Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Q4WCJ1

Protein Details
Accession A0A4Q4WCJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
493-517EGAPATKRPRGRPRKDRLENAQAPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-509KKSEKKSSKKRGAAVISEGAPATKRPRGRPRKDR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 7, pero 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGITGAWEQVRKVTPGKEVTLAQLAAECVREKGRPLRIAIDTPFAVFQYNEATRPVASYGKCIPNRLIHQCQPHVLRAGVQPLFIYDGQGKPPVKRHRYHRYSENYAPYEPPAASSLRTPADVEREYDPQHVTYLSKQILDLLGIPWYIAPGEAEAECARLEEAGTVDAVLTKDGDAFVFGSNTILQRLDAENKVAMVRRFRMRDLRDARPPLRQQDLFLLALMAGGDYHDGIPGCGTVVAIEAARAGYSGELRALLLARGPTKVWRDKLVSELRTNDRGRFSRRWAAVANAIPENFPLPTIANYYLKPAVSSREKAEEYGRSVNWHKETDARGLREWTAKYLDWKYAYHACKFVNNLTPALLARKLMIHSETGVDGSYLIKAIHGVKPMNKHAEDAGNNNNDENSDDTASQLRVSYYPATVINIDVSGEQIVSGYKANMEKLFDPQKDEREWFPRWMLEKGAPTAFREWQDESAKKSEKKSSKKRGAAVISEGAPATKRPRGRPRKDRLENAQAPAAPQGNRTRSRVAASNAPSPALNRSHRVNRDQSGLGAVLTPPAKPATTTGPLSRSTSPDLPELSVLFGSPRVGHAESSNATPGHGRSWNALAEGNVNSCRSNATKLPDPRHSSHNNTSPPKSGLCVGRNSDAYRPQSGSADVIDLTSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.4
3 0.43
4 0.41
5 0.39
6 0.4
7 0.4
8 0.36
9 0.28
10 0.25
11 0.22
12 0.19
13 0.2
14 0.17
15 0.14
16 0.17
17 0.18
18 0.22
19 0.3
20 0.38
21 0.41
22 0.44
23 0.48
24 0.5
25 0.54
26 0.51
27 0.48
28 0.39
29 0.35
30 0.33
31 0.26
32 0.23
33 0.17
34 0.15
35 0.18
36 0.19
37 0.19
38 0.2
39 0.21
40 0.19
41 0.21
42 0.23
43 0.21
44 0.2
45 0.24
46 0.3
47 0.39
48 0.41
49 0.43
50 0.45
51 0.47
52 0.55
53 0.59
54 0.59
55 0.56
56 0.62
57 0.63
58 0.66
59 0.61
60 0.57
61 0.52
62 0.43
63 0.41
64 0.35
65 0.4
66 0.33
67 0.29
68 0.25
69 0.22
70 0.25
71 0.21
72 0.21
73 0.16
74 0.17
75 0.19
76 0.27
77 0.28
78 0.28
79 0.37
80 0.46
81 0.51
82 0.56
83 0.64
84 0.68
85 0.75
86 0.78
87 0.79
88 0.77
89 0.78
90 0.78
91 0.77
92 0.69
93 0.63
94 0.57
95 0.48
96 0.42
97 0.33
98 0.27
99 0.19
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.19
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.25
109 0.25
110 0.26
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.3
115 0.29
116 0.23
117 0.23
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.24
122 0.22
123 0.21
124 0.2
125 0.21
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.05
138 0.04
139 0.06
140 0.06
141 0.09
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.2
183 0.2
184 0.2
185 0.24
186 0.29
187 0.32
188 0.35
189 0.42
190 0.42
191 0.5
192 0.52
193 0.54
194 0.56
195 0.61
196 0.6
197 0.59
198 0.6
199 0.55
200 0.56
201 0.49
202 0.42
203 0.4
204 0.41
205 0.32
206 0.28
207 0.23
208 0.15
209 0.15
210 0.13
211 0.07
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.03
226 0.04
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.13
250 0.19
251 0.25
252 0.25
253 0.28
254 0.31
255 0.31
256 0.38
257 0.42
258 0.39
259 0.36
260 0.39
261 0.38
262 0.43
263 0.43
264 0.38
265 0.36
266 0.37
267 0.41
268 0.4
269 0.43
270 0.43
271 0.43
272 0.43
273 0.38
274 0.36
275 0.35
276 0.32
277 0.29
278 0.21
279 0.21
280 0.18
281 0.17
