FuNGI

A0A4Q4VC46

Protein Details

Accession

A0A4Q4VC46

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
632-652	TAAAMKKKQKLQKLNPKAWVG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
310-320	GRAQGRGSKRG
422-439	KAKAKRLIRREPRERASR

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_mito 9.5, mito 8.5, nucl 4, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MATVPSTSSVIYKGPKDWDRFKGEFQSRAYALGIWRYIDPDQNNAWPVEPTKPDITSYPKRRLRQVTTRAASSSSEGTIQAEEVDHTGHPTSLLEMTTEGRQAYTQDFATYTYEDRKYENFWKKINDLTKWVLESVSPAIKETSLLPGKNLREWYATLAESGKVYDSRLMNNTQREYRERLKQASKLAKKLDEWIVKWQEIMAQGQRHGVPETKTATTWVNDLCIALAPIMENWTTTFQMVKRAEIDNGTISYQEVAANLLDYWTLTHPPSTSRNIKAAFPTFQGTPAGPSDQGDPDQEETKDTDPPPRGRAQGRGSKRGGRGDQPYKATGYKYDQVVATLIDKFDQFVIEDISATATHAALAAYRRNVNSYTAKPPRIGDGTIWHLRLGHPGPEVIAQLQSHAKGVRLKGPTTVECQACGKAKAKRLIRREPRERASRSGQRIAIDFTDFEEDPEGYRYVMFATDRYSGFIWDIYLKNREQDTLITAFRHLLGVLKNQDKVFPQVFEYDNEILKNHQLRDMLQSPPFSTRLKPSAPHTQAQNGGAERSGGIIKEKATAMRSGAKLPSFLIVYIFKAAVYLYNRTPKYALFWQSPYEVYYTYLAYRDGVAVLDRKPQQAHLRVYGCMAYAMTAAAMKKKQKLQKLNPKAWVGYLVGYRSTNIYEIWNPLINKVIAIRDVQFNEKATFSGDIKDLKDDLLHVTEEELQKLLRQVEIPDQANNHLTSIQKEDEDLSGTIQLPAEQEEWLQRGTSVGGAQSGEEQACLQGTDHPYTTAVFEPFLSPGPSPPPASALITATIIAPTEGIKVTLDSLYPIQHRVTVEDEGTPRVIGVGPPYVPYQEGVIRNEYRVWEAAFNAGRLAPSVSAIYRRHLEAIKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.42
3	0.48
4	0.54
5	0.58
6	0.62
7	0.63
8	0.64
9	0.66
10	0.65
11	0.64
12	0.6
13	0.59
14	0.5
15	0.49
16	0.44
17	0.36
18	0.31
19	0.3
20	0.28
21	0.22
22	0.22
23	0.23
24	0.24
25	0.29
26	0.28
27	0.28
28	0.3
29	0.33
30	0.35
31	0.32
32	0.31
33	0.27
34	0.28
35	0.29
36	0.28
37	0.29
38	0.31
39	0.31
40	0.32
41	0.34
42	0.41
43	0.45
44	0.51
45	0.57
46	0.61
47	0.64
48	0.72
49	0.77
50	0.78
51	0.78
52	0.8
53	0.8
54	0.76
55	0.74
56	0.66
57	0.58
58	0.49
59	0.41
60	0.34
61	0.24
62	0.2
63	0.17
64	0.17
65	0.16
66	0.15
67	0.12
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.1
72	0.09
73	0.1
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.1
82	0.11
83	0.13
84	0.14
85	0.16
86	0.14
87	0.13
88	0.13
89	0.14
90	0.15
91	0.16
92	0.15
93	0.15
94	0.15
95	0.16
96	0.18
97	0.18
98	0.18
99	0.23
100	0.25
101	0.25
102	0.27
103	0.28
104	0.32
105	0.41
106	0.49
107	0.47
108	0.49
109	0.54
110	0.54
111	0.6
112	0.61
113	0.54
114	0.5
115	0.49
116	0.48
117	0.44
118	0.41
119	0.33
120	0.26
121	0.24
122	0.23
123	0.22
124	0.18
125	0.17
126	0.18
127	0.17
128	0.18
129	0.17
130	0.22
131	0.23
132	0.23
133	0.24
134	0.31
135	0.33
136	0.37
137	0.38
138	0.32
139	0.29
140	0.3
141	0.32
142	0.29
143	0.27
144	0.23
145	0.22
146	0.2
147	0.17
148	0.17
149	0.14
150	0.11
151	0.12
152	0.16
153	0.16
154	0.19
155	0.22
156	0.28
157	0.31
158	0.38
159	0.42
160	0.41
161	0.45
162	0.45
163	0.49
164	0.51
165	0.55
166	0.55
167	0.58
168	0.6
169	0.6
170	0.65
171	0.69
172	0.69
173	0.66
174	0.65
175	0.61
176	0.55
177	0.56
178	0.56
179	0.51
180	0.46
181	0.49
182	0.48
183	0.44
184	0.43
185	0.37
186	0.31
187	0.26
188	0.28
189	0.23
190	0.21
191	0.22
192	0.25
193	0.26
194	0.24
195	0.24
196	0.24
