Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4VMM2

Protein Details
Accession A0A4Q4VMM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-270RRTFNRYLEKKGSNRKRDDRSSSSRFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MAPANTRSQGGPSSQQQPSPAPKETIEVQENEPEEEEKESDSPKGKEKEFTIDDKLRTLMTELQAIRRENARLARQQRSSTLPLFGANQSRENTVPPPVYYGMPEVKGYKPTPPKPYDGTTDVEGFLFQPIMEDYLGNYPDESSDLTNYIFSDYEHLEERMRALFGDPDKQQDAVKKLHLLQQTKSAAKYTTEFNRLAATSHLPESALFYPYYDGLKLQVKDEMYRVPKIGPFQDYTDKAIIAGRRTFNRYLEKKGSNRKRDDRSSSSRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.41
4 0.45
5 0.5
6 0.49
7 0.47
8 0.42
9 0.4
10 0.42
11 0.42
12 0.43
13 0.38
14 0.35
15 0.33
16 0.35
17 0.35
18 0.32
19 0.3
20 0.23
21 0.21
22 0.2
23 0.18
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.19
28 0.24
29 0.25
30 0.31
31 0.37
32 0.37
33 0.41
34 0.42
35 0.47
36 0.45
37 0.47
38 0.47
39 0.47
40 0.46
41 0.42
42 0.41
43 0.31
44 0.28
45 0.25
46 0.21
47 0.17
48 0.22
49 0.21
50 0.26
51 0.31
52 0.32
53 0.31
54 0.29
55 0.29
56 0.27
57 0.33
58 0.34
59 0.37
60 0.43
61 0.49
62 0.5
63 0.51
64 0.5
65 0.49
66 0.48
67 0.41
68 0.36
69 0.29
70 0.25
71 0.25
72 0.24
73 0.24
74 0.21
75 0.23
76 0.22
77 0.23
78 0.23
79 0.23
80 0.22
81 0.2
82 0.2
83 0.17
84 0.19
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.19
89 0.16
90 0.16
91 0.17
92 0.16
93 0.16
94 0.2
95 0.2
96 0.25
97 0.32
98 0.36
99 0.44
100 0.44
101 0.47
102 0.46
103 0.49
104 0.46
105 0.4
106 0.36
107 0.29
108 0.27
109 0.24
110 0.19
111 0.17
112 0.12
113 0.09
114 0.07
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.11
152 0.11
153 0.17
154 0.16
155 0.18
156 0.19
157 0.2
158 0.21
159 0.22
160 0.25
161 0.23
162 0.25
163 0.24
164 0.25
165 0.3
166 0.34
167 0.33
168 0.3
169 0.36
170 0.39
171 0.38
172 0.37
173 0.33
174 0.28
175 0.27
176 0.27
177 0.24
178 0.25
179 0.28
180 0.28
181 0.26
182 0.28
183 0.27
184 0.26
185 0.22
186 0.19
187 0.16
188 0.17
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.18
193 0.17
194 0.16
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.12
201 0.1
202 0.12
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.22
207 0.22
208 0.23
209 0.25
210 0.3
211 0.27
212 0.29
213 0.29
214 0.27
215 0.29
216 0.32
217 0.34
218 0.3
219 0.29
220 0.32
221 0.39
222 0.39
223 0.41
224 0.38
225 0.33
226 0.3
227 0.31
228 0.29
229 0.25
230 0.29
231 0.3
232 0.34
233 0.4
234 0.43
235 0.45
236 0.53
237 0.52
238 0.56
239 0.59
240 0.63
241 0.66
242 0.74
243 0.79
244 0.79
245 0.84
246 0.85
247 0.86
248 0.87
249 0.87
250 0.85