Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G9MDR0

Protein Details
Accession G9MDR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-72GVAPRAKMNQQRARRFRTALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
874-896RGGRGRGRGGRGRGGGNPNRGRG
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 12, nucl 9, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR041385  SH3_12  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041106  XRN1_D2_D3  
IPR040486  Xrn1_D3  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR047008  XRN1_SH3_sf  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF18129  SH3_12  
PF18332  XRN1_D1  
PF18334  XRN1_D2_D3  
PF18194  Xrn1_D3  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MNGIIHNCTHKDAGEDATFRLSEEEMFIRIFNYIEHLFGKIKPKKLFFMAIDGVAPRAKMNQQRARRFRTALDAEKAREKAIREGIELPKEEPFDSNCITPGTEFMAKLSQQLRYFVNKKVSEDTDWQGCDIVLSGHEVPGEGEHKIMEYIRNAKAQPNYDPNARNGFGVPIKFTYSPEVNFVYPSPLPGIFPEVQYCRCIENIFDLPNVEGLEYVSGLTNGALINIKALAGFPTLHTLPYSAQLVEGAGVNVFQQDSRNPSVIVTLTDTEMRTKVGTWKSKLGKRCFVGYPFLQEAKVIKVQDELFTYELAENEQDIITKDHSNRDAADYAKEAEFLENWHAKRLGITVGQVECLVHVHMLKGLIRTEEGALIKEYAENPSLRKVYAAQTIVEEVVNEDERFIERPALPIEEEFPQGTRAFFLGEFAYGRPLEVMGHVNGKANIVVSVPKNKEPEITKQMIFQAERNNPYTPSFAIAKKLGIHPLILSKITSSFQVISSAGLKLNLGLNLKFEGRKLKVLGYSRKSETGWEFSNQAVKLIAEYMVAFPDFFAAIQREPQKSETYETDLWNDPSVAPQRIKDIVAWLKKQETSKFERVPLDAEQLDSEVVMALAKAGEQLHQASLEATAKTLNSVPRTALLKPADAEMVLGNQSFKLGDRVTFVAAAGKVPIATRGTVAGISRTATAVLLDVVWDVPFMSGTTLGERAPMFRGQTVSSSTVLNTTNWQVVSASSKSRQRRTVPATSSTGSYGSVGVTQYKDAPAPPALRGGWRGAAVGDSGRGQSGPNRGAARGGKPNLLHSTLVYRPGPQGGNPGGDDVNKAQNGNHVNGRGGSGRGQGRGRGNGGNRGSPAPQAGGRDYTNVPPPANLEASRGGRGRGRGGRGRGGGNPNRGRGGAVANQAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.26
4 0.29
5 0.28
6 0.25
7 0.24
8 0.19
9 0.14
10 0.16
11 0.17
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.1
19 0.14
20 0.13
21 0.15
22 0.16
23 0.18
24 0.19
25 0.24
26 0.34
27 0.36
28 0.43
29 0.49
30 0.52
31 0.55
32 0.58
33 0.62
34 0.53
35 0.54
36 0.48
37 0.42
38 0.39
39 0.34
40 0.3
41 0.23
42 0.22
43 0.14
44 0.15
45 0.21
46 0.28
47 0.38
48 0.46
49 0.56
50 0.66
51 0.75
52 0.8
53 0.8
54 0.75
55 0.68
56 0.69
57 0.67
58 0.63
59 0.62
60 0.59
61 0.55
62 0.59
63 0.57
64 0.48
65 0.43
66 0.38
67 0.38
68 0.41
69 0.4
70 0.36
71 0.42
72 0.46
73 0.49
74 0.48
75 0.41
76 0.37
77 0.36
78 0.34
79 0.29
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.25
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.22
94 0.21
95 0.26
96 0.28
97 0.29
98 0.28
99 0.31
100 0.33
101 0.37
102 0.41
103 0.42
104 0.49
105 0.46
106 0.47
107 0.51
108 0.51
109 0.46
110 0.48
111 0.46
112 0.42
113 0.4
114 0.37
115 0.31
116 0.26
117 0.22
118 0.17
119 0.13
120 0.07
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.15
137 0.22
138 0.25
139 0.29
140 0.3
141 0.34
142 0.39
143 0.4
144 0.42
145 0.44
146 0.44
147 0.47
148 0.49
149 0.47
150 0.48
151 0.45
152 0.39
153 0.32
154 0.32
155 0.29
156 0.27
157 0.25
158 0.2
159 0.23
160 0.23
161 0.24
162 0.25
163 0.24
164 0.24
165 0.25
166 0.27
167 0.23
168 0.24
169 0.23
170 0.22
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.15
175 0.16
176 0.15
177 0.21
178 0.17
179 0.18
180 0.21
181 0.22
182 0.23
183 0.24
184 0.24
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.15
189 0.18
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.2
194 0.19
195 0.2
196 0.2
197 0.13
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.15
228 0.16
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.07
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.08
244 0.13
245 0.16
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.19
250 0.18
251 0.18
252 0.15
253 0.13
254 0.12
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.18
263 0.24
264 0.31
265 0.33
266 0.41
267 0.49
268 0.54
269 0.61
270 0.61
271 0.61
272 0.56
273 0.58
274 0.53
275 0.47
276 0.47
277 0.4
278 0.38
279 0.33
280 0.32
281 0.27
282 0.24
283 0.22
284 0.21
285 0.24
286 0.18
287 0.15
288 0.18
289 0.19
290 0.2
291 0.2
292 0.18
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.09
306 0.1
307 0.14
308 0.15
309 0.19
310 0.21
311 0.21
312 0.21
313 0.23
314 0.23
315 0.21
316 0.21
317 0.17
318 0.18
319 0.16
320 0.16
321 0.13
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.14
326 0.17
327 0.17
328 0.2
329 0.2
330 0.19
331 0.19
332 0.2
333 0.17
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.12
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.16
369 0.16
370 0.15
371 0.15
372 0.15
373 0.17
374 0.22
375 0.22
376 0.18
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.16
381 0.12
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.09
390 0.09
391 0.11
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.13
399 0.11
400 0.12
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.07
410 0.08
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.07
422 0.08
423 0.07
424 0.09
425 0.09
426 0.1
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.08
434 0.09
435 0.15
436 0.17
437 0.2
438 0.21
439 0.21
440 0.25
441 0.25
442 0.31
443 0.31
444 0.33
445 0.3
446 0.3
447 0.32
448 0.31
449 0.29
450 0.24
451 0.25
452 0.26
453 0.28
454 0.3
455 0.28
456 0.26
457 0.27
458 0.26
459 0.18
460 0.17
461 0.17
462 0.15
463 0.17
464 0.17
465 0.16
466 0.17
467 0.17
468 0.17
469 0.15
470 0.15
471 0.12
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.09
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.17
502 0.17
503 0.2
504 0.21
505 0.22
506 0.26
507 0.32
508 0.4
509 0.37
510 0.4
511 0.39
512 0.4
513 0.38
514 0.36
515 0.32
516 0.28
517 0.26
518 0.22
519 0.22
520 0.2
521 0.25
522 0.21
523 0.19
524 0.15
525 0.12
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.04
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.12
543 0.17
544 0.18
545 0.2
546 0.22
547 0.24
548 0.24
549 0.27
550 0.24
551 0.26
552 0.28
553 0.27
554 0.28
555 0.27
556 0.26
557 0.24
558 0.22
559 0.15
560 0.17
561 0.2
562 0.2
563 0.18