197	0.21
198	0.23
199	0.27
200	0.24
201	0.24
202	0.24
203	0.25
204	0.22
205	0.22
206	0.18
207	0.16
208	0.14
209	0.14
210	0.12
211	0.1
212	0.1
213	0.07
214	0.07
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.06
220	0.08
221	0.1
222	0.11
223	0.1
224	0.13
225	0.12
226	0.22
227	0.22
228	0.23
229	0.23
230	0.25
231	0.26
232	0.24
233	0.25
234	0.18
235	0.18
236	0.16
237	0.13
238	0.12
239	0.11
240	0.1
241	0.09
242	0.07
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.06
251	0.06
252	0.08
253	0.08
254	0.1
255	0.1
256	0.14
257	0.19
258	0.25
259	0.3
260	0.31
261	0.37
262	0.37
263	0.39
264	0.4
265	0.4
266	0.34
267	0.3
268	0.29
269	0.23
270	0.23
271	0.22
272	0.17
273	0.15
274	0.15
275	0.14
276	0.12
277	0.13
278	0.14
279	0.14
280	0.15
281	0.14
282	0.14
283	0.15
284	0.17
285	0.17
286	0.15
287	0.16
288	0.16
289	0.2
290	0.19
291	0.24
292	0.28
293	0.31
294	0.33
295	0.35
296	0.38
297	0.36
298	0.43
299	0.44
300	0.47
301	0.5
302	0.54
303	0.53
304	0.55
305	0.56
306	0.56
307	0.51
308	0.48
309	0.51
310	0.5
311	0.51
312	0.48
313	0.45
314	0.4
315	0.39
316	0.34
317	0.28
318	0.27
319	0.26
320	0.23
321	0.24
322	0.22
323	0.21
324	0.2
325	0.18
326	0.14
327	0.11
328	0.1
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.04
346	0.05
347	0.04
348	0.05
349	0.07
350	0.09
351	0.11
352	0.13
353	0.13
354	0.14
355	0.15
356	0.18
357	0.22
358	0.24
359	0.31
360	0.36
361	0.37
362	0.37
363	0.36
364	0.36
365	0.33
366	0.3
367	0.21
368	0.19
369	0.24
370	0.25
371	0.25
372	0.21
373	0.2
374	0.19
375	0.23
376	0.2
377	0.16
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.14
382	0.14
383	0.1
384	0.1
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.13
393	0.14
394	0.2
395	0.21
396	0.21
397	0.24
398	0.26
399	0.26
400	0.27
401	0.31
402	0.24
403	0.23
404	0.23
405	0.22
406	0.21
407	0.22
408	0.22
409	0.22
410	0.28
411	0.34
412	0.41
413	0.46
414	0.52
415	0.6
416	0.66
417	0.72
418	0.74
419	0.75
420	0.75
421	0.76
422	0.71
423	0.66
424	0.64
425	0.61
426	0.57
427	0.54
428	0.49
429	0.41
430	0.39
431	0.35
432	0.27
433	0.2
434	0.15
435	0.11
436	0.12
437	0.11
438	0.1
439	0.1
440	0.09
441	0.09
442	0.11
443	0.1
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.08
449	0.07
450	0.06
451	0.08
452	0.11
453	0.11
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.11
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.12
463	0.15
464	0.14
465	0.17
466	0.17
467	0.17
468	0.15
469	0.15
470	0.15
471	0.16
472	0.16
473	0.14
474	0.14
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.09
479	0.08
480	0.09
481	0.13
482	0.18
483	0.19
484	0.22
485	0.21
486	0.23
487	0.22
488	0.25
489	0.22
490	0.18
491	0.17
492	0.18
493	0.19
494	0.19
495	0.22
496	0.19
497	0.18
498	0.18
499	0.17
500	0.14
501	0.17
502	0.2
503	0.16
504	0.17
505	0.17
506	0.18
507	0.24
508	0.27
509	0.26
510	0.24
511	0.25
512	0.23
513	0.25
514	0.26
515	0.21
516	0.19
517	0.21
518	0.24
519	0.25
520	0.27
521	0.29
522	0.38
523	0.4
524	0.41
525	0.38
526	0.38
527	0.38
528	0.37
529	0.35
530	0.24
531	0.21
532	0.19
