Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4X5C5

Protein Details
Accession A0A4Q4X5C5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24AVPVRRKKMIGHRRRVEDEGBasic
165-185EVPIERRRREHDEYRRKRDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-220RGR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
IPR044796  MLN51_plant  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MSDMAVPVRRKKMIGHRRRVEDEGEDDGGIDQLDIDDDSLTEGSIASDDHDLADDSDTSNVDEASPTTPALRKSNGRGANGNGTKKRTHRNAPGTTGTGTEKPTKPQESAVNDTEFMLNGLKIADAAEPVQELSFEDGVTEPPPKTSAPIVVSSASAATAKSNQEVPIERRRREHDEYRRKRDEDPAFVPNRGAFFMHDHRHAGPAANGFRPFGRAGRGRGRGGIGGPFAPMSQQLHNPADPITNAPWAHDMHETVAQPLPARQVRQPFIDDGPPNGDGYIPTCPNSSSPINRHMATEKVLGNVQIRVYIPSMEEPVVFSSIPVKQYTKLPDHRPPLRRDKPVRISLPDLPPRFRFPAEDRSFIFIPRALRPNQQRLRGKPRSGLGSIGGFSRRTSVFGGSYYGGSVYSPSVAAMSRRSSIAPDMGRDFIVSPSGSAISRPPLPLDSARPVVRLPPQSRQEQQIAIPDGVVAEQPAEAVQPTISDLPQPQTHPLPQKPAFHENRPASIPMHQPRPQKTVSVADIESPTVQQTQPQPYQQAFHQQVPVQVSNGLGQDSHARHPSYPSQHSTGTPLSQIPERAIHAAPFQPQPAQYAQQIYYPAYQMGPATQPYYYPQPGYPGTMAPSAAAPPFVTGVQQGQSQSESPANQPGGQAQPGSNLVAQEVNGMVYYYDASQLAPVSTYPPYSAPQGYPMAGGMVTGPDGYYYPPSGPGVVYYPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.7
3 0.72
4 0.78
5 0.83
6 0.78
7 0.71
8 0.65
9 0.58
10 0.52
11 0.44
12 0.35
13 0.29
14 0.26
15 0.22
16 0.16
17 0.12
18 0.07
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.12
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.14
55 0.17
56 0.21
57 0.25
58 0.31
59 0.34
60 0.41
61 0.5
62 0.53
63 0.54
64 0.53
65 0.53
66 0.57
67 0.58
68 0.6
69 0.56
70 0.53
71 0.55
72 0.58
73 0.64
74 0.62
75 0.65
76 0.67
77 0.72
78 0.76
79 0.76
80 0.75
81 0.67
82 0.59
83 0.52
84 0.44
85 0.37
86 0.33
87 0.34
88 0.31
89 0.34
90 0.42
91 0.43
92 0.41
93 0.44
94 0.49
95 0.48
96 0.52
97 0.51
98 0.45
99 0.42
100 0.41
101 0.35
102 0.27
103 0.21
104 0.15
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.15
133 0.16
134 0.2
135 0.2
136 0.23
137 0.24
138 0.23
139 0.22
140 0.2
141 0.18
142 0.13
143 0.11
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.15
150 0.16
151 0.2
152 0.25
153 0.29
154 0.36
155 0.43
156 0.44
157 0.49
158 0.54
159 0.59
160 0.61
161 0.67
162 0.67
163 0.7
164 0.78
165 0.82
166 0.84
167 0.78
168 0.73
169 0.73
170 0.69
171 0.66
172 0.6
173 0.59
174 0.53
175 0.51
176 0.49
177 0.4
178 0.33
179 0.26
180 0.21
181 0.14
182 0.17
183 0.23
184 0.26
185 0.27
186 0.28
187 0.28
188 0.3
189 0.29
190 0.25
191 0.2
192 0.23
193 0.23
194 0.24
195 0.24
196 0.22
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.16
201 0.2
202 0.21
203 0.26
204 0.35
205 0.4
206 0.38
207 0.39
208 0.39
209 0.34
210 0.31
211 0.27
212 0.19
213 0.14
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.18
223 0.21
224 0.21
225 0.21
226 0.2
227 0.19
228 0.17
229 0.17
230 0.14
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.18
235 0.17
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.14
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.19
248 0.17
249 0.19
250 0.21
251 0.27
252 0.29
253 0.32
254 0.33
255 0.29
256 0.28
257 0.32
258 0.29
259 0.23
260 0.24
261 0.22
262 0.2
263 0.17
264 0.15
265 0.09
266 0.11
267 0.13
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.17
274 0.19
275 0.2
276 0.23
277 0.29
278 0.32
279 0.32
280 0.33
281 0.31
282 0.29
283 0.26
284 0.26
285 0.2
286 0.18
287 0.18
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.18