564 0.18
565 0.21
566 0.23
567 0.23
568 0.19
569 0.22
570 0.26
571 0.31
572 0.32
573 0.3
574 0.31
575 0.34
576 0.38
577 0.36
578 0.34
579 0.37
580 0.44
581 0.46
582 0.47
583 0.47
584 0.44
585 0.42
586 0.37
587 0.34
588 0.25
589 0.22
590 0.18
591 0.16
592 0.15
593 0.11
594 0.09
595 0.05
596 0.04
597 0.04
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.07
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.08
611 0.1
612 0.11
613 0.1
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.13
619 0.15
620 0.15
621 0.16
622 0.16
623 0.2
624 0.23
625 0.22
626 0.26
627 0.24
628 0.23
629 0.23
630 0.23
631 0.2
632 0.17
633 0.17
634 0.1
635 0.09
636 0.08
637 0.08
638 0.07
639 0.06
640 0.07
641 0.07
642 0.07
643 0.1
644 0.1
645 0.1
646 0.13
647 0.15
648 0.16
649 0.16
650 0.15
651 0.15
652 0.14
653 0.13
654 0.11
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.12
659 0.09
660 0.09
661 0.1
662 0.1
663 0.11
664 0.12
665 0.12
666 0.11
667 0.1
668 0.11
669 0.11
670 0.1
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.07
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.04
683 0.04
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.06
688 0.06
689 0.08
690 0.09
691 0.09
692 0.11
693 0.11
694 0.12
695 0.14
696 0.16
697 0.16
698 0.17
699 0.19
700 0.17
701 0.2
702 0.22
703 0.22
704 0.2
705 0.19
706 0.17
707 0.19
708 0.19
709 0.17
710 0.16
711 0.16
712 0.18
713 0.17
714 0.18
715 0.15
716 0.15
717 0.19
718 0.19
719 0.22
720 0.24
721 0.32
722 0.4
723 0.47
724 0.54
725 0.54
726 0.62
727 0.66
728 0.69
729 0.67
730 0.65
731 0.62
732 0.55
733 0.51
734 0.42
735 0.35
736 0.25
737 0.21
738 0.15
739 0.11
740 0.11
741 0.1
742 0.12
743 0.12
744 0.13
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.17
750 0.2
751 0.21
752 0.21
753 0.24
754 0.24
755 0.25
756 0.27
757 0.26
758 0.24
759 0.22
760 0.22
761 0.17
762 0.17
763 0.15
764 0.13
765 0.11
766 0.1
767 0.1
768 0.1
769 0.1
770 0.1
771 0.14
772 0.21
773 0.21
774 0.26
775 0.27
776 0.27
777 0.33
778 0.36
779 0.38
780 0.4
781 0.41
782 0.4
783 0.39
784 0.45
785 0.44
786 0.43
787 0.37
788 0.29
789 0.32
790 0.3
791 0.35
792 0.3
793 0.27
794 0.26
795 0.31
796 0.31
797 0.25
798 0.3
799 0.27
800 0.3
801 0.28
802 0.28
803 0.24
804 0.24
805 0.25
806 0.21
807 0.25
808 0.23
809 0.23
810 0.21
811 0.27
812 0.3
813 0.32
814 0.34
815 0.28
816 0.29
817 0.29
818 0.31
819 0.27
820 0.25
821 0.23
822 0.25
823 0.26
824 0.3
825 0.32
826 0.35
827 0.39
828 0.42
829 0.43
830 0.43
831 0.43
832 0.47
833 0.48
834 0.46
835 0.43
836 0.41
837 0.39
838 0.34
839 0.32
840 0.27
841 0.26
842 0.25
843 0.26
844 0.27
845 0.27
846 0.29
847 0.29
848 0.31
849 0.36
850 0.36
851 0.33
852 0.3
853 0.32
854 0.32
855 0.34
856 0.3
857 0.26
858 0.3
859 0.33
860 0.37
861 0.35
862 0.33
863 0.34
864 0.36
865 0.41
866 0.41
867 0.46
868 0.49
869 0.54
870 0.59
871 0.59
872 0.59
873 0.58
874 0.61
875 0.6
876 0.62
877 0.63
878 0.59
879 0.58
880 0.54
881 0.48
882 0.4
883 0.38
884 0.34