Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4WN90

Protein Details
Accession A0A4Q4WN90    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-337SVRPSLLRKLPRFRDSRRRPETSLRVPVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-260RDRGRSRIYKGDGGGGEGERGGSGDKRKRAAEGGD
265-273PIKPAKRER
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 10, mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR017340  U1_snRNP-C  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000395  P:mRNA 5'-splice site recognition  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MPKFFCDYCDVYLTHDSMSVRKAHNSGRNHLRNVVDYYQQIGHEKAQSVIDSITSSYAAEGQAHANPMLPQNQPQNIGPPPHLHHLPPPGAGVGGGPPGGPGGAFPPPPPFSFPAGMPPPPFPGMPGAPPPPGGFPAGMPPPPGQAGRGGLPPPPFPPGPGGLPPPGGLPFPPPAGMPFPPPGAPGAPPFPSFPGMPGAPPAGFPAGPSPPGAAALRAGDSLPRDRDRGRSRIYKGDGGGGEGERGGSGDKRKRAAEGGDPDLEPIKPAKRERRQQGLLLRSAAAAADWLVWLSYVSATTQGLKPRSDSVRPSLLRKLPRFRDSRRRPETSLRVPVLAGKAFRGYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.23
4 0.22
5 0.25
6 0.26
7 0.25
8 0.28
9 0.32
10 0.37
11 0.45
12 0.48
13 0.54
14 0.59
15 0.65
16 0.64
17 0.65
18 0.59
19 0.56
20 0.56
21 0.5
22 0.43
23 0.36
24 0.36
25 0.33
26 0.32
27 0.3
28 0.25
29 0.25
30 0.25
31 0.26
32 0.24
33 0.23
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.17
38 0.13
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.14
51 0.13
52 0.13
53 0.14
54 0.16
55 0.2
56 0.19
57 0.22
58 0.27
59 0.3
60 0.32
61 0.31
62 0.34
63 0.33
64 0.35
65 0.32
66 0.3
67 0.31
68 0.33
69 0.35
70 0.3
71 0.32
72 0.36
73 0.36
74 0.32
75 0.29
76 0.23
77 0.21
78 0.2
79 0.15
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.06
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.22
97 0.22
98 0.23
99 0.25
100 0.24
101 0.27
102 0.28
103 0.3
104 0.28
105 0.26
106 0.25
107 0.25
108 0.24
109 0.17
110 0.18
111 0.17
112 0.17
113 0.2
114 0.2
115 0.19
116 0.2
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.12
122 0.1
123 0.13
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.16
130 0.15
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.18
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.11
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.14
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.11
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.13
209 0.17
210 0.18
211 0.2
212 0.21
213 0.31
214 0.36
215 0.41
216 0.44
217 0.48
218 0.5
219 0.56
220 0.59
221 0.53
222 0.48
223 0.46
224 0.39
225 0.32
226 0.3
227 0.21
228 0.17
229 0.13
230 0.12
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.16
236 0.22
237 0.27
238 0.31
239 0.32
240 0.34
241 0.36
242 0.37
243 0.38
244 0.37
245 0.38
246 0.36
247 0.35
248 0.34
249 0.32
250 0.28
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.22
255 0.3
256 0.4
257 0.49
258 0.59
259 0.67
260 0.75
261 0.74
262 0.75
263 0.76
264 0.72
265 0.66
266 0.58
267 0.49
268 0.38
269 0.34
270 0.26
271 0.17
272 0.1
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.12
287 0.15
288 0.21
289 0.24
290 0.25
291 0.27
292 0.33
293 0.39
294 0.42
295 0.43
296 0.43
297 0.5
298 0.51
299 0.54
300 0.56
301 0.57
302 0.61
303 0.64
304 0.68
305 0.67
306 0.74
307 0.77
308 0.77
309 0.81
310 0.83
311 0.85
312 0.84
313 0.82
314 0.79
315 0.82
316 0.83
317 0.81
318 0.8
319 0.72
320 0.64
321 0.57
322 0.55
323 0.5
324 0.43
325 0.34
326 0.26