Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E2LDH3

Protein Details
Accession E2LDH3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-298HEREREKKKDSRTTNRPRPLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
329-343PRGPLTKAERERRRK
Subcellular Location(s) plas 12, nucl 5, E.R. 3, vacu 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009079  4_helix_cytokine-like_core  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mpr:MPER_04325  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNDAPLPPPPPPPGVVSPNWMPSAEHPVPPLVSWTDIYSIYQTVAHLGTTLGSVQQQIANMQATDTANVQTLKGTSDTVAQLVTELKGVAAAVDGTPKGTTPSGTSSSGTPKFKEPRVFDGKGTSVVPFLQEIKNAVYLSRRSLATEKDKCVYLSTYLGNGSPREWYNSIDIQTPELLNDFNKFTDDFKKHFGDSNIVATAQNKIDEIHQTGSAAQYVARLNEWIYHLELSEATKIQYVYRHLKSSVKDAITLVPKENRPKTYKAYGDFAIEIDNRLHEREREKKKDSRTTNRPRPLDSKETHDTPSQSIPELPAGEPMEIDATRISKPRGPLTKAERERRRKEGLCMYCGGRSHQAKDCPNMSEQSRKGYLAKQKAASSGKAYRMLPGPELPWTLDSSAIWMFNTADNRHSIVVMPFIAPFCVLLIVHTAQKRCDSGRVQYRIGLPRTVVLSFSSLVHSFLCSVLNKRNTESTQQMTNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.42
4 0.42
5 0.44
6 0.43
7 0.38
8 0.32
9 0.29
10 0.36
11 0.33
12 0.31
13 0.28
14 0.29
15 0.29
16 0.28
17 0.29
18 0.2
19 0.19
20 0.18
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.16
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.11
63 0.14
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.17
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.22
94 0.3
95 0.36
96 0.36
97 0.33
98 0.37
99 0.42
100 0.48
101 0.54
102 0.5
103 0.52
104 0.59
105 0.59
106 0.52
107 0.51
108 0.46
109 0.4
110 0.36
111 0.27
112 0.19
113 0.17
114 0.17
115 0.12
116 0.14
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.21
127 0.23
128 0.22
129 0.21
130 0.24
131 0.3
132 0.36
133 0.41
134 0.4
135 0.39
136 0.4
137 0.37
138 0.37
139 0.32
140 0.23
141 0.2
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.21
155 0.24
156 0.24
157 0.25
158 0.24
159 0.21
160 0.21
161 0.19
162 0.15
163 0.12
164 0.12
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.2
173 0.23
174 0.24
175 0.28
176 0.3
177 0.3
178 0.33
179 0.32
180 0.28
181 0.25
182 0.26
183 0.21
184 0.19
185 0.19
186 0.15
187 0.16
188 0.13
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.09
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.16
226 0.22
227 0.24
228 0.25
229 0.25
230 0.3
231 0.3
232 0.33
233 0.34
234 0.27
235 0.25
236 0.24
237 0.27
238 0.26
239 0.26
240 0.22
241 0.21
242 0.24
243 0.3
244 0.34
245 0.35
246 0.35
247 0.39
248 0.43
249 0.46
250 0.48
251 0.43
252 0.42
253 0.38
254 0.35
255 0.31
256 0.26
257 0.21
258 0.16
259 0.14
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.18
267 0.27
268 0.37
269 0.44
270 0.5
271 0.55
272 0.63
273 0.7
274 0.74
275 0.74
276 0.75
277 0.78
278 0.83
279 0.85
280 0.79
281 0.74
282 0.71
283 0.66
284 0.64
285 0.55
286 0.52
287 0.48
288 0.48
289 0.45
290 0.42
291 0.37
292 0.3
293 0.33
294 0.26
295 0.22
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.11
308 0.11
309 0.08
310 0.09
311 0.11
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.19
316 0.27
317 0.34
318 0.36
319 0.42
320 0.48
321 0.57
322 0.63
323 0.7
324 0.72
325 0.75
326 0.78
327 0.77
328 0.79
329 0.71
330 0.7
331 0.7
332 0.66
333 0.59
334 0.55
335 0.49
336 0.42
337 0.4
338 0.35
339 0.33
340 0.31
341 0.32
342 0.35
343 0.42
344 0.43
345 0.47
346 0.48
347 0.42
348 0.41
349 0.41
350 0.37
351 0.38
352 0.36
353 0.37
354 0.36
355 0.36
356 0.36
357 0.39
358 0.45
359 0.45
360 0.5
361 0.47
362 0.47
363 0.53
364 0.53
365 0.49
366 0.46
367 0.43
368 0.42
369 0.43
370 0.42
371 0.38
372 0.4
373 0.39
374 0.35
375 0.31
376 0.27
377 0.24
378 0.26
379 0.23
380 0.19
381 0.19
382 0.17
383 0.16
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.12
391 0.15
392 0.2
393 0.18
394 0.19
395 0.21
396 0.22
397 0.22
398 0.21
399 0.2
400 0.16
401 0.18
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.12
408 0.11
409 0.08
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.11
414 0.12
415 0.18
416 0.22
417 0.23
418 0.24
419 0.28
420 0.31
421 0.29
422 0.35
423 0.35
424 0.41
425 0.5
426 0.54
427 0.52
428 0.53
429 0.59
430 0.59
431 0.57
432 0.5
433 0.4
434 0.38
435 0.39
436 0.34
437 0.27
438 0.2
439 0.2
440 0.18
441 0.18
442 0.19
443 0.16
444 0.17
445 0.17
446 0.16
447 0.14
448 0.14
449 0.17
450 0.16
451 0.2
452 0.29
453 0.36
454 0.37
455 0.4
456 0.47
457 0.47
458 0.52
459 0.55
460 0.5
461 0.53