282 0.15
283 0.1
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.09
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.16
298 0.19
299 0.21
300 0.2
301 0.24
302 0.24
303 0.25
304 0.27
305 0.25
306 0.24
307 0.26
308 0.24
309 0.22
310 0.24
311 0.27
312 0.27
313 0.25
314 0.22
315 0.22
316 0.24
317 0.29
318 0.31
319 0.29
320 0.27
321 0.28
322 0.29
323 0.28
324 0.26
325 0.2
326 0.18
327 0.17
328 0.21
329 0.21
330 0.23
331 0.21
332 0.21
333 0.22
334 0.28
335 0.3
336 0.27
337 0.28
338 0.26
339 0.26
340 0.28
341 0.27
342 0.26
343 0.25
344 0.23
345 0.21
346 0.21
347 0.18
348 0.19
349 0.16
350 0.09
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.06
370 0.08
371 0.1
372 0.13
373 0.15
374 0.17
375 0.23
376 0.27
377 0.31
378 0.29
379 0.27
380 0.26
381 0.3
382 0.29
383 0.27
384 0.3
385 0.27
386 0.27
387 0.26
388 0.24
389 0.18
390 0.18
391 0.16
392 0.12
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.08
412 0.08
413 0.06
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.07
424 0.08
425 0.1
426 0.11
427 0.13
428 0.13
429 0.2
430 0.27
431 0.26
432 0.31
433 0.33
434 0.36
435 0.38
436 0.39
437 0.38
438 0.36
439 0.38
440 0.36
441 0.34
442 0.34
443 0.33
444 0.32
445 0.3
446 0.28
447 0.28
448 0.28
449 0.29
450 0.26
451 0.25
452 0.27
453 0.27
454 0.25
455 0.25
456 0.25
457 0.27
458 0.33
459 0.34
460 0.35
461 0.39
462 0.44
463 0.44
464 0.47
465 0.51
466 0.53
467 0.62
468 0.69
469 0.72
470 0.76
471 0.79
472 0.8
473 0.79
474 0.75
475 0.67
476 0.6
477 0.53
478 0.43
479 0.37
480 0.31
481 0.23
482 0.18
483 0.17
484 0.17
485 0.19
486 0.23
487 0.32
488 0.43
489 0.54
490 0.65
491 0.73
492 0.8
493 0.86
494 0.89
495 0.89
496 0.87
497 0.87
498 0.81
499 0.73
500 0.67
501 0.55
502 0.47
503 0.41
504 0.36
505 0.26
506 0.25
507 0.29
508 0.33
509 0.37
510 0.4
511 0.41
512 0.4
513 0.43
514 0.44
515 0.4
516 0.4
517 0.4
518 0.43
519 0.39
520 0.38
521 0.34
522 0.3
523 0.31
524 0.3
525 0.29
526 0.27
527 0.33
528 0.42
529 0.48
530 0.54
531 0.56
532 0.53
533 0.55
534 0.52
535 0.46
536 0.39
537 0.33
538 0.26
539 0.2
540 0.16
541 0.14
542 0.14
543 0.13
544 0.11
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.15
549 0.18
550 0.23
551 0.26
552 0.29
553 0.31
554 0.33
555 0.37
556 0.37
557 0.33
558 0.34
559 0.35
560 0.33
561 0.33
562 0.33
563 0.3
564 0.29
565 0.26
566 0.21
567 0.17
568 0.15
569 0.12
570 0.11
571 0.11
572 0.1
573 0.11
574 0.14
575 0.15
576 0.16
577 0.16
578 0.21
579 0.21
580 0.23
581 0.26
582 0.21
583 0.21
584 0.22
585 0.22
586 0.22
587 0.25
588 0.23
589 0.23
590 0.26
591 0.27
592 0.26
593 0.27
594 0.21
595 0.21
596 0.21
597 0.22
598 0.21
599 0.2
600 0.19
601 0.18
602 0.21
603 0.2
604 0.24
605 0.26
606 0.3
607 0.39
608 0.47
609 0.55
610 0.61
611 0.66
612 0.64
613 0.68
614 0.68
615 0.68
616 0.68
617 0.7
618 0.7
619 0.7
620 0.7
621 0.67
622 0.63
623 0.56
624 0.48
625 0.46
626 0.44
627 0.42
628 0.45
629 0.44
630 0.47
631 0.49
632 0.5
633 0.5
634 0.49
635 0.49
636 0.47
637 0.45
638 0.41
639 0.39
640 0.38
641 0.33
642 0.26
643 0.24
644 0.19