Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1XQ78

Protein Details
Accession A0A4V1XQ78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-311GATPPPPRGGRKKEHRHAHGQHQLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-303PPRGGRKKEHR
340-365PKAASGISPPPKAASGISPPPKAASG
369-371PPR
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007583  GRASP55_65  
IPR024958  GRASP_PDZ  
IPR036034  PDZ_sf  
Gene Ontology GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04495  GRASP55_65  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51865  PDZ_GRASP  
Amino Acid Sequences MFNALNRFIARLDGDPQQQQQRQRESYGFQVLRNTNLELAIEPWFDFIVGINGRMIDNPDSRLFAQEVRNCAGGSVSLGIWSAKGQRTRALHIPVPATTGSLGLSLQWTPLSAASENVWHVLDVAANSPADAAGLLPYGDYVLGTPDGTLHGEAALGELVDDHVNLGRPLRLWVYNHEYDVTREVAVTPSREWGGEGALGCVLGYGALHRLPAPLSEPVHAPGETLFDGDNDGQFATLAPPAAADASSASGDAFVPGAGVPAPPPPSSNEFVIPAQMVATTSSPANGGATPPPPRGGRKKEHRHAHGQHQLDDYFAEQEKKSKELEGSVTASKSPPPPPPKAASGISPPPKAASGISPPPKAASGIPSPPRVGSGIHPPPKAGLGIPPPPRATPKPQAATEGGDDDVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.38
4 0.45
5 0.48
6 0.54
7 0.59
8 0.63
9 0.62
10 0.63
11 0.61
12 0.55
13 0.57
14 0.59
15 0.52
16 0.44
17 0.49
18 0.45
19 0.45
20 0.44
21 0.38
22 0.29
23 0.27
24 0.26
25 0.18
26 0.18
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.15
42 0.17
43 0.16
44 0.17
45 0.2
46 0.21
47 0.24
48 0.24
49 0.26
50 0.25
51 0.25
52 0.31
53 0.32
54 0.35
55 0.34
56 0.35
57 0.32
58 0.3
59 0.25
60 0.17
61 0.14
62 0.12
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.13
70 0.17
71 0.21
72 0.22
73 0.28
74 0.32
75 0.37
76 0.42
77 0.43
78 0.41
79 0.41
80 0.42
81 0.36
82 0.35
83 0.29
84 0.23
85 0.17
86 0.14
87 0.11
88 0.09
89 0.08
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.04
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.18
161 0.24
162 0.25
163 0.25
164 0.25
165 0.23
166 0.22
167 0.23
168 0.19
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.02
192 0.02
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.07
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.14
253 0.18
254 0.21
255 0.22
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.18
261 0.13
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.14
277 0.17
278 0.18
279 0.22
280 0.23
281 0.3
282 0.38
283 0.44
284 0.51
285 0.58
286 0.68
287 0.74
288 0.82
289 0.82
290 0.83
291 0.81
292 0.81
293 0.78
294 0.71
295 0.65
296 0.58
297 0.52
298 0.41
299 0.35
300 0.25
301 0.2
302 0.19
303 0.17
304 0.14
305 0.2
306 0.22
307 0.24
308 0.24
309 0.24
310 0.24
311 0.25
312 0.28
313 0.27
314 0.29
315 0.29
316 0.29
317 0.26
318 0.26
319 0.25
320 0.26
321 0.26
322 0.31
323 0.36
324 0.42
325 0.47
326 0.51
327 0.52
328 0.53
329 0.5
330 0.45
331 0.45
332 0.48
333 0.49
334 0.45
335 0.41
336 0.38
337 0.36
338 0.34
339 0.28
340 0.23
341 0.23
342 0.32
343 0.38
344 0.38
345 0.37
346 0.38
347 0.37
348 0.34
349 0.29
350 0.25
351 0.24
352 0.32
353 0.37
354 0.39
355 0.4
356 0.38
357 0.38
358 0.34
359 0.29
360 0.24
361 0.29
362 0.36
363 0.42
364 0.42
365 0.41
366 0.41
367 0.41
368 0.39
369 0.29
370 0.26
371 0.26
372 0.34
373 0.4
374 0.44
375 0.45
376 0.47
377 0.53
378 0.52
379 0.54
380 0.55
381 0.59
382 0.61
383 0.6
384 0.63
385 0.58
386 0.56
387 0.5
388 0.42