Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4V2G9

Protein Details
Accession A0A4Q4V2G9    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSRTKRKFQKRKSKAKALDAAEGHydrophilic
46-71GDKIIAKKSKKAEKKRKEQPSGDTEPBasic
74-97TSTQDASPSRKKRKHEDKDAVEDQHydrophilic
104-128TEESSNKPSKKRRKSKTTNTNDAEGHydrophilic
263-282NTGHRRDKIRAKNAKLNEERBasic
288-309AEAQERTAKKQKKQSEGGKDEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-16KRKFQKRKSKAK
51-62AKKSKKAEKKRK
83-87RKKRK
110-119KPSKKRRKSK
266-301HRRDKIRAKNAKLNEERARRAAAEAQERTAKKQKKQ
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSRTKRKFQKRKSKAKALDAAEGDEVTTKPQDILEDDVEMAEATDGDKIIAKKSKKAEKKRKEQPSGDTEPTETSTQDASPSRKKRKHEDKDAVEDQAPKQAATEESSNKPSKKRRKSKTTNTNDAEGANAGADAAEDPDPDATSKKNNRFIVFVGNLPYSATQADIASHFAAVHPTSIRLLHSRADPRKSRGIAFVEFARYDHMKTCLKMLHHSTMRVGAAALDGKQGKGGKGGKGQIGQGEEGTFEERKINVELTAGGGGNTGHRRDKIRAKNAKLNEERARRAAAEAQERTAKKQKKQSEGGKDEGENKEEADIHPSRRGQVPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.93
2 0.92
3 0.89
4 0.82
5 0.79
6 0.69
7 0.61
8 0.5
9 0.41
10 0.31
11 0.24
12 0.2
13 0.14
14 0.14
15 0.12
16 0.11
17 0.12
18 0.14
19 0.14
20 0.19
21 0.18
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.14
27 0.12
28 0.07
29 0.05
30 0.04
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.09
35 0.1
36 0.16
37 0.24
38 0.25
39 0.32
40 0.41
41 0.51
42 0.58
43 0.69
44 0.74
45 0.78
46 0.87
47 0.9
48 0.92
49 0.92
50 0.88
51 0.85
52 0.82
53 0.79
54 0.72
55 0.63
56 0.53
57 0.45
58 0.41
59 0.34
60 0.24
61 0.18
62 0.15
63 0.14
64 0.17
65 0.2
66 0.23
67 0.32
68 0.42
69 0.51
70 0.56
71 0.62
72 0.69
73 0.76
74 0.81
75 0.82
76 0.83
77 0.8
78 0.83
79 0.8
80 0.71
81 0.62
82 0.54
83 0.43
84 0.38
85 0.31
86 0.21
87 0.19
88 0.18
89 0.17
90 0.17
91 0.21
92 0.19
93 0.22
94 0.29
95 0.33
96 0.34
97 0.4
98 0.48
99 0.54
100 0.61
101 0.68
102 0.72
103 0.79
104 0.87
105 0.91
106 0.92
107 0.91
108 0.91
109 0.83
110 0.75
111 0.64
112 0.53
113 0.43
114 0.32
115 0.22
116 0.11
117 0.08
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.15
132 0.22
133 0.29
134 0.37
135 0.4
136 0.41
137 0.41
138 0.41
139 0.4
140 0.34
141 0.28
142 0.23
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.16
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.17
171 0.25
172 0.3
173 0.36
174 0.39
175 0.42
176 0.48
177 0.48
178 0.44
179 0.41
180 0.4
181 0.34
182 0.32
183 0.29
184 0.24
185 0.22
186 0.21
187 0.19
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.22
195 0.22
196 0.23
197 0.27
198 0.3
199 0.33
200 0.33
201 0.34
202 0.31
203 0.31
204 0.3
205 0.25
206 0.2
207 0.12
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.13
215 0.14
216 0.13
217 0.19
218 0.22
219 0.22
220 0.28
221 0.31
222 0.31
223 0.32
224 0.33
225 0.29
226 0.28
227 0.24
228 0.19
229 0.16
230 0.13
231 0.12
232 0.14
233 0.11
234 0.1
235 0.12
236 0.11
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.12
250 0.15
251 0.16
252 0.18
253 0.21
254 0.26
255 0.33
256 0.43
257 0.49
258 0.57
259 0.64
260 0.69
261 0.75
262 0.77
263 0.81
264 0.76
265 0.75
266 0.74
267 0.72
268 0.68
269 0.62
270 0.59
271 0.49
272 0.46
273 0.43
274 0.4
275 0.42
276 0.39
277 0.4
278 0.44
279 0.44
280 0.49
281 0.52
282 0.53
283 0.52
284 0.61
285 0.66
286 0.68
287 0.77
288 0.81
289 0.82
290 0.81
291 0.78
292 0.74
293 0.67
294 0.65
295 0.59
296 0.51
297 0.4
298 0.34
299 0.3
300 0.27
301 0.25
302 0.24
303 0.25
304 0.27
305 0.33
306 0.34
307 0.35