Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4WBM5

Protein Details
Accession A0A4Q4WBM5    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-152LVPQAEERKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
278-302VPDENKTPKPKSTRKRKSTAADAEEHydrophilic
307-334AAKTATPASPDKKRKRQSKVAETPIEEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-142RKERKKRQH
285-295PKPKSTRKRKS
315-344SPDKKRKRQSKVAETPIEEPKKSSRKKKSN
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MARPKKTDAARQPQPAPIPPAMAPMPVQQPLQMAPQQPQLAPVAPPPGPMPVAPTRTVDVEQFIRVRDSVHTRFATILGLMKNFSDDFLRQTNLLIGEPTPFDNGGGPPLSAMIAGLDGIANQLNDLVPQAEERKERKKRQHDPNAPKRPLTPYFLYMQTARPIIANDLGPDAPKGAVQEEGQRRWAAMTPSEKTAWNNAYQFNLRLYNARVQSYKAGNAEARNMTDSEALAYADANGIPQPVLSGEEVIPPPNEQDAIAEQLTLASAPPAPPTPVAVPDENKTPKPKSTRKRKSTAADAEEGEASAAKTATPASPDKKRKRQSKVAETPIEEPKKSSRKKKSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.64
3 0.6
4 0.5
5 0.45
6 0.37
7 0.39
8 0.33
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.27
13 0.26
14 0.26
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.27
19 0.26
20 0.24
21 0.25
22 0.32
23 0.33
24 0.31
25 0.31
26 0.28
27 0.26
28 0.25
29 0.24
30 0.23
31 0.2
32 0.21
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.18
37 0.22
38 0.23
39 0.27
40 0.28
41 0.29
42 0.28
43 0.3
44 0.31
45 0.26
46 0.23
47 0.21
48 0.23
49 0.22
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.2
55 0.27
56 0.27
57 0.32
58 0.32
59 0.31
60 0.32
61 0.31
62 0.27
63 0.19
64 0.2
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.14
75 0.17
76 0.18
77 0.16
78 0.17
79 0.19
80 0.17
81 0.17
82 0.13
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.07
99 0.06
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.06
117 0.08
118 0.12
119 0.17
120 0.22
121 0.32
122 0.41
123 0.5
124 0.59
125 0.68
126 0.75
127 0.81
128 0.88
129 0.88
130 0.9
131 0.92
132 0.92
133 0.83
134 0.74
135 0.65
136 0.6
137 0.52
138 0.47
139 0.38
140 0.29
141 0.3
142 0.3
143 0.29
144 0.23
145 0.22
146 0.19
147 0.16
148 0.14
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.07
165 0.07
166 0.15
167 0.19
168 0.2
169 0.22
170 0.21
171 0.21
172 0.2
173 0.23
174 0.16
175 0.16
176 0.19
177 0.19
178 0.22
179 0.23
180 0.23
181 0.21
182 0.25
183 0.22
184 0.21
185 0.22
186 0.2
187 0.22
188 0.22
189 0.23
190 0.2
191 0.2
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.22
196 0.23
197 0.25
198 0.23
199 0.22
200 0.27
201 0.27
202 0.28
203 0.22
204 0.22
205 0.22
206 0.22
207 0.25
208 0.21
209 0.2
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.14
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.12
242 0.08
243 0.1
244 0.11
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.09
252 0.07
253 0.04
254 0.05
255 0.06
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.14
261 0.16
262 0.19
263 0.22
264 0.23
265 0.25
266 0.25
267 0.34
268 0.35
269 0.37
270 0.4
271 0.4
272 0.44
273 0.52
274 0.6
275 0.62
276 0.7
277 0.77
278 0.8
279 0.85
280 0.87
281 0.85
282 0.85
283 0.84
284 0.78
285 0.71
286 0.63
287 0.56
288 0.47
289 0.39
290 0.28
291 0.19
292 0.13
293 0.1
294 0.08
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.13
300 0.19
301 0.25
302 0.36
303 0.47
304 0.57
305 0.67
306 0.75
307 0.82
308 0.86
309 0.89
310 0.9
311 0.91
312 0.91
313 0.9
314 0.88
315 0.81
316 0.76
317 0.76
318 0.71
319 0.6
320 0.52
321 0.52
322 0.55
323 0.61
324 0.66