Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R2N3

Protein Details
Accession C4R2N3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-63VYSASRYKKFLKQIIRNSKLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0009383  F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0167  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MNLYREAEQFIEHNPKSGSLQNRIFDASRNKKIKNNPKHVYALVYSASRYKKFLKQIIRNSKLLEDKKIRAKEPLLILMAHDLLFSKNGRIQSGKHPLKDAFLAHKTRLQAELTKLKIKYKVKDLEELIEDDDTPVRWVRANLLKTSREKFLNEFKHLIQVESFQELEVGKIYHDQYIPNLFGVHPREKITSTDAYLKGRLIIQDRASCFPAHILHPSPGDKIIDTCSAPGNKTTHLASYLGNRPDSIIAFEKDPKRAEVLKTLCAKAGGLSCIDIQVGDFTATNPEDYTDIDGFVIDPSCSGSGIFGRAFEENEQDETYDDTRLSKLASFQFTIVRHAMMFPNAKKLTYSTCSVHPQENERVVVDLLKDSQVQAKGWKLCTRDEVIPDWNRRGFEEEFSTFENPKELAEGCIRSKPKEDGGIGFFVVAFKRDIGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.33
4 0.38
5 0.4
6 0.39
7 0.46
8 0.43
9 0.45
10 0.47
11 0.44
12 0.44
13 0.48
14 0.49
15 0.52
16 0.57
17 0.59
18 0.63
19 0.73
20 0.77
21 0.77
22 0.78
23 0.75
24 0.74
25 0.77
26 0.71
27 0.65
28 0.55
29 0.48
30 0.39
31 0.34
32 0.28
33 0.28
34 0.32
35 0.29
36 0.31
37 0.33
38 0.38
39 0.46
40 0.54
41 0.58
42 0.63
43 0.73
44 0.8
45 0.8
46 0.75
47 0.68
48 0.66
49 0.64
50 0.58
51 0.57
52 0.53
53 0.54
54 0.61
55 0.65
56 0.6
57 0.57
58 0.56
59 0.53
60 0.5
61 0.48
62 0.4
63 0.34
64 0.33
65 0.28
66 0.26
67 0.2
68 0.15
69 0.1
70 0.09
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.14
75 0.16
76 0.19
77 0.21
78 0.23
79 0.31
80 0.42
81 0.45
82 0.44
83 0.46
84 0.45
85 0.45
86 0.45
87 0.38
88 0.34
89 0.35
90 0.37
91 0.34
92 0.37
93 0.36
94 0.35
95 0.34
96 0.29
97 0.26
98 0.3
99 0.36
100 0.36
101 0.41
102 0.4
103 0.42
104 0.48
105 0.49
106 0.48
107 0.5
108 0.55
109 0.51
110 0.57
111 0.54
112 0.5
113 0.46
114 0.41
115 0.33
116 0.24
117 0.21
118 0.15
119 0.14
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.16
127 0.23
128 0.25
129 0.29
130 0.34
131 0.38
132 0.42
133 0.45
134 0.43
135 0.38
136 0.37
137 0.37
138 0.41
139 0.43
140 0.42
141 0.42
142 0.38
143 0.43
144 0.41
145 0.37
146 0.28
147 0.23
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.09
159 0.1
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.17
165 0.17
166 0.14
167 0.14
168 0.11
169 0.15
170 0.2
171 0.21
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.23
176 0.24
177 0.24
178 0.21
179 0.2
180 0.25
181 0.25
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.15
189 0.17
190 0.18
191 0.21
192 0.23
193 0.24
194 0.24
195 0.22
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.13
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.16
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.12
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.14
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.12
226 0.16
227 0.22
228 0.22
229 0.22
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.17
235 0.13
236 0.12
237 0.14
238 0.2
239 0.22
240 0.24
241 0.25
242 0.23
243 0.24
244 0.27
245 0.27
246 0.3
247 0.3
248 0.33
249 0.36
250 0.36
251 0.33
252 0.29
253 0.27
254 0.21
255 0.2
256 0.14
257 0.1
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.13
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.15
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.14
305 0.15
306 0.15
307 0.13
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.15
315 0.19
316 0.22
317 0.22
318 0.23
319 0.27
320 0.27
321 0.3
322 0.26
323 0.21
324 0.18
325 0.19
326 0.2
327 0.19
328 0.25
329 0.22
330 0.31
331 0.31
332 0.31
333 0.3
334 0.3
335 0.32
336 0.29
337 0.33
338 0.26
339 0.31
340 0.37
341 0.39
342 0.43
343 0.4
344 0.42
345 0.46
346 0.47
347 0.43
348 0.37
349 0.36
350 0.3
351 0.28
352 0.23
353 0.17
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.23
362 0.29
363 0.32
364 0.37
365 0.41
366 0.38
367 0.39
368 0.44
369 0.44
370 0.42
371 0.4
372 0.39
373 0.43
374 0.49
375 0.5
376 0.51
377 0.49
378 0.45
379 0.43
380 0.44
381 0.38
382 0.35
383 0.37
384 0.32
385 0.32
386 0.34
387 0.36
388 0.32
389 0.3
390 0.28
391 0.21
392 0.2
393 0.2
394 0.17
395 0.17
396 0.22
397 0.26
398 0.26
399 0.34
400 0.37
401 0.37
402 0.41
403 0.43
404 0.43
405 0.46
406 0.46
407 0.44
408 0.45
409 0.45
410 0.4
411 0.35
412 0.28
413 0.22
414 0.2
415 0.15
416 0.13