Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4SSW9

Protein Details
Accession A0A4Q4SSW9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-52GSQQPYCTRHHYRQHSCGSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11mito 11mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR005304  Rbsml_bgen_MeTrfase_EMG1/NEP1  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
Gene Ontology GO:0070037  F:rRNA (pseudouridine) methyltransferase activity  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03587  EMG1  
CDD cd18088  Nep1-like  
Amino Acid Sequences MYCRCAARRSGRPEPHGNFFGCDFVMTTSNCCGSQQPYCTRHHYRQHSCGSLNREHSGSPPCILQIPPPSSPTTTTVTELTINSLLRNNNGPLYLNGTHTHAASCVSCPCAAAVSLYHQAQAPHHSCVDALPLYCSGGRSEDHFSSPLPRFWFDAYGVPWTPVLPDGGFHGGSLVGGGGGAGQKETFQRIFDKWQKCMETTEPWEYALFAIWMSSPDRKRPRTQSLPPPSLPQLVAEQHVPIASSDKDSQRLIVVLANASLETYKASHGGGGNRMGMQREEKYSLLNSDEHIGVMRKMNRDISDARPDITHQCLLTLLDSPINKAGKLQIYIRTSKGVLIEVSPTVRIPRTFKRFAGLMVQLLHRLSIRSTNSQEKLLRVIQNPITDHLPPNCRKVTLSFESEVTRPRDYIQNLRPKESICVFVGAMAKGPDNFADEWVDEKIAISNYSLSASVACSKFCHAAEDVWDII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.76
3 0.71
4 0.63
5 0.55
6 0.47
7 0.41
8 0.31
9 0.26
10 0.18
11 0.15
12 0.18
13 0.16
14 0.18
15 0.18
16 0.21
17 0.2
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.28
22 0.34
23 0.41
24 0.44
25 0.49
26 0.57
27 0.63
28 0.68
29 0.71
30 0.74
31 0.74
32 0.78
33 0.81
34 0.78
35 0.74
36 0.71
37 0.67
38 0.64
39 0.59
40 0.53
41 0.45
42 0.39
43 0.4
44 0.4
45 0.35
46 0.29
47 0.25
48 0.23
49 0.24
50 0.24
51 0.25
52 0.28
53 0.31
54 0.32
55 0.33
56 0.35
57 0.34
58 0.36
59 0.34
60 0.3
61 0.27
62 0.27
63 0.25
64 0.24
65 0.24
66 0.22
67 0.21
68 0.2
69 0.18
70 0.17
71 0.2
72 0.2
73 0.2
74 0.23
75 0.22
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.18
80 0.24
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.14
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.12
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.18
107 0.19
108 0.26
109 0.24
110 0.22
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.22
116 0.16
117 0.14
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.14
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.13
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.24
133 0.26
134 0.27
135 0.25
136 0.24
137 0.24
138 0.25
139 0.27
140 0.21
141 0.22
142 0.2
143 0.22
144 0.21
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.15
149 0.12
150 0.11
151 0.07
152 0.07
153 0.08
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.05
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.05
171 0.06
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.13
176 0.15
177 0.24
178 0.32
179 0.35
180 0.36
181 0.41
182 0.41
183 0.39
184 0.41
185 0.35
186 0.32
187 0.33
188 0.34
189 0.28
190 0.27
191 0.26
192 0.23
193 0.2
194 0.14
195 0.1
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.07
201 0.12
202 0.13
203 0.22
204 0.3
205 0.34
206 0.41
207 0.48
208 0.56
209 0.6
210 0.67
211 0.69
212 0.7
213 0.72
214 0.66
215 0.61
216 0.53
217 0.45
218 0.37
219 0.27
220 0.21
221 0.16
222 0.16
223 0.13
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.06
229 0.08
230 0.07
231 0.09
232 0.12
233 0.14
234 0.16
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.15
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.09
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.15
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.14
266 0.15
267 0.17
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.15
282 0.18
283 0.18
284 0.19
285 0.23
286 0.23
287 0.26
288 0.29
289 0.29
290 0.34
291 0.33
292 0.31
293 0.29
294 0.29
295 0.28
296 0.28
297 0.24
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.24
316 0.26
317 0.3
318 0.33
319 0.33
320 0.31
321 0.28
322 0.27
323 0.25
324 0.19
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.14
330 0.12
331 0.11
332 0.12
333 0.14
334 0.16
335 0.2
336 0.28
337 0.36
338 0.4
339 0.41
340 0.43
341 0.41
342 0.4
343 0.41
344 0.34
345 0.28
346 0.26
347 0.26
348 0.23
349 0.22
350 0.21
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.17
355 0.2
356 0.25
357 0.3
358 0.38
359 0.4
360 0.45
361 0.46
362 0.41
363 0.42
364 0.42
365 0.43
366 0.36
367 0.41
368 0.39
369 0.41
370 0.41
371 0.38
372 0.35
373 0.31
374 0.33
375 0.33
376 0.38
377 0.36
378 0.42
379 0.42
380 0.4
381 0.4
382 0.4
383 0.42
384 0.39
385 0.41
386 0.36
387 0.35
388 0.37
389 0.37
390 0.39
391 0.35
392 0.31
393 0.26
394 0.27
395 0.32
396 0.34
397 0.43
398 0.46
399 0.52
400 0.53
401 0.57
402 0.57
403 0.51
404 0.53
405 0.46
406 0.41
407 0.32
408 0.32
409 0.27
410 0.28
411 0.3
412 0.23
413 0.23
414 0.19
415 0.19
416 0.16
417 0.17
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.15
422 0.16
423 0.15
424 0.17
425 0.18
426 0.17
427 0.14
428 0.14
429 0.16
430 0.15
431 0.15
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.15
437 0.12
438 0.11
439 0.13
440 0.19
441 0.19
442 0.19
443 0.19
444 0.22
445 0.27
446 0.27
447 0.29
448 0.24
449 0.25
450 0.29