314 0.23
315 0.28
316 0.33
317 0.38
318 0.44
319 0.51
320 0.58
321 0.6
322 0.62
323 0.66
324 0.67
325 0.7
326 0.68
327 0.71
328 0.7
329 0.71
330 0.68
331 0.6
332 0.56
333 0.53
334 0.54
335 0.51
336 0.45
337 0.4
338 0.38
339 0.39
340 0.37
341 0.31
342 0.28
343 0.25
344 0.34
345 0.35
346 0.36
347 0.33
348 0.35
349 0.35
350 0.32
351 0.28
352 0.19
353 0.18
354 0.19
355 0.22
356 0.19
357 0.25
358 0.31
359 0.41
360 0.44
361 0.5
362 0.53
363 0.56
364 0.65
365 0.66
366 0.63
367 0.57
368 0.54
369 0.5
370 0.44
371 0.38
372 0.29
373 0.22
374 0.2
375 0.17
376 0.15
377 0.11
378 0.1
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.08
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.17
409 0.16
410 0.16
411 0.17
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.15
416 0.1
417 0.11
418 0.09
419 0.08
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.12
430 0.15
431 0.16
432 0.19
433 0.21
434 0.23
435 0.23
436 0.23
437 0.23
438 0.24
439 0.28
440 0.32
441 0.31
442 0.35
443 0.39
444 0.44
445 0.46
446 0.47
447 0.44
448 0.38
449 0.36
450 0.34
451 0.32
452 0.27
453 0.24
454 0.19
455 0.16
456 0.14
457 0.13
458 0.06
459 0.04
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.12
474 0.15
475 0.17
476 0.19
477 0.21
478 0.26
479 0.33
480 0.35
481 0.4
482 0.43
483 0.48
484 0.51
485 0.57
486 0.57
487 0.54
488 0.61
489 0.54
490 0.53
491 0.48
492 0.44
493 0.35
494 0.35
495 0.39
496 0.34
497 0.41
498 0.43
499 0.48
500 0.51
501 0.55
502 0.52
503 0.45
504 0.43
505 0.41
506 0.38
507 0.35
508 0.3
509 0.27
510 0.26
511 0.25
512 0.22
513 0.16
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.18
519 0.26
520 0.3
521 0.32
522 0.35
523 0.34
524 0.37
525 0.34
526 0.39
527 0.35
528 0.34
529 0.35
530 0.33
531 0.35
532 0.39
533 0.38
534 0.28
535 0.25
536 0.22
537 0.2
538 0.19
539 0.15
540 0.1
541 0.1
542 0.16
543 0.17
544 0.21
545 0.23
546 0.24
547 0.24
548 0.29
549 0.37
550 0.38
551 0.42
552 0.43
553 0.42
554 0.43
555 0.43
556 0.44
557 0.39
558 0.32
559 0.27
560 0.24
561 0.22
562 0.23
563 0.23
564 0.2
565 0.2
566 0.2
567 0.22
568 0.21
569 0.2
570 0.2
571 0.22
572 0.24
573 0.23
574 0.23
575 0.22
576 0.22
577 0.24
578 0.25
579 0.25
580 0.24
581 0.26
582 0.26
583 0.26
584 0.27
585 0.26
586 0.25
587 0.23
588 0.21
589 0.16
590 0.16
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.14
595 0.15
596 0.14
597 0.15
598 0.18
599 0.25
600 0.25
601 0.24
602 0.23
603 0.27
604 0.29
605 0.32
606 0.3
607 0.24
608 0.24
609 0.24
610 0.23
611 0.18
612 0.17
613 0.15
614 0.14
615 0.13
616 0.1
617 0.09
618 0.11
619 0.1
620 0.1
621 0.1
622 0.12
623 0.13
624 0.16
625 0.16
626 0.16
627 0.18
628 0.18
629 0.2
630 0.21
631 0.21
632 0.2
633 0.27
634 0.27
635 0.26
636 0.26
637 0.27
638 0.28
639 0.28
640 0.27
641 0.21
642 0.23
643 0.23
644 0.24
645 0.21
646 0.17
647 0.16
648 0.16
649 0.15
650 0.13
651 0.12
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.08
656 0.07
657 0.08
658 0.07
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.09
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.13
669 0.14
670 0.14
671 0.15
672 0.17
673 0.21
674 0.24
675 0.23
676 0.26
677 0.28
678 0.27
679 0.25
680 0.24
681 0.2
682 0.16
683 0.15
684 0.1
685 0.08
686 0.08
687 0.07
688 0.07
689 0.06
690 0.07
691 0.09
692 0.12
693 0.13
694 0.14
695 0.17
696 0.18
697 0.19
698 0.18
699 0.19