Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VU56

Protein Details
Accession A0A4Q4VU56    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-96EEVCGRAPTKKQKGRVMPRERLEARHydrophilic
427-448LEKYERPKRQTVAKQPNKIFANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
485-486KR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 10, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MVDFDRERRIQDAKDFIAEGGSETLASVRFDIPQSTLSHRVHGSKSRSEAKASARKLSDQEEQKLVDWVLLEEVCGRAPTKKQKGRVMPRERLEARDRDEVHEFFPLLAQIRAKYNIQPANEYNMDETGVQEGEQADGTVVGSSETARTRFGESGATLWISIIEYIGFTYGRGTAAYIFSGLTVQKQWFPDDIEEAEYTATPKGWTNSVVALEWLESIFLPETKPRFHHEWRLLILDGHITHVSPAFMWKCIENKVALVYLPPHSSADLQPLDVSVFSVLKKEYRRALREAGGVLATAPQYKRRMLEAYREAAEIAFTDKNIKAGWRHTGILPLRPETVLKDPEIAPQPAPKPKTPPEEVITTRNEVIHTPHRAKELRRSMRTAVRNHAKASRDIRGVVAKAAKGLDDLNTENTTLRYENRYLRAKLEKYERPKRQTVAKQPNKIFANLADIRSAEDKATKRLKPMEAGDQVTIDSYIEKQPARKRQRNSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.37
4 0.33
5 0.28
6 0.22
7 0.16
8 0.13
9 0.1
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.19
21 0.22
22 0.26
23 0.34
24 0.33
25 0.36
26 0.38
27 0.41
28 0.43
29 0.48
30 0.49
31 0.48
32 0.54
33 0.58
34 0.57
35 0.56
36 0.55
37 0.57
38 0.6
39 0.56
40 0.57
41 0.5
42 0.52
43 0.52
44 0.52
45 0.5
46 0.48
47 0.5
48 0.46
49 0.46
50 0.43
51 0.42
52 0.37
53 0.29
54 0.22
55 0.17
56 0.15
57 0.13
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.2
66 0.31
67 0.41
68 0.48
69 0.56
70 0.65
71 0.75
72 0.82
73 0.85
74 0.84
75 0.83
76 0.8
77 0.82
78 0.74
79 0.69
80 0.65
81 0.6
82 0.56
83 0.55
84 0.52
85 0.46
86 0.5
87 0.44
88 0.39
89 0.35
90 0.3
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.17
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.29
103 0.32
104 0.32
105 0.35
106 0.33
107 0.37
108 0.37
109 0.34
110 0.27
111 0.23
112 0.22
113 0.17
114 0.16
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.12
173 0.13
174 0.15
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.15
212 0.18
213 0.25
214 0.28
215 0.37
216 0.39
217 0.41
218 0.41
219 0.42
220 0.37
221 0.31
222 0.28
223 0.2
224 0.15
225 0.12
226 0.1
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.12
238 0.14
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.07
267 0.11
268 0.14
269 0.17
270 0.23
271 0.3
272 0.34
273 0.36
274 0.4
275 0.39
276 0.39
277 0.36
278 0.3
279 0.23
280 0.18
281 0.14
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.13
287 0.15
288 0.17
289 0.18
290 0.2
291 0.25
292 0.25
293 0.34
294 0.35
295 0.36
296 0.35
297 0.34
298 0.31
299 0.26
300 0.23
301 0.14
302 0.12
303 0.09
304 0.08
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.17
312 0.23
313 0.22
314 0.23
315 0.23
316 0.31
317 0.3
318 0.33
319 0.33
320 0.29
321 0.27
322 0.26
323 0.26
324 0.21
325 0.26
326 0.22
327 0.2
328 0.22
329 0.21
330 0.26
331 0.3
332 0.28
333 0.23
334 0.26
335 0.31
336 0.35
337 0.38
338 0.35
339 0.38
340 0.44
341 0.52
342 0.5
343 0.51
344 0.47
345 0.51
346 0.51
347 0.49
348 0.45
349 0.39
350 0.36
351 0.31
352 0.28
353 0.22
354 0.24
355 0.27
356 0.31
357 0.33
358 0.35
359 0.41
360 0.44
361 0.47
362 0.52
363 0.55
364 0.58
365 0.59
366 0.61
367 0.61
368 0.65
369 0.69
370 0.64
371 0.63
372 0.63
373 0.61
374 0.59
375 0.59
376 0.53
377 0.53
378 0.53
379 0.5
380 0.43
381 0.4
382 0.4
383 0.39
384 0.37
385 0.34
386 0.32
387 0.25
388 0.24
389 0.24
390 0.21
391 0.17
392 0.17
393 0.14
394 0.14
395 0.15
396 0.17
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.16
403 0.18
404 0.2
405 0.24
406 0.31
407 0.38
408 0.45
409 0.45
410 0.5
411 0.57
412 0.55
413 0.57
414 0.6
415 0.6
416 0.63
417 0.72
418 0.75
419 0.73
420 0.77
421 0.75
422 0.76
423 0.77
424 0.78
425 0.79
426 0.79
427 0.81
428 0.78
429 0.82
430 0.74
431 0.65
432 0.56
433 0.46
434 0.45
435 0.39
436 0.36
437 0.29
438 0.26
439 0.28
440 0.27
441 0.27
442 0.19
443 0.22
444 0.24
445 0.31
446 0.4
447 0.39
448 0.45
449 0.52
450 0.55
451 0.55
452 0.58
453 0.59
454 0.56
455 0.57
456 0.51
457 0.44
458 0.39
459 0.33
460 0.28
461 0.18
462 0.12
463 0.11
464 0.14
465 0.19
466 0.21
467 0.28
468 0.37
469 0.48
470 0.58
471 0.64