FuNGI

A0A4Q4V8W0

Protein Details

Accession

A0A4Q4V8W0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-35	ITSAPIMKLPNHNKKKRLKTDASDRALG	Hydrophilic
670-694	VTTARPPDPNLRRSSRKKQTPPCWR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR023779 Chromodomain_CS IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS00598 CHROMO_1 PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MQTLKDQITSAPIMKLPNHNKKKRLKTDASDRALGAILEQQEDDGKWHPVAYYSKALKDAELRYPIYDKELLAIIMALKEWEPYLSGTKEPFDIYSDHKNLTHFMTTQDLNKRHENWIIFLSKFNFKIHHIKGKENIQADILSRRGDYDIKVPKRRMQMLQPTKEGTLQLCEILKKPTPELLAQFRSSYNSDEQKEIKQLKGRSKDQLLYHGKVYVPRERQKQFVGEFHEDPLHGHQGIFKTTKRLQEKYDFPELRKTVKQVVKDCNVCNKAKAARHKPYGLLQPTEIPDKAWNTIAWDFITGLPLSKDPVTGVQYDGVWVIVDRLTKYGYFLPFKGNTTAEQLAYAFVRHYLDKHGIPERIVSDRDKLFISKFGTSFFKQIGAKLKFSTAYHPQTDGQTERLNQTLEQYLRSYVNYQQDNWVELLPLAQVAYNTSVNEDMGVSPHIAVYGRDAETQRPEQPLSKAPKITSVAPRAETMVTEIKTIQTRLRTELQFLQQRMAQYYNRKRIEGPILSRGDKVYLLRQKQNATSNISQIKTKRPSDKLDFKKLGPFKIDEVISKTNYQLLLPKTMKIHPVFHISLLEPAPSDAPLETNLEIEENTDEYEVERVLDSRMVNDKIQYLIKWKDYPPEDNTWEPLKHLTNAKDLVKTFHRQNPARPSPTQPRSQVTTARPPDPNLRRSSRKKQTPPCWR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.39
3	0.44
4	0.52
5	0.61
6	0.67
7	0.74
8	0.82
9	0.88
10	0.89
11	0.89
12	0.88
13	0.87
14	0.89
15	0.91
16	0.86
17	0.78
18	0.67
19	0.58
20	0.49
21	0.39
22	0.28
23	0.22
24	0.17
25	0.14
26	0.14
27	0.13
28	0.14
29	0.15
30	0.16
31	0.15
32	0.16
33	0.16
34	0.17
35	0.16
36	0.2
37	0.24
38	0.27
39	0.34
40	0.34
41	0.37
42	0.41
43	0.41
44	0.37
45	0.4
46	0.4
47	0.38
48	0.4
49	0.38
50	0.37
51	0.39
52	0.37
53	0.35
54	0.32
55	0.25
56	0.21
57	0.21
58	0.18
59	0.16
60	0.16
61	0.11
62	0.09
63	0.09
64	0.08
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.07
69	0.08
70	0.1
71	0.15
72	0.17
73	0.19
74	0.2
75	0.21
76	0.23
77	0.23
78	0.21
79	0.18
80	0.18
81	0.21
82	0.29
83	0.31
84	0.31
85	0.32
86	0.32
87	0.32
88	0.33
89	0.32
90	0.23
91	0.22
92	0.25
93	0.25
94	0.3
95	0.37
96	0.38
97	0.39
98	0.45
99	0.46
100	0.45
101	0.5
102	0.45
103	0.38
104	0.4
105	0.39
106	0.34
107	0.34
108	0.34
109	0.33
110	0.34
111	0.33
112	0.29
113	0.3
114	0.39
115	0.42
116	0.48
117	0.45
118	0.49
119	0.54
120	0.6
121	0.61
122	0.53
123	0.47
124	0.38
125	0.37
126	0.33
127	0.3
128	0.24
129	0.19
130	0.17
131	0.17
132	0.18
133	0.18
134	0.18
135	0.22
136	0.31
137	0.39
138	0.47
139	0.5
140	0.54
141	0.61
142	0.65
143	0.62
144	0.61
145	0.64
146	0.66
147	0.69
148	0.66
149	0.6
150	0.55
151	0.51
152	0.43
153	0.32
154	0.25
155	0.2
156	0.18
157	0.18
158	0.18
159	0.18
160	0.21
161	0.24
162	0.22
163	0.23
164	0.24
165	0.25
166	0.26
167	0.3
168	0.33
169	0.34
170	0.34
171	0.33
172	0.3
173	0.31
174	0.3
175	0.28
176	0.26
177	0.28
178	0.29
179	0.32
180	0.33
181	0.33
182	0.4
183	0.4
184	0.38
185	0.38
186	0.42
187	0.47
188	0.54
189	0.55
190	0.54
191	0.57
192	0.58
193	0.53
194	0.58
195	0.55
196	0.48
197	0.45
198	0.4
199	0.35
200	0.34
201	0.36
202	0.34
203	0.36
204	0.41
205	0.49
206	0.49
207	0.52
208	0.51
209	0.53
210	0.48
211	0.44
212	0.44
213	0.41
214	0.39
215	0.37
216	0.35
217	0.28
218	0.26
219	0.24
220	0.2
221	0.15
222	0.14
223	0.15
224	0.15
225	0.19
226	0.21
227	0.19
228	0.23
229	0.27
230	0.35
231	0.39
232	0.4
233	0.42
234	0.47
235	0.53
236	0.52
237	0.59
238	0.52
239	0.48
240	0.54
241	0.5
242	0.47
243	0.43
244	0.39
245	0.38
246	0.4
247	0.45
248	0.43
249	0.48
250	0.51
251	0.53
252	0.52
253	0.52
254	0.53
255	0.47
256	0.42
257	0.39
258	0.38
259	0.39
260	0.48
261	0.48
262	0.52
263	0.56
264	0.57
265	0.54
266	0.53
267	0.56
268	0.49
269	0.41
270	0.33
271	0.31
272	0.3
273	0.31
274	0.26
275	0.18
276	0.17
277	0.17
278	0.18
279	0.16
