Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XPP9

Protein Details
Accession A0A4V1XPP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-71DGVAPRAKMNQQRARRFRTALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-363KKIRR
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 13, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR016494  5_3_exoribonuclease_1  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR041385  SH3_12  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041106  XRN1_D2_D3  
IPR040486  Xrn1_D3  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR047008  XRN1_SH3_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF18129  SH3_12  
PF18332  XRN1_D1  
PF18334  XRN1_D2_D3  
PF18194  Xrn1_D3  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MNGIIHNCTHKDSHDTSFRLSEDEMFIRIFNYIEHLFGKIKPKKLFFMAIDGVAPRAKMNQQRARRFRTALDAEQAREKAIREGVELPKEDPFDSNCITPGTEFMAKLTRQLKYFINKKVTEDSDWQRCDIVLSGHEVPGEGEHKIMEYIRNAKAQPDYSPNVRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVTFGRPTKTKSKELEHQNFFLMHLCIVREYLELEVQELKKEGALKFPFDMERIIDDFILMAFFVGNDFLPNLPYLHINEGALATMFRIYKQILPQCEGYINEEGVINLPRLGLLLEQLSKEEYRHFEHDHADSKWLRSKQLTDVSGEEMARAKGKLVMTRAQKELWKKIRRFVHKRSTKALDLGSGLNAADRKFVQDAAENLHIEWRTVEDDDGQRHLLLSLPAKPDGADEEEEEEEEEEAHLALLRVTKRYDNAQVVDVSAEEAQASMQAKYKEKFLEWKEKYYTEKFEWTPENKVTELRNLCENYVQGLQWVLYYYYRGVASWPWFYGYHYSPMISDVEKGFSADLNFKLGQPFRPFEQLMGVLPDRSKKIVPSVYQDLMTNPKSPIIDFYPRDFKLDMNGKKMEWEAVVKIPFIDEERLLSAMAPRNELLSPDEKARNDFGVSLKFTYDPNVNFTYPSSMVGVFPDVRYCHCTENIFDLPTTDGLELYVGLKDGTKLGVDALAGFPSLATLPYNAALGFHGVNVFQQESRNESMVVTLADVEMRSRVESAKVKLGQKCFVGYPFLQEAKIVRVSDELFDYTLARDGSGQVVQTHHSGKDIEDWNKKASRIENFYSKRLGIITGPVESMVHVDMLKGLMKTDEGDTIKQYGMIPGMETDYAAQVIVDEVVSEDDRFIERAAIPLDEEFPVGSRSFFLGDYAYGRPVQVEGHSNNRAHVKLSVPQVKEPEFAGPIIARAERENRYQPSYAVAKDLGLHPLVLSKITSAFHVNTIGGNMRVNLGLNLKFDARKQKVLGYSRKSDTGWEFSPAAIKLLTEYMQNFPDFFAALLKNPQGKELDETDLWPDQNVATARIKEIGQWLKSIETSKFERVPLDAEQLDSDVVMELQRAVDAIKEDSSKTDIKKLNGVPRSALLQPKDAEQRLGSQKFRLGDRLVYVHAAGKVPIASKGTVVGISEIGSHNMLDVLCDDAFMNGTTLGGRCDPFRGQTVPANSVLNLTNKQLVVLSKTSWERRPAQPSPTPLQPGSLTEALVEAEGARGPTVVDEVTEVVGVTLVLPQPGPTRTLIVLHYQRAQATPLGSRITPSHRPLALMPAVVGMDVGVDVEEVMAGALEARLRLDRTVAALDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.45
4 0.48
5 0.46
6 0.41
7 0.37
8 0.33
9 0.29
10 0.28
11 0.25
12 0.21
13 0.21
14 0.18
15 0.18
16 0.15
17 0.1
18 0.14
19 0.13
20 0.15
21 0.16
22 0.18
23 0.2
24 0.24
25 0.35
26 0.36
27 0.44
28 0.49
29 0.53
30 0.56
31 0.59
32 0.62
33 0.53
34 0.55
35 0.49
36 0.43
37 0.4
38 0.34
39 0.31
40 0.24
41 0.22
42 0.14
43 0.16
44 0.22
45 0.28
46 0.39
47 0.47
48 0.56
49 0.67
50 0.76
51 0.81
52 0.81
53 0.76
54 0.69
55 0.69
56 0.66
57 0.6
58 0.6
59 0.55
60 0.49
61 0.53
62 0.5
63 0.41
64 0.36
65 0.32
66 0.28
67 0.28
68 0.27
69 0.24
70 0.3
71 0.35
72 0.4
73 0.4
74 0.36
75 0.37
76 0.37
77 0.35
78 0.3
