Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4SVD3

Protein Details
Accession A0A4Q4SVD3    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24AAPVRRKKMIGHRRRVEDEGBasic
165-185EVPIERRRREHDEYRRKRDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-221RGGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
IPR044796  MLN51_plant  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MSNMAAPVRRKKMIGHRRRVEDEGEDDGGIDQLDIDDDSLTEGSIASDDHDLADDSDTSNVDEASPTTPALRKSNGRGPNGNSTKKRAHRNASGTTGTGTEKPTKPQESALNDTEFMLNGLKIADTPEPVKELSFEDEATEPPPKTSAPIVVSSTSAATAKSNQEVPIERRRREHDEYRRKRDEDPAFVPNRGAFFMHDHRHAGPAANGFRPFGRGGRGRGRGGIGGPFAPMSQQLRNPADPITNAPWAHDMHETVAQPLPARQVRQPFIDDGPPNGDGYIPTCPNSSSPINRHMATEKVLGNVQIRVYIPSMEEPVLFSSIPIKQYTKLPDHRPPLRRDKPVRISIADLPPRFRFPAEDRSFIFIPRALRPNQQRLRGKPRSGLGSIGGFSRRTSIFGGSYYGGSVYSPSVAAMSRRSSIAPDMGRDFIVSPSGSAISRPPLPLDSARPVVRLPPQSRQEQQMTVPDGVVAERPAEAVQPAISDLPQPQTHPLPQKPAFHENRPASIPMHQPRPQKTVSVADIESPTVQQTQSQPYQQAFHQQVPVQVSNGLGQDSHARHPSYPSQHSTGTPLSQIPERAIHAAPFQPQPAQYAQQTYYPPYQMGLAPQAYYYPQPGYPGTMAPSAAAPPFVPGVQQGQPQSESSANQPGGQAQPGSNLVAQEVNGMVYYYDASQLAPVSTYPPYSPPQGYPMAGAMNGMVTSPDGYYYPPSGPGVVYYPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.7
3 0.72
4 0.78
5 0.83
6 0.78
7 0.71
8 0.65
9 0.58
10 0.52
11 0.44
12 0.35
13 0.29
14 0.26
15 0.22
16 0.16
17 0.12
18 0.07
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.12
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.14
55 0.17
56 0.21
57 0.26
58 0.31
59 0.34
60 0.41
61 0.5
62 0.55
63 0.58
64 0.6
65 0.6
66 0.65
67 0.68
68 0.7
69 0.65
70 0.64
71 0.68
72 0.69
73 0.75
74 0.73
75 0.73
76 0.73
77 0.76
78 0.76
79 0.73
80 0.68
81 0.58
82 0.49
83 0.42
84 0.34
85 0.29
86 0.26
87 0.27
88 0.27
89 0.32
90 0.39
91 0.41
92 0.41
93 0.44
94 0.49
95 0.48
96 0.52
97 0.51
98 0.45
99 0.42
100 0.41
101 0.35
102 0.27
103 0.21
104 0.15
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.13
114 0.14
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.15
132 0.16
133 0.18
134 0.21
135 0.19
136 0.23
137 0.25
138 0.24
139 0.25
140 0.23
141 0.21
142 0.16
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.13
147 0.15
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.22
152 0.27
153 0.32
154 0.39
155 0.44
156 0.44
157 0.49
158 0.54
159 0.59
160 0.61
161 0.67
162 0.67
163 0.71
164 0.78
165 0.82
166 0.84
167 0.78
168 0.73
169 0.73
170 0.69
171 0.66
172 0.6
173 0.59
174 0.53
175 0.51
176 0.49
177 0.4
178 0.33
179 0.26
180 0.21
181 0.14
182 0.17
183 0.23
184 0.26
185 0.27
186 0.28
187 0.28
188 0.3
189 0.29
190 0.25
191 0.2
192 0.23
193 0.23
194 0.24
195 0.24
196 0.22
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.16
201 0.2
202 0.21
203 0.26
204 0.35
205 0.4
206 0.38
207 0.39
208 0.39
209 0.34
210 0.31
211 0.27
212 0.19
213 0.14
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.15
222 0.22
223 0.25
224 0.26
225 0.27
226 0.26
227 0.25
228 0.23
229 0.24
230 0.21
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.2
238 0.17
239 0.14
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.19
248 0.17
249 0.19
250 0.21
251 0.27
252 0.29
253 0.32
254 0.33
255 0.29
256 0.28
257 0.32
258 0.29
259 0.24
260 0.24
261 0.22
262 0.2
263 0.17
264 0.15
265 0.09
266 0.11
267 0.13
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.17
274 0.19
275 0.21
276 0.23
277 0.3
278 0.32
279 0.32
280 0.33
281 0.31
282 0.29
283 0.26
284 0.26
285 0.2
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.18
314 0.23
315 0.28
316 0.33
317 0.38
318 0.44
319 0.51
320 0.58
321 0.61
322 0.62
323 0.66
324 0.67
325 0.7
326 0.69
327 0.71
328 0.7
329 0.7
330 0.66
331 0.56
332 0.52
333 0.47
334 0.48
335 0.44
336 0.36
337 0.33
338 0.31
339 0.31
340 0.29
341 0.24
342 0.2
343 0.19
344 0.29
345 0.3
346 0.32
347 0.31
348 0.35
349 0.35
350 0.32
351 0.28
352 0.19
353 0.18
354 0.19
355 0.22
356 0.19
357 0.25
358 0.31
359 0.41
360 0.44
361 0.5
362 0.53
363 0.56
364 0.65
365 0.66
366 0.63
367 0.57
368 0.54
369 0.5
370 0.44
371 0.38
372 0.29
373 0.22
374 0.2
375 0.17
376 0.15
377 0.11
378 0.1
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.1
390 0.09
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.08
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.17
409 0.16
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.15
416 0.1
417 0.11
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.14
431 0.16
432 0.19
433 0.2
434 0.23
435 0.23
436 0.23
437 0.23
438 0.24
439 0.28
440 0.32
441 0.31
442 0.35
443 0.39
444 0.44
445 0.46
446 0.48
447 0.46
448 0.4
449 0.38
450 0.36
451 0.35
452 0.29
453 0.27
454 0.21
455 0.18
456 0.16
457 0.15
458 0.09
459 0.06
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.08
473 0.12
474 0.13
475 0.13
476 0.16
477 0.19
478 0.24
479 0.32
480 0.33
481 0.38
482 0.42
483 0.48
484 0.51
485 0.57
486 0.57
487 0.54
488 0.61
489 0.54
490 0.52
491 0.48
492 0.44
493 0.35
494 0.35
495 0.39
496 0.34
497 0.41
498 0.43
499 0.47
500 0.51
501 0.55
502 0.52
503 0.45
504 0.43
505 0.41
506 0.38
507 0.35
508 0.3
509 0.27
510 0.26
511 0.25
512 0.22
513 0.15
514 0.14
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.14
519 0.21
520 0.24
521 0.27
522 0.29
523 0.29
524 0.32
525 0.29
526 0.35
527 0.31
528 0.3
529 0.32
530 0.3
531 0.33
532 0.36
533 0.36
534 0.28
535 0.25
536 0.22
537 0.2
538 0.19
539 0.15
540 0.1
541 0.1
542 0.16
543 0.17
544 0.2
545 0.23
546 0.24
547 0.24
548 0.29
549 0.37
550 0.38
551 0.42
552 0.43
553 0.42
554 0.43
555 0.43
556 0.44
557 0.38
558 0.32
559 0.27
560 0.24
561 0.22
562 0.23
563 0.23
564 0.2
565 0.19
566 0.2
567 0.21
568 0.21
569 0.2
570 0.2
571 0.22
572 0.24
573 0.23
574 0.23
575 0.22
576 0.22
577 0.24
578 0.25
579 0.26
580 0.24
581 0.26
582 0.26
583 0.29
584 0.3
585 0.32
586 0.32
587 0.3
588 0.28
589 0.24
590 0.24
591 0.2
592 0.21
593 0.22
594 0.19
595 0.18
596 0.17
597 0.18
598 0.17
599 0.18
600 0.17
601 0.14
602 0.14
603 0.17
604 0.17
605 0.2
606 0.2
607 0.21
608 0.21
609 0.2
610 0.2
611 0.17
612 0.17
613 0.15
614 0.14
615 0.13
616 0.1
617 0.1
618 0.11
619 0.11
620 0.1
621 0.1
622 0.15
623 0.17
624 0.22
625 0.22
626 0.24
627 0.26
628 0.27
629 0.29
630 0.26
631 0.24
632 0.23
633 0.3
634 0.27
635 0.26
636 0.26
637 0.26
638 0.27
639 0.27
640 0.25
641 0.17
642 0.2
643 0.2
644 0.22
645 0.2
646 0.17
647 0.16
648 0.16
649 0.15
650 0.13
651 0.12
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.07
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.13
669 0.14
670 0.15
671 0.18
672 0.21
673 0.26
674 0.28
675 0.28
676 0.32
677 0.34
678 0.33
679 0.31
680 0.3
681 0.26
682 0.23
683 0.2
684 0.15
685 0.12
686 0.11
687 0.09
688 0.07
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.08
694 0.1
695 0.14
696 0.16
697 0.17
698 0.19
699 0.2
700 0.2
701 0.2
702 0.21