Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4SW98

Protein Details
Accession A0A4Q4SW98    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-184LSRKISTRYLSRKPKKTPEQLEKEKKDREBasic
435-454RIQPGAKGGKEKKGKKKAAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-189SRKPKKTPEQLEKEKKDREEKLKK
439-454GAKGGKEKKGKKKAAA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000717  PCI_dom  
IPR040134  PSMD12/CSN4  
IPR040896  RPN5_C  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000502  C:proteasome complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PF18098  RPN5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSEGLLKPEKDFSKEADKLIPEAEHLAQAPAIEKLTVFEKQARQHGQLKQAITKMVQTVMKFLDDTPNLETKLSVIETLRTVTEGKIFVEVERARVTKVLSDIKKQQGDLKAAMDILCELQVETFGSMDRREKTEFILAQVALCIENGDWTQAGILSRKISTRYLSRKPKKTPEQLEKEKKDREEKLKKGEEVPEEKEDDTTDLKLRYYEQQIVLAKHDDKYLDVCKHYRQVLDTEAVEEDPSKLQPVLQRIIYFVILAPHDNEQHDLLHRIYRDSRNSQVPTDAQLLKLFTVHELMRWPEVAKLFGPHLCSTDVFDSQPNQSSDEKAHQRWQDLRKRVIEHNVRVVAKYYTRIGMKRLTQLLDLTEDETEKYISELVCSKTVYARIDRPARIVSFAKPRDVDDVLNEWSSNMKSLLGLLERVDHLITKEEMMARIQPGAKGGKEKKGKKKAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.46
3 0.44
4 0.43
5 0.39
6 0.4
7 0.35
8 0.26
9 0.26
10 0.24
11 0.2
12 0.19
13 0.18
14 0.15
15 0.15
16 0.15
17 0.13
18 0.12
19 0.1
20 0.09
21 0.1
22 0.14
23 0.15
24 0.17
25 0.22
26 0.28
27 0.34
28 0.43
29 0.47
30 0.49
31 0.55
32 0.59
33 0.61
34 0.6
35 0.58
36 0.54
37 0.52
38 0.49
39 0.42
40 0.38
41 0.31
42 0.31
43 0.3
44 0.25
45 0.26
46 0.25
47 0.25
48 0.22
49 0.21
50 0.25
51 0.23
52 0.25
53 0.25
54 0.28
55 0.27
56 0.27
57 0.26
58 0.18
59 0.2
60 0.19
61 0.16
62 0.13
63 0.14
64 0.15
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.16
74 0.17
75 0.15
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.25
80 0.25
81 0.22
82 0.24
83 0.24
84 0.19
85 0.24
86 0.3
87 0.29
88 0.35
89 0.42
90 0.49
91 0.51
92 0.48
93 0.49
94 0.46
95 0.47
96 0.43
97 0.37
98 0.29
99 0.27
100 0.26
101 0.2
102 0.14
103 0.1
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.09
115 0.14
116 0.15
117 0.18
118 0.2
119 0.21
120 0.23
121 0.29
122 0.28
123 0.26
124 0.28
125 0.24
126 0.22
127 0.21
128 0.19
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.04
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.26
150 0.33
151 0.41
152 0.52
153 0.6
154 0.67
155 0.73
156 0.81
157 0.82
158 0.83
159 0.83
160 0.83
161 0.84
162 0.85
163 0.88
164 0.84
165 0.81
166 0.76
167 0.71
168 0.68
169 0.66
170 0.66
171 0.66
172 0.65
173 0.68
174 0.68
175 0.65
176 0.61
177 0.59
178 0.54
179 0.49
180 0.47
181 0.39
182 0.35
183 0.34
184 0.3
185 0.24
186 0.2
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.14
194 0.16
195 0.18
196 0.21
197 0.19
198 0.24
199 0.26
200 0.27
201 0.27
202 0.25
203 0.22
204 0.19
205 0.2
206 0.14
207 0.12
208 0.14
209 0.18
210 0.18
211 0.19
212 0.2
213 0.21
214 0.25
215 0.27
216 0.24
217 0.2
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.11
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.19
240 0.17
241 0.14
242 0.1
243 0.1
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.16
259 0.2
260 0.25
261 0.3
262 0.32
263 0.36
264 0.4
265 0.42
266 0.4
267 0.38
268 0.33
269 0.31
270 0.32
271 0.28
272 0.21
273 0.2
274 0.2
275 0.17
276 0.17
277 0.14
278 0.09
279 0.11
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.15
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.19
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.15
303 0.17
304 0.17
305 0.18
306 0.23
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.23
311 0.24
312 0.31
313 0.36
314 0.33
315 0.4
316 0.39
317 0.44
318 0.5
319 0.57
320 0.58
321 0.59
322 0.63
323 0.62
324 0.63
325 0.63
326 0.65
327 0.64
328 0.59
329 0.59
330 0.59
331 0.53
332 0.49
333 0.46
334 0.39
335 0.32
336 0.3
337 0.24
338 0.22
339 0.25
340 0.26
341 0.28
342 0.32
343 0.34
344 0.38
345 0.41
346 0.38
347 0.35
348 0.35
349 0.33
350 0.29
351 0.25
352 0.19
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.11
363 0.15
364 0.17
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.22
369 0.26
370 0.28
371 0.29
372 0.32
373 0.38
374 0.45
375 0.46
376 0.46
377 0.47
378 0.44
379 0.43
380 0.4
381 0.37
382 0.4
383 0.42
384 0.44
385 0.4
386 0.4
387 0.41
388 0.41
389 0.36
390 0.29
391 0.31
392 0.28
393 0.28
394 0.26
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.18
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.16
404 0.15
405 0.15
406 0.14
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.17
411 0.15
412 0.14
413 0.17
414 0.18
415 0.15
416 0.18
417 0.2
418 0.2
419 0.22
420 0.24
421 0.21
422 0.25
423 0.26
424 0.23
425 0.25
426 0.29
427 0.3
428 0.36
429 0.41
430 0.46
431 0.54
432 0.63
433 0.7
434 0.76