Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1X9A2

Protein Details
Accession A0A4V1X9A2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30APPPGPGKKSPPQGRNNKSPFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
496-507GRRGGGERAPRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR027528  eIF3m  
IPR040750  eIF3m_C_helix  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0071541  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF18005  eIF3m_C_helix  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSSGADGHAPPPGPGKKSPPQGRNNKSPFVAQLQDIEEVSEPETVKQEQRVEPHSRDSNSLTAPDGTRELIEAATSILQKMAAPYQPQLVFVDGSFADLAQEMADYLQIGDEARPLLEKDDKDEVLKKIIMASPALNARPEKEFTSAYNLLVYLVLQSENIDKLLPRVADNLTKPVTSSPVNGPGLALNALSNIFNLLQPDNRLRYNVFGAIMRFVKQNGFFDNIKRYLPNLDVWFQQWETNVEDQRKLYELIADAAHESGDEKASYEYLLKALRLFEEGELKSEEAQRLSLRAVKTALLAPTHFDFQDLLVLPAVQALSDSHPVYFELLEIFAEKDLEDYNDFGEEHEGFVEKEHLDGEKLHRKMRLLTFASLAASISSREIPYNSIAKALQIPTEEVELWTIDVIRSGLVEGKLSQQKQVFLVHRTTYRVFGEKQWRELGDRIDSWRSVLRNVATNLRKEQANAEAQRKREQDELERKMANVGFSGGQGGPGGGRRGGGERAPRKERTDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.43
3 0.47
4 0.58
5 0.67
6 0.68
7 0.73
8 0.79
9 0.84
10 0.86
11 0.84
12 0.8
13 0.72
14 0.65
15 0.59
16 0.55
17 0.5
18 0.4
19 0.37
20 0.33
21 0.33
22 0.29
23 0.26
24 0.2
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.27
34 0.32
35 0.33
36 0.39
37 0.45
38 0.49
39 0.5
40 0.55
41 0.56
42 0.52
43 0.51
44 0.49
45 0.46
46 0.41
47 0.39
48 0.32
49 0.28
50 0.27
51 0.25
52 0.23
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.15
57 0.12
58 0.11
59 0.09
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.15
69 0.15
70 0.17
71 0.19
72 0.25
73 0.25
74 0.27
75 0.26
76 0.23
77 0.2
78 0.18
79 0.2
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.09
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.11
104 0.16
105 0.16
106 0.2
107 0.26
108 0.26
109 0.29
110 0.33
111 0.32
112 0.31
113 0.31
114 0.26
115 0.24
116 0.25
117 0.23
118 0.19
119 0.18
120 0.17
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.18
125 0.19
126 0.21
127 0.22
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.21
132 0.29
133 0.28
134 0.25
135 0.23
136 0.21
137 0.18
138 0.17
139 0.15
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.14
155 0.15
156 0.2
157 0.21
158 0.25
159 0.23
160 0.22
161 0.22
162 0.2
163 0.21
164 0.17
165 0.19
166 0.17
167 0.23
168 0.24
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.2
173 0.17
174 0.14
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.11
187 0.15
188 0.17
189 0.18
190 0.19
191 0.18
192 0.19
193 0.2
194 0.19
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.15
201 0.13
202 0.12
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.14
207 0.18
208 0.18
209 0.2
210 0.26
211 0.25
212 0.24
213 0.23
214 0.21
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.18
222 0.19
223 0.17
224 0.17
225 0.14
226 0.13
227 0.14
228 0.17
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.17
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.11
274 0.13
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.12
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.13
296 0.11
297 0.11
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.07
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.08
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.12
346 0.18
347 0.25
348 0.27
349 0.3
350 0.32
351 0.33
352 0.39
353 0.42
354 0.44
355 0.39
356 0.38
357 0.37
358 0.35
359 0.34
360 0.27
361 0.22
362 0.12
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.15
372 0.19
373 0.17
374 0.18
375 0.18
376 0.18
377 0.22
378 0.21
379 0.19
380 0.16
381 0.17
382 0.16
383 0.18
384 0.17
385 0.13
386 0.13
387 0.11
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.1
401 0.18
402 0.25
403 0.25
404 0.3
405 0.29
406 0.3
407 0.32
408 0.39
409 0.36
410 0.33
411 0.37
412 0.37
413 0.37
414 0.4
415 0.39
416 0.36
417 0.35
418 0.36
419 0.33
420 0.37
421 0.45
422 0.45
423 0.48
424 0.49
425 0.47
426 0.46
427 0.48
428 0.44
429 0.39
430 0.37
431 0.37
432 0.37
433 0.35
434 0.34
435 0.35
436 0.31
437 0.27
438 0.29
439 0.27
440 0.3
441 0.33
442 0.4
443 0.4
444 0.43
445 0.46
446 0.44
447 0.43
448 0.37
449 0.38
450 0.36
451 0.4
452 0.42
453 0.48
454 0.49
455 0.51
456 0.58
457 0.57
458 0.53
459 0.5
460 0.49
461 0.5
462 0.56
463 0.6
464 0.58
465 0.57
466 0.54
467 0.53
468 0.49
469 0.39
470 0.29
471 0.25
472 0.18
473 0.17
474 0.2
475 0.15
476 0.13
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.13
481 0.15
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.18
486 0.21
487 0.25
488 0.33
489 0.39
490 0.48
491 0.55
492 0.59
493 0.61
494 0.65