280	0.14
281	0.15
282	0.16
283	0.16
284	0.14
285	0.13
286	0.12
287	0.11
288	0.12
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.06
297	0.09
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.11
304	0.1
305	0.07
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.12
317	0.15
318	0.16
319	0.16
320	0.2
321	0.21
322	0.23
323	0.23
324	0.2
325	0.18
326	0.21
327	0.21
328	0.16
329	0.15
330	0.14
331	0.12
332	0.11
333	0.11
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.1
340	0.13
341	0.13
342	0.16
343	0.2
344	0.2
345	0.2
346	0.21
347	0.2
348	0.19
349	0.2
350	0.18
351	0.18
352	0.17
353	0.18
354	0.17
355	0.16
356	0.15
357	0.17
358	0.19
359	0.17
360	0.17
361	0.18
362	0.21
363	0.21
364	0.22
365	0.18
366	0.2
367	0.18
368	0.21
369	0.28
370	0.27
371	0.27
372	0.26
373	0.27
374	0.25
375	0.25
376	0.27
377	0.25
378	0.27
379	0.27
380	0.28
381	0.28
382	0.27
383	0.3
384	0.26
385	0.21
386	0.19
387	0.19
388	0.18
389	0.19
390	0.18
391	0.15
392	0.16
393	0.19
394	0.17
395	0.17
396	0.17
397	0.17
398	0.17
399	0.18
400	0.17
401	0.17
402	0.24
403	0.24
404	0.23
405	0.27
406	0.27
407	0.28
408	0.26
409	0.21
410	0.14
411	0.13
412	0.13
413	0.07
414	0.06
415	0.05
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.08
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.08
437	0.11
438	0.11
439	0.14
440	0.15
441	0.17
442	0.22
443	0.25
444	0.26
445	0.25
446	0.25
447	0.26
448	0.28
449	0.34
450	0.36
451	0.39
452	0.38
453	0.36
454	0.41
455	0.4
456	0.43
457	0.42
458	0.41
459	0.39
460	0.37
461	0.37
462	0.33
463	0.3
464	0.25
465	0.21
466	0.2
467	0.17
468	0.17
469	0.17
470	0.17
471	0.19
472	0.21
473	0.2
474	0.21
475	0.22
476	0.26
477	0.33
478	0.31
479	0.33
480	0.37
481	0.42
482	0.43
483	0.41
484	0.39
485	0.34
486	0.34
487	0.33
488	0.31
489	0.28
490	0.32
491	0.41
492	0.49
493	0.5
494	0.5
495	0.48
496	0.51
497	0.55
498	0.52
499	0.47
500	0.46
501	0.47
502	0.48
503	0.47
504	0.41
505	0.34
506	0.28
507	0.25
508	0.26
509	0.3
510	0.34
511	0.39
512	0.43
513	0.46
514	0.5
515	0.55
516	0.51
517	0.5
518	0.46
519	0.47
520	0.48
521	0.46
522	0.44
523	0.4
524	0.45
525	0.46
526	0.51
527	0.53
528	0.53
529	0.6
530	0.66
531	0.73
532	0.72
533	0.75
534	0.72
535	0.64
536	0.68
537	0.64
538	0.59
539	0.52
540	0.45
541	0.37
542	0.39
543	0.39
544	0.32
545	0.34
546	0.34
547	0.32
548	0.31
549	0.29
550	0.26
551	0.25
552	0.23
553	0.23
554	0.21
555	0.29
556	0.29
557	0.31
558	0.32
559	0.35
560	0.41
561	0.38
562	0.4
563	0.34
564	0.4
565	0.38
566	0.36
567	0.35
568	0.29
569	0.3
570	0.26
571	0.23
572	0.15
573	0.15
574	0.14
575	0.12
576	0.12
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.13
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.12
585	0.12
586	0.12
587	0.11
588	0.09
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.11
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.1
599	0.13
600	0.13
601	0.16
602	0.22
603	0.24
604	0.25
605	0.26
606	0.27
607	0.27
608	0.29
609	0.27
610	0.27
611	0.3
612	0.35
613	0.39
614	0.39
615	0.44
616	0.47
617	0.52
618	0.5
619	0.53
620	0.52
621	0.49
622	0.52
623	0.49
624	0.44
625	0.4
626	0.4
627	0.35
628	0.35
629	0.39
630	0.38
631	0.4
632	0.45
633	0.47
634	0.47
635	0.45
636	0.46
637	0.45
638	0.47
639	0.48
640	0.49
641	0.56
642	0.54
643	0.63
644	0.68
645	0.72
646	0.71
647	0.67
648	0.68
649	0.69
650	0.72
651	0.72
652	0.67
653	0.63
654	0.64
655	0.66
656	0.65
657	0.61
658	0.65
659	0.62
660	0.63
661	0.6
662	0.58
663	0.63
664	0.64
665	0.65
666	0.62
667	0.65
668	0.69
669	0.76
670	0.82
671	0.83
672	0.85
673	0.88
674	0.9

A0A4Q4V8W0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer