Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4TM22

Protein Details
Accession A0A4Q4TM22    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-248KDGRIDKGSKSRKTRKRLAERLAQLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-241LKVKDGRIDKGSKSRKTRKRL
560-571KEKKKGTVKKLK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.333, cyto 10, cyto_mito 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
CDD cd09276  Rnase_HI_RT_non_LTR  
Amino Acid Sequences MDHYDGPSIFEEEGVIGLLDKAMQSTQIQAGFGDPIANTSGMEKKHVSQWSMFGAFAPKENRKANTTSILVDKKLHPGNDTDERDFVPSKNNVPSVKPPPAPAAMRANLSVAHTNNAAQTVGPPRAPAALRLQPPAAPAEMRYQPRRSLRLIHKGLDAHLNSLTAEAVAVPERFSERLLRRMKGARKEGVAMDNYENGAPFQNDAPLQNDKGVKAGTPAPLKVKDGRIDKGSKSRKTRKRLAERLAQLAGQEVSDSSKVSKFSKFTKVSKSSNDITANCNNKNMKIFVTSREQAVQFAKDILEIGIAQVPRLVFYTDGSGGSRVHGGHDVTGAAVAYKRCLDIPTQWVHAAFAIFGSSNSTDAELVAVGAALNIARCEAEKFRQESPESCVAYPTMFIITDSQTALSWIDQYVNGQAARQRVARRLYHAAFTQLLDPLARLESLGVKVEFHWTKGHANVEGNVIADNLAGNAVTWMKKNLLKRQRDPDPTRAFEVHMAPFTSEEVVMRFKDQKEDIRLLLEDSDNNQSHQSAVPHPQDLWEDELAKQEDEQGNREGQEAKEKKKGTVKKLKEAFLPIKRLVQNVTGQKRKHGDSSNSGATKPVASDVSEDGGVTKKRGAVPQGEARGRHIEVIDLTGDDDEEITRVCREEETGTEIIDLTGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.08
11 0.09
12 0.12
13 0.16
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.18
18 0.17
19 0.17
20 0.15
21 0.11
22 0.1
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.13
27 0.18
28 0.17
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.31
33 0.36
34 0.36
35 0.33
36 0.37
37 0.39
38 0.39
39 0.36
40 0.29
41 0.29
42 0.27
43 0.29
44 0.33
45 0.31
46 0.38
47 0.43
48 0.46
49 0.45
50 0.49
51 0.48
52 0.48
53 0.45
54 0.41
55 0.43
56 0.43
57 0.41
58 0.41
59 0.38
60 0.39
61 0.42
62 0.4
63 0.33
64 0.33
65 0.39
66 0.45
67 0.48
68 0.42
69 0.39
70 0.39
71 0.41
72 0.39
73 0.32
74 0.3
75 0.28
76 0.3
77 0.35
78 0.39
79 0.37
80 0.41
81 0.49
82 0.49
83 0.54
84 0.51
85 0.47
86 0.47
87 0.51
88 0.47
89 0.44
90 0.44
91 0.37
92 0.37
93 0.35
94 0.31
95 0.27
96 0.27
97 0.27
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.16
105 0.11
106 0.14
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.18
112 0.22
113 0.23
114 0.22
115 0.24
116 0.29
117 0.31
118 0.34
119 0.34
120 0.3
121 0.31
122 0.3
123 0.23
124 0.17
125 0.15
126 0.19
127 0.25
128 0.3
129 0.35
130 0.37
131 0.43
132 0.5
133 0.52
134 0.49
135 0.52
136 0.56
137 0.6
138 0.61
139 0.57
140 0.54
141 0.51
142 0.49
143 0.47
144 0.38
145 0.29
146 0.25
147 0.22
148 0.18
149 0.17
150 0.15
151 0.07
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.19
163 0.2
164 0.29
165 0.35
166 0.35
167 0.39
168 0.47
169 0.54
170 0.55
171 0.58
172 0.54
173 0.5
174 0.52
175 0.49
176 0.44
177 0.38
178 0.32
179 0.26
180 0.23
181 0.21
182 0.19
183 0.16
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.21
197 0.19
198 0.2
199 0.19
200 0.16
201 0.15
202 0.18
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.25
207 0.26
208 0.29
209 0.31
210 0.32
211 0.33
212 0.35
213 0.36
214 0.37
215 0.39
216 0.4
217 0.46
218 0.5
219 0.51
220 0.57
221 0.65
222 0.69
223 0.73
224 0.8
225 0.81
226 0.83
227 0.85
228 0.81
229 0.8
230 0.75
231 0.71
232 0.62
233 0.51
234 0.4
235 0.32
236 0.25
237 0.15
238 0.11
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.09
245 0.12
246 0.14
247 0.18
248 0.19
249 0.24
250 0.34
251 0.38
252 0.41
253 0.48
254 0.53
255 0.53
256 0.56
257 0.56
258 0.48
259 0.48
260 0.47
261 0.39
262 0.36
263 0.39
264 0.4
265 0.35
266 0.38
267 0.32
268 0.3
269 0.31
270 0.28
271 0.22
272 0.22
273 0.23
274 0.21
275 0.27
276 0.26
277 0.25
278 0.26
279 0.25
280 0.22
281 0.23
282 0.2
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.1
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.09
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.06
318 0.07
319 0.06
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.16
331 0.18
332 0.19
333 0.19
334 0.19
335 0.19
336 0.18
337 0.14
338 0.09
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.06
365 0.08
366 0.12
367 0.18
368 0.21
369 0.23
370 0.28
371 0.3
372 0.29
373 0.33
374 0.36
375 0.33
376 0.3
377 0.28
378 0.23
379 0.22
380 0.2
381 0.15
382 0.08
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.13
405 0.16
406 0.19
407 0.21
408 0.24
409 0.3
410 0.31
411 0.34
412 0.4
413 0.39
414 0.38
415 0.36
416 0.33
417 0.28
418 0.27
419 0.22
420 0.16
421 0.14
422 0.11
423 0.11
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.09
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.11
435 0.19
436 0.18
437 0.18
438 0.19
439 0.18
440 0.21
441 0.24
442 0.26
443 0.21
444 0.22
445 0.22
446 0.22
447 0.2
448 0.18
449 0.15
450 0.12
451 0.09
452 0.08
453 0.07
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.04
459 0.06
460 0.07
461 0.08
462 0.09
463 0.13
464 0.17
465 0.24
466 0.33
467 0.41
468 0.5
469 0.57
470 0.65
471 0.71
472 0.78
473 0.78
474 0.78
475 0.77
476 0.71
477 0.67
478 0.59
479 0.51
480 0.44
481 0.41
482 0.33
483 0.26
484 0.24
485 0.19
486 0.19
487 0.18
488 0.15
489 0.11
490 0.09
491 0.09
492 0.11
493 0.12
494 0.14
495 0.19
496 0.19
497 0.25
498 0.28
499 0.34
500 0.38
501 0.41
502 0.39
503 0.37
504 0.36
505 0.31
506 0.29
507 0.23
508 0.17
509 0.16
510 0.23
511 0.21
512 0.21
513 0.21
514 0.19
515 0.19
516 0.21
517 0.21
518 0.18
519 0.26
520 0.28
521 0.29
522 0.29
523 0.3
524 0.29
525 0.28
526 0.28
527 0.22
528 0.2
529 0.19
530 0.25
531 0.24
532 0.22
533 0.21
534 0.24
535 0.26
536 0.26
537 0.29
538 0.25
539 0.26
540 0.26
541 0.28
542 0.24
543 0.21
544 0.3
545 0.33
546 0.36
547 0.43
548 0.44
549 0.48
550 0.54
551 0.62
552 0.62
553 0.67
554 0.69
555 0.71
556 0.77
557 0.75
558 0.71
559 0.71
560 0.69
561 0.66
562 0.65
563 0.56
564 0.57
565 0.55
566 0.52
567 0.46
568 0.41
569 0.41
570 0.44
571 0.52
572 0.51
573 0.5
574 0.56
575 0.59
576 0.58
577 0.58
578 0.57
579 0.55
580 0.55
581 0.62
582 0.64
583 0.59
584 0.56
585 0.49
586 0.41
587 0.35
588 0.28
589 0.23
590 0.15
591 0.15
592 0.17
593 0.17
594 0.19
595 0.18
596 0.17
597 0.15
598 0.19
599 0.2
600 0.19
601 0.2
602 0.22
603 0.26
604 0.31
605 0.35
606 0.35
607 0.41
608 0.49
609 0.56
610 0.56
611 0.53
612 0.52
613 0.53
614 0.48
615 0.42
616 0.34
617 0.27
618 0.23
619 0.25
620 0.21
621 0.15
622 0.15
623 0.13
624 0.12
625 0.1
626 0.09
627 0.07
628 0.07
629 0.08
630 0.08
631 0.09
632 0.1
633 0.11
634 0.12
635 0.14
636 0.17
637 0.19
638 0.24
639 0.24
640 0.23
641 0.23
642 0.22