Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G9NDB7

Protein Details
Accession G9NDB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
499-518LVAVPKRRRNEVRPIRPPSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
492-524RPPRKLALVAVPKRRRNEVRPIRPPSSSGRRRG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024662  Trs65  
Gene Ontology GO:1990071  C:TRAPPII protein complex  
GO:0006891  P:intra-Golgi vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF12735  Trs65  
Amino Acid Sequences SVMSDRNPSTPGQLPPVQLTISTTNAATDLINNSYLTYLVPAETNIDLEKALEGFDGSKTISELIEQRDTLFFDETVDVLLVLKTPWLPRKELDYHLSRISISLEAQVANGALPGRDSPNSSESIFSGRLKETKKPFIIEDKREDGSDVEDEEEEEEPPRYVYAMWKLPVLLVRPRMRLHSPAVVFSASASLDPDLWTEPVAPDVGYLTSGMPSGFNLLESFNNDFALNGVKPRLSALRVSRVAPVTRQQDFMTRLRTLPQLSIKVFPVLHTRIRFSRPNTIPLSRSIVALLEIDFTSHFECEALLNSIRLSSPNGTVENLNDEAGLSLPLSCVSHDHITLLYHIKPQQTETTLPRDTSGSLEISIAASVLVVPGVCTPSLTMSWTTALDFSLPVNPSFGTASESGIQRAHRPTQLSIGSVAQVITHLKSPSAIRPDSLPTLEASTNRTEASIPDLGITMSFTAPSTPVHPGDIFSWTVYVVNRSSDKANSRPPRKLALVAVPKRRRNEVRPIRPPSSSGRRRGDKEIADAVLDENVIHALQKSATLETTELICLSADTRVGPVAPGACHVVELQFLALGEGVVGLEAIRVVDLGSQEHVDIGDLPTMIVEPLAAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.41
4 0.35
5 0.29
6 0.3
7 0.26
8 0.24
9 0.23
10 0.19
11 0.17
12 0.17
13 0.18
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.15
51 0.19
52 0.23
53 0.23
54 0.24
55 0.24
56 0.26
57 0.25
58 0.23
59 0.18
60 0.16
61 0.16
62 0.15
63 0.14
64 0.12
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.07
69 0.06
70 0.07
71 0.09
72 0.14
73 0.22
74 0.24
75 0.27
76 0.29
77 0.37
78 0.42
79 0.45
80 0.46
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.36
86 0.31
87 0.27
88 0.22
89 0.17
90 0.15
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.11
103 0.12
104 0.14
105 0.17
106 0.19
107 0.22
108 0.22
109 0.21
110 0.19
111 0.22
112 0.23
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.27
117 0.29
118 0.36
119 0.39
120 0.46
121 0.48
122 0.47
123 0.48
124 0.54
125 0.6
126 0.59
127 0.58
128 0.54
129 0.51
130 0.49
131 0.46
132 0.35
133 0.29
134 0.23
135 0.17
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.12
150 0.17
151 0.21
152 0.22
153 0.22
154 0.22
155 0.23
156 0.25
157 0.24
158 0.23
159 0.26
160 0.3
161 0.34
162 0.35
163 0.39
164 0.39
165 0.4
166 0.38
167 0.38
168 0.34
169 0.31
170 0.32
171 0.27
172 0.24
173 0.2
174 0.17
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.11
208 0.13
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.11
223 0.16
224 0.19
225 0.27
226 0.29
227 0.3
228 0.32
229 0.32
230 0.32
231 0.28
232 0.31
233 0.28
234 0.28
235 0.28
236 0.25
237 0.28
238 0.32
239 0.33
240 0.31
241 0.27
242 0.26
243 0.26
244 0.28
245 0.24
246 0.23
247 0.25
248 0.24
249 0.25
250 0.26
251 0.25
252 0.25
253 0.23
254 0.21
255 0.22
256 0.21
257 0.24
258 0.23
259 0.25
260 0.26
261 0.31
262 0.35
263 0.32
264 0.4
265 0.37
266 0.42
267 0.44
268 0.43
269 0.39
270 0.37
271 0.4
272 0.3
273 0.28
274 0.22
275 0.17
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.11
330 0.13
331 0.16
332 0.17
333 0.17
334 0.18
335 0.2
336 0.2
337 0.23
338 0.23
339 0.28
340 0.27
341 0.27
342 0.26
343 0.23
344 0.21
345 0.19
346 0.17
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.06
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.02
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.11
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.16
394 0.16
395 0.17
396 0.21
397 0.23
398 0.24
399 0.26
400 0.26
401 0.3
402 0.31
403 0.28
404 0.25
405 0.22
406 0.19
407 0.17
408 0.16
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.12
417 0.14
418 0.19
419 0.24
420 0.24
421 0.21
422 0.24
423 0.28
424 0.28
425 0.27
426 0.22
427 0.16
428 0.19
429 0.2
430 0.19
431 0.18
432 0.17
433 0.18
434 0.17
435 0.17
436 0.14
437 0.13
438 0.17
439 0.16
440 0.14
441 0.13
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.12
446 0.08
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.08
453 0.1
454 0.13
455 0.14
456 0.16
457 0.16
458 0.17
459 0.18
460 0.2
461 0.18
462 0.14
463 0.13
464 0.11
465 0.13
466 0.12
467 0.13
468 0.11
469 0.14
470 0.16
471 0.17
472 0.2
473 0.23
474 0.28
475 0.32
476 0.42
477 0.48
478 0.54
479 0.6
480 0.61
481 0.63
482 0.6
483 0.58
484 0.52
485 0.52
486 0.55
487 0.56
488 0.63
489 0.65
490 0.68
491 0.67
492 0.72
493 0.7
494 0.66
495 0.7
496 0.7
497 0.72
498 0.77
499 0.81
500 0.76
501 0.7
502 0.66
503 0.64
504 0.64
505 0.61
506 0.6
507 0.62
508 0.66
509 0.69
510 0.74
511 0.73
512 0.65
513 0.63
514 0.58
515 0.49
516 0.41
517 0.37
518 0.3
519 0.22
520 0.18
521 0.12
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.09
530 0.11
531 0.12
532 0.12
533 0.13
534 0.14
535 0.13
536 0.15
537 0.13
538 0.12
539 0.11
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.09
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.15
555 0.14
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.11
560 0.12
561 0.1
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.07
566 0.07
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.04
576 0.03
577 0.04
578 0.04
579 0.06
580 0.07
581 0.09
582 0.1
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.12
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.11
595 0.1
596 0.08
597 0.07