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.23
84 0.23
85 0.22
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.18
91 0.19
92 0.25
93 0.24
94 0.31
95 0.35
96 0.33
97 0.31
98 0.35
99 0.4
100 0.43
101 0.51
102 0.53
103 0.57
104 0.55
105 0.58
106 0.63
107 0.6
108 0.55
109 0.56
110 0.55
111 0.55
112 0.55
113 0.51
114 0.43
115 0.39
116 0.36
117 0.29
118 0.24
119 0.15
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.19
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.12
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.17
136 0.23
137 0.27
138 0.32
139 0.31
140 0.34
141 0.38
142 0.37
143 0.36
144 0.37
145 0.38
146 0.4
147 0.47
148 0.46
149 0.46
150 0.44
151 0.4
152 0.33
153 0.32
154 0.28
155 0.23
156 0.22
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.11
162 0.09
163 0.06
164 0.04
165 0.03
166 0.04
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.15
175 0.16
176 0.18
177 0.18
178 0.21
179 0.2
180 0.21
181 0.25
182 0.22
183 0.26
184 0.26
185 0.3
186 0.37
187 0.42
188 0.48
189 0.51
190 0.57
191 0.61
192 0.7
193 0.75
194 0.7
195 0.66
196 0.6
197 0.54
198 0.46
199 0.4
200 0.3
201 0.2
202 0.16
203 0.15
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.21
220 0.2
221 0.23
222 0.25
223 0.27
224 0.27
225 0.3
226 0.29
227 0.26
228 0.27
229 0.19
230 0.2
231 0.19
232 0.19
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.06
239 0.04
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.12
254 0.14
255 0.15
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.12
261 0.09
262 0.06
263 0.08
264 0.09
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.15
269 0.23
270 0.28
271 0.28
272 0.31
273 0.33
274 0.32
275 0.33
276 0.3
277 0.27
278 0.24
279 0.2
280 0.18
281 0.16
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.11
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.17
302 0.21
303 0.26
304 0.28
305 0.29
306 0.32
307 0.36
308 0.37
309 0.35
310 0.35
311 0.32
312 0.33
313 0.38
314 0.36
315 0.35
316 0.33
317 0.35
318 0.37
319 0.43
320 0.41
321 0.36
322 0.36
323 0.35
324 0.34
325 0.31
326 0.24
327 0.17
328 0.17
329 0.16
330 0.14
331 0.12
332 0.14
333 0.16
334 0.19
335 0.21
336 0.27
337 0.32
338 0.37
339 0.38
340 0.37
341 0.4
342 0.42
343 0.49
344 0.52
345 0.55
346 0.53
347 0.59
348 0.65
349 0.72
350 0.75
351 0.75
352 0.75
353 0.75
354 0.77
355 0.77
356 0.74
357 0.66
358 0.6
359 0.51
360 0.41
361 0.35
362 0.3
363 0.23
364 0.17
365 0.14
366 0.12
367 0.12
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.15
376 0.16
377 0.19
378 0.23
379 0.21
380 0.2
381 0.23
382 0.21
383 0.18
384 0.17
385 0.14
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.13
390 0.16
391 0.18
392 0.2
393 0.19
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.16
401 0.18
402 0.18
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.17
407 0.18
408 0.13
409 0.12
410 0.14
411 0.14
412 0.14
413 0.14
414 0.12
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.05
419 0.05
420 0.04
421 0.05
422 0.04
423 0.05
424 0.09
425 0.1
426 0.11
427 0.13
428 0.15
429 0.16
430 0.2
431 0.26
432 0.26
433 0.27
434 0.27
435 0.26
436 0.25
437 0.23
438 0.19
439 0.13
440 0.09
441 0.08
442 0.05
443 0.05
444 0.04
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.11
449 0.14
450 0.18
451 0.19
452 0.23
453 0.23
454 0.23
455 0.31
456 0.33
457 0.41
458 0.4
459 0.45
460 0.45
461 0.47
462 0.51
463 0.47
464 0.46
465 0.38
466 0.42
467 0.36
468 0.38
469 0.41
470 0.38
471 0.39
472 0.36
473 0.36
474 0.3
475 0.32
476 0.29
477 0.3
478 0.3
479 0.26
480 0.29
481 0.27
482 0.27
483 0.26
484 0.25
485 0.19
486 0.18
487 0.17
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.07
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.11
502 0.14
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.15
507 0.16
508 0.19
509 0.18
510 0.19
511 0.17
512 0.17
513 0.15
514 0.17
515 0.17
516 0.13
517 0.13
518 0.09
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.1
527 0.12
528 0.13
529 0.13
530 0.16
531 0.17
532 0.2
533 0.21
534 0.23
535 0.21
536 0.25
537 0.25
538 0.22
539 0.23
540 0.19
541 0.16
542 0.17
543 0.16
544 0.12
545 0.12
546 0.14
547 0.13
548 0.14
549 0.14
550 0.12
551 0.17
552 0.21
553 0.23
554 0.27
555 0.31
556 0.31
557 0.31
558 0.3
559 0.26
560 0.26
561 0.25
562 0.21
563 0.16
564 0.17
565 0.16
566 0.16
567 0.18
568 0.17
569 0.23
570 0.23
571 0.26
572 0.32
573 0.32
574 0.34
575 0.31
576 0.26
577 0.27
578 0.35
579 0.34
580 0.31
581 0.32
582 0.3
583 0.31
584 0.31
585 0.24
586 0.16
587 0.14
588 0.11
589 0.13
590 0.14
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.1
597 0.07
598 0.07
599 0.08
600 0.09
601 0.08
602 0.08
603 0.1
604 0.13
605 0.13
606 0.13
607 0.13
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.14
612 0.12
613 0.12
614 0.15
615 0.19
616 0.17
617 0.19
618 0.2
619 0.18
620 0.16
621 0.17
622 0.14
623 0.15
624 0.15
625 0.14
626 0.13
627 0.13
628 0.13
629 0.14
630 0.15
631 0.12
632 0.15
633 0.18
634 0.17
635 0.17
636 0.17
637 0.18
638 0.15
639 0.15
640 0.12
641 0.1
642 0.1
643 0.1
644 0.11
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.08
649 0.09
650 0.12
651 0.13
652 0.14
653 0.15
654 0.16
655 0.15
656 0.21
657 0.22
658 0.19
659 0.17
660 0.16
661 0.15
662 0.14
663 0.14
664 0.08
665 0.06
666 0.05
667 0.06
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.03
692 0.04
693 0.04
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.06
700 0.06
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.05
705 0.06
706 0.07
707 0.06
708 0.08
709 0.08
710 0.12
711 0.13
712 0.14
713 0.13
714 0.13
715 0.12
716 0.11
717 0.11
718 0.07
719 0.06
720 0.05
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.06
728 0.06
729 0.11
730 0.15
731 0.17
732 0.23
733 0.28
734 0.32
735 0.36
736 0.38
737 0.37
738 0.33
739 0.33
740 0.26
741 0.22
742 0.21
743 0.17
744 0.18
745 0.18
746 0.18
747 0.16
748 0.16
749 0.16
750 0.16
751 0.19
752 0.15
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.14
757 0.14
758 0.12
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.08
763 0.1
764 0.09
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.09
769 0.09
770 0.1
771 0.08
772 0.09
773 0.1
774 0.12
775 0.13
776 0.11
777 0.12
778 0.12
779 0.11
780 0.18
781 0.23
782 0.27
783 0.32
784 0.33
785 0.36
786 0.39
787 0.39
788 0.35
789 0.34
790 0.34
791 0.34
792 0.36
793 0.42
794 0.42
795 0.44
796 0.43
797 0.38
798 0.32
799 0.26
800 0.24
801 0.14
802 0.15
803 0.14
804 0.12
805 0.12
806 0.11
807 0.11
808 0.1
809 0.1
810 0.07
811 0.06
812 0.05
813 0.05
814 0.05
815 0.06
816 0.08
817 0.07
818 0.07
819 0.06
820 0.07
821 0.08
822 0.08
823 0.13
824 0.13
825 0.14
826 0.14
827 0.16
828 0.16
829 0.16
830 0.15
831 0.11
832 0.11
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.09
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.06
841 0.06
842 0.05
843 0.05
844 0.04
845 0.04
846 0.04
847 0.03
848 0.03
849 0.03
850 0.04
851 0.05
852 0.05
853 0.05
854 0.06
855 0.06
856 0.07
857 0.07
858 0.08
859 0.08
860 0.1
861 0.11
862 0.1
863 0.1
864 0.1
865 0.11
866 0.1
867 0.1
868 0.07
869 0.07
870 0.08
871 0.08
872 0.08
873 0.07
874 0.08
875 0.09
876 0.09
877 0.09
878 0.08
879 0.08
880 0.11
881 0.11
882 0.12
883 0.11
884 0.11
885 0.11
886 0.1
887 0.11
888 0.1
889 0.14
890 0.15
891 0.22
892 0.27
893 0.27
894 0.29
895 0.32
896 0.3
897 0.26
898 0.26
899 0.22
900 0.22
901 0.31
902 0.36
903 0.34
904 0.36
905 0.39
906 0.38
907 0.37
908 0.32
909 0.26
910 0.19
911 0.18
912 0.16
913 0.12
914 0.11
915 0.12
916 0.12
917 0.1
918 0.11
919 0.17
920 0.18
921 0.23
922 0.29
923 0.31
924 0.35
925 0.36
926 0.34
927 0.34
928 0.34
929 0.3
930 0.25
931 0.22
932 0.18
933 0.18
934 0.19
935 0.16
936 0.12
937 0.12
938 0.09
939 0.11
940 0.11
941 0.1
942 0.09
943 0.08
944 0.1
945 0.1
946 0.11
947 0.12
948 0.13
949 0.13
950 0.15
951 0.14
952 0.12
953 0.14
954 0.14
955 0.11
956 0.11
957 0.1
958 0.1
959 0.1
960 0.1
961 0.1
962 0.12
963 0.13
964 0.13
965 0.15
966 0.15
967 0.16
968 0.19
969 0.29
970 0.29
971 0.33
972 0.34
973 0.38
974 0.44
975 0.51
976 0.57
977 0.53
978 0.56
979 0.53
980 0.55
981 0.5
982 0.46
983 0.42
984 0.39
985 0.33
986 0.3
987 0.28
988 0.25
989 0.28
990 0.24
991 0.21
992 0.15
993 0.13
994 0.11
995 0.12
996 0.12
997 0.1
998 0.12
999 0.14
1000 0.16
1001 0.16
1002 0.15
1003 0.14
1004 0.14
1005 0.12
1006 0.11
1007 0.12
1008 0.1
1009 0.12
1010 0.15
1011 0.18
1012 0.22
1013 0.22
1014 0.24
1015 0.22
1016 0.22
1017 0.25
1018 0.25
1019 0.26
1020 0.22
1021 0.23
1022 0.24
1023 0.25
1024 0.23
1025 0.19
1026 0.17
1027 0.12
1028 0.17
1029 0.17
1030 0.17
1031 0.19
1032 0.2
1033 0.2
1034 0.22
1035 0.22
1036 0.19
1037 0.27
1038 0.3
1039 0.26
1040 0.27
1041 0.27
1042 0.26
1043 0.28
1044 0.29
1045 0.23
1046 0.21
1047 0.25
1048 0.29
1049 0.31
1050 0.31
1051 0.3
1052 0.28
1053 0.3
1054 0.28
1055 0.29
1056 0.23
1057 0.21
1058 0.2
1059 0.19
1060 0.18
1061 0.14
1062 0.12
1063 0.06
1064 0.06
1065 0.05
1066 0.05
1067 0.05
1068 0.05
1069 0.05
1070 0.05
1071 0.05
1072 0.06
1073 0.08
1074 0.09
1075 0.12
1076 0.13
1077 0.14
1078 0.15
1079 0.19
1080 0.22
1081 0.23
1082 0.3
1083 0.33
1084 0.34
1085 0.42
1086 0.46
1087 0.52
1088 0.53
1089 0.53
1090 0.45
1091 0.42
1092 0.44
1093 0.39
1094 0.38
1095 0.31
1096 0.31
1097 0.3
1098 0.34
1099 0.4
1100 0.37
1101 0.35
1102 0.3
1103 0.37
1104 0.41
1105 0.46
1106 0.42
1107 0.38
1108 0.41
1109 0.42
1110 0.43
1111 0.41
1112 0.33
1113 0.3
1114 0.32
1115 0.32
1116 0.29
1117 0.27
1118 0.25
1119 0.23
1120 0.23
1121 0.2
1122 0.17
1123 0.15
1124 0.15
1125 0.15
1126 0.17
1127 0.16
1128 0.15
1129 0.14
1130 0.16
1131 0.15
1132 0.14
1133 0.14
1134 0.12
1135 0.1
1136 0.1
1137 0.12
1138 0.11
1139 0.11
1140 0.11
1141 0.1
1142 0.09
1143 0.1
1144 0.1
1145 0.08
1146 0.08
1147 0.1
1148 0.09
1149 0.1
1150 0.1
1151 0.09
1152 0.1
1153 0.1
1154 0.1
1155 0.07
1156 0.07
1157 0.08
1158 0.08
1159 0.1
1160 0.11
1161 0.11
1162 0.12
1163 0.16
1164 0.18
1165 0.2
1166 0.24
1167 0.25
1168 0.26
1169 0.32
1170 0.36
1171 0.36
1172 0.36
1173 0.34
1174 0.3
1175 0.29
1176 0.29
1177 0.27
1178 0.23
1179 0.22
1180 0.24
1181 0.23
1182 0.23
1183 0.23
1184 0.22
1185 0.22
1186 0.23
1187 0.22
1188 0.24
1189 0.31
1190 0.37
1191 0.4
1192 0.44
1193 0.46
1194 0.52
1195 0.6
1196 0.6
1197 0.62
1198 0.62
1199 0.64
1200 0.63
1201 0.64
1202 0.61
1203 0.52
1204 0.5
1205 0.43
1206 0.38
1207 0.38
1208 0.33
1209 0.26
1210 0.2
1211 0.2
1212 0.17
1213 0.15
1214 0.13
1215 0.06
1216 0.06
1217 0.07
1218 0.07
1219 0.07
1220 0.06
1221 0.07
1222 0.07
1223 0.08
1224 0.08
1225 0.07
1226 0.08
1227 0.09
1228 0.09
1229 0.09
1230 0.08
1231 0.07
1232 0.07
1233 0.06
1234 0.05
1235 0.07
1236 0.08
1237 0.08
1238 0.08
1239 0.1
1240 0.14
1241 0.15
1242 0.17
1243 0.16
1244 0.19
1245 0.2
1246 0.23
1247 0.23
1248 0.28
1249 0.33
1250 0.35
1251 0.38
1252 0.37
1253 0.38
1254 0.36
1255 0.36
1256 0.3
1257 0.26
1258 0.26
1259 0.25
1260 0.26
1261 0.25
1262 0.26
1263 0.28
1264 0.33
1265 0.38
1266 0.39
1267 0.43
1268 0.41
1269 0.44
1270 0.43
1271 0.46
1272 0.41
1273 0.34
1274 0.3
1275 0.23
1276 0.22
1277 0.19
1278 0.18
1279 0.09
1280 0.06
1281 0.05
1282 0.05
1283 0.03
1284 0.03
1285 0.03
1286 0.03
1287 0.03
1288 0.03
1289 0.03
1290 0.03
1291 0.03
1292 0.03
1293 0.04
1294 0.05
1295 0.06
1296 0.07
1297 0.1
1298 0.12
1299 0.13
1300 0.15
1301 0.15
1302 0.18