYHGFLHTLLLTSQNTFGSDASYTRAIKTCFWIPRVIDSVMAPAVKKSVSTGQSSSTENSVSRKGGAITKPTRVKRPPSHGEKPKPEDHALSPDKAVPVQKQKPFDRNHIKLLIDLAPDMLKDYIKSCGPIYTFKKDEVEEQTDVEEGPLPPIKDHITVYDGEQDEFPDLYLLPLPALLNWPELGLGVHREPCERRIVLEEKAMGPFDTFGGDRGECERRWRGVDDYQWIEVDAHEDIGMPWGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.26
4 0.2
5 0.17
6 0.17
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.07
11 0.06
12 0.08
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.1
18 0.15
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.23
23 0.25
24 0.3
25 0.3
26 0.25
27 0.22
28 0.18
29 0.16
30 0.15
31 0.13
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.12
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.09
65 0.09
66 0.13
67 0.17
68 0.23
69 0.3
70 0.34
71 0.39
72 0.47
73 0.53
74 0.57
75 0.61
76 0.64
77 0.67
78 0.72
79 0.7
80 0.65
81 0.66
82 0.62
83 0.59
84 0.53
85 0.48
86 0.4
87 0.39
88 0.36
89 0.29
90 0.28
91 0.23
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.17
96 0.22
97 0.25
98 0.28
99 0.35
100 0.42
101 0.43
102 0.5
103 0.53
104 0.54
105 0.53
106 0.49
107 0.46
108 0.44
109 0.41
110 0.38
111 0.4
112 0.34
113 0.35
114 0.39
115 0.34
116 0.29
117 0.3
118 0.26
119 0.26
120 0.31
121 0.33
122 0.29
123 0.29
124 0.31
125 0.3
126 0.36
127 0.37
128 0.34
129 0.39
130 0.46
131 0.47
132 0.49
133 0.5
134 0.45
135 0.43
136 0.41
137 0.36
138 0.31
139 0.3
140 0.27
141 0.24
142 0.22
143 0.18
144 0.17
145 0.12
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.1
151 0.18
152 0.23
153 0.29
154 0.36
155 0.4
156 0.49
157 0.57
158 0.65
159 0.64
160 0.67
161 0.67
162 0.65
163 0.63
164 0.56
165 0.53
166 0.46
167 0.43
168 0.39
169 0.35
170 0.33
171 0.34
172 0.36
173 0.39
174 0.47
175 0.52
176 0.59
177 0.65
178 0.66
179 0.66
180 0.64
181 0.62
182 0.57
183 0.51
184 0.5
185 0.42
186 0.41
187 0.41
188 0.39
189 0.32
190 0.27
191 0.23
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.1
205 0.09
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.15
242 0.17
243 0.16
244 0.14
245 0.14
246 0.16
247 0.13
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.15
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.21
259 0.2
260 0.17
261 0.16
262 0.11
263 0.1
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.1
275 0.14
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.13
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.07
305 0.06
306 0.07
307 0.1
308 0.15
309 0.18
310 0.24
311 0.24
312 0.31
313 0.34
314 0.35
315 0.37
316 0.37
317 0.36
318 0.34
319 0.34
320 0.26
321 0.29
322 0.28
323 0.24
324 0.2
325 0.18
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.09
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.16
348 0.16
349 0.17
350 0.2
351 0.25
352 0.26
353 0.27
354 0.3
355 0.27
356 0.3
357 0.33
358 0.3
359 0.23
360 0.19
361 0.19
362 0.17
363 0.17
364 0.13
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.14
371 0.16
372 0.2
373 0.21
374 0.23
375 0.25
376 0.27
377 0.26
378 0.21
379 0.19
380 0.17
381 0.19
382 0.18
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.16
387 0.21
388 0.23
389 0.3
390 0.3
391 0.38
392 0.45
393 0.48
394 0.55
395 0.55
396 0.62
397 0.62
398 0.68
399 0.7
400 0.72
401 0.79
402 0.8
403 0.84
404 0.84
405 0.81
406 0.77
407 0.73
408 0.66
409 0.59
410 0.51
411 0.51
412 0.45
413 0.4
414 0.35
415 0.31
416 0.3
417 0.28
418 0.28
419 0.25
420 0.32
421 0.39
422 0.43
423 0.49
424 0.55
425 0.61
426 0.63
427 0.68
428 0.68
429 0.65
430 0.67
431 0.63
432 0.57
433 0.49
434 0.48
435 0.4
436 0.3
437 0.25
438 0.19
439 0.14
440 0.14
441 0.14
442 0.12
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.13
447 0.14
448 0.16
449 0.15
450 0.18
451 0.2
452 0.28
453 0.33
454 0.37
455 0.38
456 0.39
457 0.42
458 0.38
459 0.43
460 0.41
461 0.41
462 0.34
463 0.33
464 0.31
465 0.28
466 0.27
467 0.21
468 0.17
469 0.11
470 0.14
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.19
475 0.21
476 0.2
477 0.21
478 0.19
479 0.18
480 0.19
481 0.2
482 0.26
483 0.24
484 0.22
485 0.22
486 0.2
487 0.19
488 0.19
489 0.17
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.11
494 0.1
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.1
508 0.13
509 0.15
510 0.19
511 0.2
512 0.25
513 0.27
514 0.29
515 0.36
516 0.32
517 0.31
518 0.34
519 0.38
520 0.37
521 0.4
522 0.4
523 0.34
524 0.36
525 0.35
526 0.27
527 0.23
528 0.21
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.15
534 0.15
535 0.16
536 0.2
537 0.26
538 0.24
539 0.32
540 0.37
541 0.38
542 0.42
543 0.45
544 0.45
545 0.48
546 0.53
547 0.54
548 0.52
549 0.49
550 0.45
551 0.42
552 0.36
553 0.28
554 0.24
555 0.16
556 0.12
557 0.1
558 0.1
559 0.09