533	0.16
534	0.12
535	0.1
536	0.1
537	0.07
538	0.08
539	0.09
540	0.09
541	0.11
542	0.12
543	0.12
544	0.13
545	0.14
546	0.15
547	0.2
548	0.2
549	0.2
550	0.23
551	0.21
552	0.2
553	0.2
554	0.19
555	0.14
556	0.13
557	0.12
558	0.11
559	0.11
560	0.12
561	0.11
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.1
566	0.12
567	0.14
568	0.17
569	0.25
570	0.25
571	0.26
572	0.27
573	0.24
574	0.27
575	0.31
576	0.32
577	0.28
578	0.3
579	0.31
580	0.31
581	0.32
582	0.27
583	0.21
584	0.17
585	0.14
586	0.14
587	0.13
588	0.12
589	0.12
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.1
598	0.11
599	0.17
600	0.19
601	0.2
602	0.21
603	0.26
604	0.32
605	0.38
606	0.41
607	0.42
608	0.42
609	0.4
610	0.41
611	0.36
612	0.28
613	0.21
614	0.16
615	0.09
616	0.07
617	0.07
618	0.05
619	0.06
620	0.07
621	0.1
622	0.15
623	0.18
624	0.24
625	0.32
626	0.38
627	0.46
628	0.57
629	0.64
630	0.71
631	0.78
632	0.8
633	0.8
634	0.77
635	0.68
636	0.57
637	0.49
638	0.39
639	0.31
640	0.25
641	0.19
642	0.18
643	0.17
644	0.17
645	0.15
646	0.15
647	0.13
648	0.11
649	0.13
650	0.14
651	0.16
652	0.18
653	0.21
654	0.21
655	0.2
656	0.24
657	0.2
658	0.19
659	0.18
660	0.17
661	0.14
662	0.16
663	0.17
664	0.18
665	0.2
666	0.23
667	0.23
668	0.24
669	0.24
670	0.23
671	0.21
672	0.18
673	0.19
674	0.17
675	0.17
676	0.17
677	0.19
678	0.2
679	0.22
680	0.2
681	0.18
682	0.18
683	0.16
684	0.16
685	0.14
686	0.14
687	0.11
688	0.13
689	0.18
690	0.18
691	0.18
692	0.16
693	0.14
694	0.15
695	0.18
696	0.18
697	0.14
698	0.14
699	0.16
700	0.23
701	0.3
702	0.3
703	0.29
704	0.29
705	0.3
706	0.32
707	0.3
708	0.23
709	0.19
710	0.19
711	0.19
712	0.22
713	0.22
714	0.19
715	0.19
716	0.2
717	0.18
718	0.2
719	0.18
720	0.14
721	0.15
722	0.15
723	0.15
724	0.14
725	0.13
726	0.11
727	0.13
728	0.13
729	0.11
730	0.11
731	0.13
732	0.15
733	0.15
734	0.14
735	0.12
736	0.12
737	0.12
738	0.13
739	0.1
740	0.09
741	0.1
742	0.1
743	0.1
744	0.11
745	0.13
746	0.11
747	0.1
748	0.1
749	0.09
750	0.09
751	0.09
752	0.08
753	0.12
754	0.16
755	0.19
756	0.2
757	0.2
758	0.2
759	0.2
760	0.22
761	0.2
762	0.17
763	0.15
764	0.15
765	0.15
766	0.16
767	0.17
768	0.17
769	0.14
770	0.15
771	0.2
772	0.23
773	0.23
774	0.23
775	0.23
776	0.24
777	0.26
778	0.25
779	0.21
780	0.19
781	0.18
782	0.18
783	0.15
784	0.13
785	0.11
786	0.09
787	0.07
788	0.06
789	0.08
790	0.08
791	0.09
792	0.09
793	0.09
794	0.11
795	0.12
796	0.12
797	0.12
798	0.13
799	0.17
800	0.19
801	0.21
802	0.2
803	0.23
804	0.23
805	0.24
806	0.26
807	0.25
808	0.24
809	0.27
810	0.27
811	0.26
812	0.26
813	0.23
814	0.19
815	0.16
816	0.16
817	0.12
818	0.14
819	0.16
820	0.16
821	0.18
822	0.19
823	0.19
824	0.19
825	0.19
826	0.19
827	0.21
828	0.25
829	0.27
830	0.33
831	0.33
832	0.34
833	0.37
834	0.35
835	0.32
836	0.29
837	0.28
838	0.23
839	0.22
840	0.28
841	0.27
842	0.26
843	0.24
844	0.22
845	0.2
846	0.19
847	0.2
848	0.13
849	0.12
850	0.15
851	0.15
852	0.22
853	0.24
854	0.28
855	0.29
856	0.31
857	0.34

A0A4Q4VC46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer