Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4SUC6

Protein Details
Accession A0A4Q4SUC6    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-90EGETKPRRWSTEQPKKPNPPKRAKNEEVKPSKEBasic
111-136SDSSLGSSKKRNKERVRLKGKKSSDGHydrophilic
369-402HLAKDCPEPQKEKKGKKGKKGQRQGNSNNNRSNSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-89PRRWSTEQPKKPNPPKRAKNEEVKPSK
119-135KKRNKERVRLKGKKSSD
379-391KEKKGKKGKKGQR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MLHSWTSFNQGKSRSAGAQAKAPKASQSAQPEVRASGSKEAPVAVEESNVEELNPIREGETKPRRWSTEQPKKPNPPKRAKNEEVKPSKEKSVARDDPNDSDSSSSSSSSSDSSLGSSKKRNKERVRLKGKKSSDGDSKLRWKRFDFTLDRENHLLGWADWELWSNALNLALEEIGYKKGMKLKQLDQLRLAKAITKTCKRAPLELITGIKKGTKILRTLRKTYAVIGKARQRPLWKELSKITYDSRDPVQFTTKFQKLLREVEGCGVKLRTEEHITMFLTAVEDRAGSWCKTMQSVLRQTDYSFQQLIDDFNGEFHDRSSNKKNGKSHNAQRGKGKGDNNNNNNNKDNKPAWNKKGDPLCFDCGKYGHLAKDCPEPQKEKKGKKGKKGQRQGNSNNNRSNSSRTTQGGGQGEEQFIPDGLRDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.46
4 0.42
5 0.46
6 0.49
7 0.51
8 0.49
9 0.47
10 0.42
11 0.39
12 0.4
13 0.4
14 0.41
15 0.44
16 0.46
17 0.49
18 0.47
19 0.44
20 0.44
21 0.39
22 0.34
23 0.33
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.26
28 0.24
29 0.22
30 0.21
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.13
35 0.15
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.16
45 0.2
46 0.29
47 0.39
48 0.43
49 0.51
50 0.57
51 0.61
52 0.63
53 0.71
54 0.71
55 0.72
56 0.76
57 0.78
58 0.82
59 0.87
60 0.92
61 0.91
62 0.9
63 0.9
64 0.9
65 0.89
66 0.9
67 0.86
68 0.86
69 0.85
70 0.85
71 0.83
72 0.8
73 0.75
74 0.69
75 0.66
76 0.62
77 0.57
78 0.52
79 0.54
80 0.55
81 0.55
82 0.58
83 0.56
84 0.53
85 0.53
86 0.47
87 0.37
88 0.3
89 0.25
90 0.21
91 0.19
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.1
100 0.11
101 0.15
102 0.17
103 0.2
104 0.28
105 0.36
106 0.44
107 0.53
108 0.62
109 0.68
110 0.76
111 0.83
112 0.85
113 0.88
114 0.88
115 0.87
116 0.86
117 0.8
118 0.79
119 0.71
120 0.67
121 0.64
122 0.61
123 0.58
124 0.55
125 0.61
126 0.6
127 0.62
128 0.58
129 0.52
130 0.5
131 0.5
132 0.52
133 0.47
134 0.45
135 0.49
136 0.49
137 0.49
138 0.45
139 0.41
140 0.31
141 0.27
142 0.22
143 0.12
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.13
167 0.16
168 0.21
169 0.25
170 0.29
171 0.36
172 0.42
173 0.42
174 0.41
175 0.45
176 0.4
177 0.36
178 0.32
179 0.28
180 0.25
181 0.29
182 0.31
183 0.3
184 0.34
185 0.35
186 0.43
187 0.4
188 0.41
189 0.39
190 0.37
191 0.35
192 0.34
193 0.34
194 0.28
195 0.27
196 0.23
197 0.21
198 0.16
199 0.15
200 0.16
201 0.16
202 0.2
203 0.28
204 0.38
205 0.42
206 0.46
207 0.47
208 0.47
209 0.45
210 0.43
211 0.42
212 0.36
213 0.33
214 0.33
215 0.38
216 0.4
217 0.42
218 0.41
219 0.39
220 0.39
221 0.42
222 0.48
223 0.41
224 0.38
225 0.4
226 0.41
227 0.38
228 0.36
229 0.33
230 0.27
231 0.27
232 0.25
233 0.24
234 0.22
235 0.22
236 0.22
237 0.26
238 0.23
239 0.26
240 0.32
241 0.31
242 0.33
243 0.33
244 0.38
245 0.35
246 0.38
247 0.39
248 0.34
249 0.32
250 0.32
251 0.33
252 0.26
253 0.24
254 0.2
255 0.16
256 0.14
257 0.15
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.14
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.08
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.19
282 0.25
283 0.32
284 0.35
285 0.35
286 0.35
287 0.35
288 0.38
289 0.36
290 0.31
291 0.24
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.15
297 0.14
298 0.11
299 0.1
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.17
305 0.17
306 0.24
307 0.31
308 0.38
309 0.44
310 0.51
311 0.58
312 0.6
313 0.7
314 0.73
315 0.75
316 0.77
317 0.79
318 0.76
319 0.76
320 0.73
321 0.69
322 0.65
323 0.62
324 0.6
325 0.63
326 0.7
327 0.69
328 0.73
329 0.74
330 0.71
331 0.7
332 0.66
333 0.58
334 0.55
335 0.51
336 0.51
337 0.55
338 0.61
339 0.63
340 0.68
341 0.68
342 0.69
343 0.74
344 0.67
345 0.63
346 0.59
347 0.57
348 0.5
349 0.48
350 0.44
351 0.35
352 0.33
353 0.32
354 0.3
355 0.3
356 0.31
357 0.32
358 0.31
359 0.4
360 0.44
361 0.45
362 0.48
363 0.5
364 0.54
365 0.63
366 0.7
367 0.7
368 0.76
369 0.81
370 0.84
371 0.86
372 0.9
373 0.89
374 0.91
375 0.92
376 0.91
377 0.9
378 0.91
379 0.9
380 0.9
381 0.9
382 0.88
383 0.85
384 0.77
385 0.72
386 0.65
387 0.62
388 0.58
389 0.51
390 0.49
391 0.44
392 0.45
393 0.43
394 0.47
395 0.44
396 0.4
397 0.4
398 0.36
399 0.35
400 0.31
401 0.29
402 0.23
403 0.18
404 0.16