FuNGI

A0A4Q4W9H2

Protein Details

Accession

A0A4Q4W9H2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-54	AASASDRKDKSSKKEHKSKKRHRETTDNTEASERKHKKSKSRVSLGDGDG	Basic
71-93	DEVGADRKKSKKYKKADLAIDVE	Hydrophilic
118-143	QDDAPSKEKKRSKKDKRRNDTQEGET	Basic
159-189	SQDVPSSQHKKKKKERRKEKRRETVQPEPMD	Basic
447-468	IEADRRRKLKHGGLLRKPFKRL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-28	RKDKSSKKEHKSKKRHRE
37-44	ERKHKKSK
77-85	RKKSKKYKK
123-135	SKEKKRSKKDKRR
167-180	HKKKKKERRKEKRR
451-467	RRRKLKHGGLLRKPFKR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSSPAASASDRKDKSSKKEHKSKKRHRETTDNTEASERKHKKSKSRVSLGDGDGVTANQSESSAPAPPAADEVGADRKKSKKYKKADLAIDVEPKAEAAEDDGKHKGGSRKQLGEDVQDDAPSKEKKRSKKDKRRNDTQEGETAAADVDVAQAAVIPDSQDVPSSQHKKKKKERRKEKRRETVQPEPMDIAPAPSRPTPATSQAHGDRPDVSFPFFTQTVSQYLPLFPSGMVEPIEGYAEQHLRPLLNRYVPAFRGVLLSYRNPRIGEAPGKDSLTDASQMEDTALLESIDEYAVGFSWLTVEADLFCPKRGSWMEGSLNLQSEGFIGVICFGMFNASIEASRLPSGWKWVDLLSKKGRKQQNGKSAAETKLPTPEPQDENGVEDDGADQAHSTGYWVDESGSKVGGKLRFRIKNYEVGSVGDYGYLSIEGTMLDEEVERAKVADEIEADRRRKLKHGGLLRKPFKRLPEFSMTKFRNGDEQEDDMLRSNKSKSNRPGTITSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.67
3	0.71
4	0.71
5	0.81
6	0.87
7	0.89
8	0.93
9	0.95
10	0.95
11	0.96
12	0.95
13	0.92
14	0.93
15	0.91
16	0.9
17	0.89
18	0.79
19	0.69
20	0.65
21	0.59
22	0.53
23	0.54
24	0.5
25	0.47
26	0.55
27	0.61
28	0.65
29	0.75
30	0.81
31	0.81
32	0.84
33	0.83
34	0.8
35	0.81
36	0.73
37	0.68
38	0.56
39	0.46
40	0.37
41	0.3
42	0.23
43	0.15
44	0.14
45	0.07
46	0.08
47	0.07
48	0.08
49	0.09
50	0.11
51	0.11
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.14
57	0.12
58	0.09
59	0.12
60	0.21
61	0.22
62	0.23
63	0.26
64	0.32
65	0.41
66	0.51
67	0.59
68	0.59
69	0.68
70	0.78
71	0.83
72	0.86
73	0.84
74	0.81
75	0.75
76	0.7
77	0.65
78	0.54
79	0.44
80	0.34
81	0.27
82	0.2
83	0.15
84	0.1
85	0.08
86	0.15
87	0.15
88	0.19
89	0.2
90	0.21
91	0.21
92	0.26
93	0.29
94	0.28
95	0.38
96	0.43
97	0.47
98	0.49
99	0.55
100	0.52
101	0.5
102	0.45
103	0.38
104	0.31
105	0.26
106	0.25
107	0.19
108	0.24
109	0.24
110	0.25
111	0.31
112	0.37
113	0.46
114	0.56
115	0.67
116	0.72
117	0.79
118	0.88
119	0.9
120	0.93
121	0.94
122	0.93
123	0.91
124	0.87
125	0.79
126	0.73
127	0.64
128	0.55
129	0.44
130	0.34
131	0.24
132	0.16
133	0.12
134	0.07
135	0.05
136	0.03
137	0.03
138	0.03
139	0.03
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.04
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.11
150	0.2
151	0.27
152	0.34
153	0.41
154	0.49
155	0.59
156	0.69
157	0.77
158	0.79
159	0.83
160	0.88
161	0.91
162	0.95
163	0.96
164	0.96
165	0.96
166	0.94
167	0.93
168	0.9
169	0.89
170	0.86
171	0.76
172	0.66
173	0.57
174	0.48
175	0.39
176	0.3
177	0.22
178	0.14
179	0.14
180	0.15
181	0.13
182	0.15
183	0.14
184	0.17
185	0.17
186	0.24
187	0.26
188	0.24
189	0.29
190	0.31
191	0.35
192	0.34
193	0.32
194	0.25
195	0.24
196	0.25
197	0.2
198	0.19
199	0.14
200	0.13
201	0.15
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.14
207	0.14
208	0.15
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.06
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.09
230	0.08
231	0.09
232	0.13
233	0.14
234	0.15
235	0.16
236	0.17
237	0.2
238	0.2
239	0.21
240	0.17
241	0.14
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.15
247	0.17
248	0.19
249	0.2
250	0.19
251	0.19
252	0.19
253	0.21
254	0.24
255	0.22
256	0.23
257	0.23
258	0.23
259	0.23
260	0.21
261	0.18
262	0.13
263	0.12
264	0.09
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.03
284	0.03
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.07
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.11
297	0.18
298	0.18
299	0.2
300	0.2
301	0.26
302	0.27
303	0.28
304	0.31
305	0.25
306	0.25
307	0.21
308	0.19
309	0.12
310	0.1
311	0.08
312	0.06
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.17
338	0.24
339	0.25
340	0.32
341	0.36
342	0.43
343	0.46
344	0.53
345	0.59
346	0.61
347	0.68
348	0.71
349	0.72
350	0.72
351	0.7
352	0.68
353	0.66
354	0.59
355	0.54
356	0.45
357	0.36
358	0.35
359	0.34
360	0.29
361	0.28
362	0.33
363	0.31
364	0.32
365	0.35
366	0.28
367	0.29
368	0.29
369	0.25
370	0.18
371	0.15
372	0.13
373	0.09
374	0.08
375	0.06
376	0.05
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.07
386	0.1
387	0.12
388	0.12
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.19
393	0.24
394	0.24
395	0.3
396	0.38
397	0.44
398	0.48
399	0.55
400	0.53
401	0.56
402	0.56
403	0.55
404	0.46
405	0.4
406	0.38
407	0.3
408	0.27
409	0.19
410	0.16
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.08
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.1
431	0.12
432	0.12
433	0.16
434	0.25
435	0.32
436	0.33
437	0.37
438	0.41
439	0.42
440	0.46
441	0.51
442	0.51
443	0.52
444	0.62
445	0.67
446	0.73
447	0.81
448	0.84
449	0.82
450	0.79
451	0.75
452	0.73
453	0.72
454	0.67
455	0.63
456	0.65
457	0.64
458	0.64
459	0.7
460	0.63
461	0.6
462	0.57
463	0.51
464	0.49
465	0.46
466	0.46
467	0.4
468	0.41
469	0.38
470	0.37
471	0.37
472	0.34
473	0.33
474	0.29
475	0.28
476	0.28
477	0.31
478	0.36
479	0.45
480	0.5
481	0.58
482	0.63
483	0.66

A0A4Q4W9H2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer